MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O111:H- str. 11128

Total Repeats: 3502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013364	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	260866155
2	NC_013364	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	260866156
3	NC_013364	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	260866161
4	NC_013364	CGTAC	2	10	9788	9797	20 %	20 %	20 %	40 %	260866162
5	NC_013364	CGCGC	2	10	10775	10784	0 %	0 %	40 %	60 %	260866164
6	NC_013364	CCGAT	2	10	16477	16486	20 %	20 %	20 %	40 %	260866170
7	NC_013364	AGCGA	2	10	16865	16874	40 %	0 %	40 %	20 %	260866170
8	NC_013364	GTTTT	2	10	19282	19291	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013364	ATTGC	2	10	21668	21677	20 %	40 %	20 %	20 %	260866172
10	NC_013364	TTAAT	2	10	22303	22312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013364	CAGTA	2	10	28579	28588	40 %	20 %	20 %	20 %	260866179
12	NC_013364	ATTTA	2	10	31136	31145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013364	GCGAA	2	10	34374	34383	40 %	0 %	40 %	20 %	260866183
14	NC_013364	CCGTT	2	10	35268	35277	0 %	40 %	20 %	40 %	260866183
15	NC_013364	CACGG	2	10	35645	35654	20 %	0 %	40 %	40 %	260866183
16	NC_013364	CGAAT	2	10	38354	38363	40 %	20 %	20 %	20 %	260866188
17	NC_013364	CCATG	2	10	39892	39901	20 %	20 %	20 %	40 %	260866189
18	NC_013364	CCGTA	2	10	41538	41547	20 %	20 %	20 %	40 %	260866190
19	NC_013364	TTAAA	2	10	42276	42285	60 %	40 %	0 %	0 %	260866190
20	NC_013364	ACCCA	2	10	43019	43028	40 %	0 %	0 %	60 %	260866191
21	NC_013364	TTTGA	2	10	44646	44655	20 %	60 %	20 %	0 %	260866192
22	NC_013364	CGGCG	2	10	44897	44906	0 %	0 %	60 %	40 %	260866192
23	NC_013364	AATCA	2	10	45179	45188	60 %	20 %	0 %	20 %	260866193
24	NC_013364	CGGTT	2	10	46134	46143	0 %	40 %	40 %	20 %	260866194
25	NC_013364	TGGCG	2	10	47826	47835	0 %	20 %	60 %	20 %	260866196
26	NC_013364	TGCAC	2	10	49588	49597	20 %	20 %	20 %	40 %	260866197
27	NC_013364	AGGGC	2	10	50673	50682	20 %	0 %	60 %	20 %	260866198
28	NC_013364	GGCGC	2	10	50707	50716	0 %	0 %	60 %	40 %	260866198
29	NC_013364	GAAAC	2	10	51520	51529	60 %	0 %	20 %	20 %	260866198
30	NC_013364	ACATC	2	10	52514	52523	40 %	20 %	0 %	40 %	260866201
31	NC_013364	ACAGA	2	10	52811	52820	60 %	0 %	20 %	20 %	260866201
32	NC_013364	AACGT	2	10	54786	54795	40 %	20 %	20 %	20 %	260866204
33	NC_013364	GCGTC	2	10	57770	57779	0 %	20 %	40 %	40 %	260866207
34	NC_013364	ATGTT	2	10	58584	58593	20 %	60 %	20 %	0 %	260866208
35	NC_013364	CTTCG	2	10	59017	59026	0 %	40 %	20 %	40 %	260866208
36	NC_013364	TGCGT	2	10	59303	59312	0 %	40 %	40 %	20 %	260866208
37	NC_013364	AAAGT	2	10	65037	65046	60 %	20 %	20 %	0 %	260866211
38	NC_013364	AGTCG	2	10	66006	66015	20 %	20 %	40 %	20 %	260866212
39	NC_013364	GGTGA	2	10	67285	67294	20 %	20 %	60 %	0 %	260866212
40	NC_013364	TCGCG	2	10	69892	69901	0 %	20 %	40 %	40 %	260866214
41	NC_013364	TAGTG	2	10	77370	77379	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013364	TTGCT	2	10	77522	77531	0 %	60 %	20 %	20 %	260866221
43	NC_013364	GATGG	2	10	78258	78267	20 %	20 %	60 %	0 %	260866221
44	NC_013364	ATTTT	2	10	79086	79095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013364	CTGGA	2	10	80158	80167	20 %	20 %	40 %	20 %	260866223
46	NC_013364	CCTGG	2	10	81732	81741	0 %	20 %	40 %	40 %	260866225
47	NC_013364	CTGGT	2	10	83451	83460	0 %	40 %	40 %	20 %	260866226
48	NC_013364	GACCG	2	10	83999	84008	20 %	0 %	40 %	40 %	260866227
49	NC_013364	ATGTT	2	10	86547	86556	20 %	60 %	20 %	0 %	260866229
50	NC_013364	TGCAT	2	10	87489	87498	20 %	40 %	20 %	20 %	260866230
51	NC_013364	ATTCC	2	10	87659	87668	20 %	40 %	0 %	40 %	260866230
52	NC_013364	AGTTC	2	10	92752	92761	20 %	40 %	20 %	20 %	260866235
53	NC_013364	CGTGG	2	10	94125	94134	0 %	20 %	60 %	20 %	260866237
54	NC_013364	TATCG	2	10	94632	94641	20 %	40 %	20 %	20 %	260866237
55	NC_013364	GCCTG	2	10	98964	98973	0 %	20 %	40 %	40 %	260866241
56	NC_013364	GTTTG	2	10	99408	99417	0 %	60 %	40 %	0 %	260866241
57	NC_013364	ACCGT	2	10	100877	100886	20 %	20 %	20 %	40 %	260866242
58	NC_013364	ATCAG	2	10	102650	102659	40 %	20 %	20 %	20 %	260866244
59	NC_013364	AGCCG	2	10	104418	104427	20 %	0 %	40 %	40 %	260866245
60	NC_013364	GCGCA	2	10	106746	106755	20 %	0 %	40 %	40 %	260866247
61	NC_013364	TGGCG	2	10	107740	107749	0 %	20 %	60 %	20 %	260866248
62	NC_013364	CCGGC	2	10	110710	110719	0 %	0 %	40 %	60 %	260866251
63	NC_013364	CGCGG	2	10	113920	113929	0 %	0 %	60 %	40 %	260866254
64	NC_013364	ATCCC	2	10	116164	116173	20 %	20 %	0 %	60 %	260866257
65	NC_013364	CATCG	2	10	116177	116186	20 %	20 %	20 %	40 %	260866257
66	NC_013364	TAACG	2	10	116871	116880	40 %	20 %	20 %	20 %	260866257
67	NC_013364	ATGCC	2	10	117330	117339	20 %	20 %	20 %	40 %	260866257
68	NC_013364	AATGC	2	10	118613	118622	40 %	20 %	20 %	20 %	260866258
69	NC_013364	TCTGT	2	10	119559	119568	0 %	60 %	20 %	20 %	260866260
70	NC_013364	GCATG	2	10	120652	120661	20 %	20 %	40 %	20 %	260866261
71	NC_013364	AGCAG	2	10	121990	121999	40 %	0 %	40 %	20 %	260866263
72	NC_013364	TCAGC	2	10	122858	122867	20 %	20 %	20 %	40 %	260866263
73	NC_013364	CGAAG	2	10	123905	123914	40 %	0 %	40 %	20 %	260866264
74	NC_013364	ACACG	2	10	124038	124047	40 %	0 %	20 %	40 %	260866264
75	NC_013364	TCGCG	2	10	124299	124308	0 %	20 %	40 %	40 %	260866264
76	NC_013364	GCATC	2	10	124389	124398	20 %	20 %	20 %	40 %	260866264
77	NC_013364	GACTG	2	10	125707	125716	20 %	20 %	40 %	20 %	260866265
78	NC_013364	AGAGC	2	10	126117	126126	40 %	0 %	40 %	20 %	260866265
79	NC_013364	AGGCG	2	10	131389	131398	20 %	0 %	60 %	20 %	260866268
80	NC_013364	GGTTG	2	10	132142	132151	0 %	40 %	60 %	0 %	260866268
81	NC_013364	TCTGG	2	10	134788	134797	0 %	40 %	40 %	20 %	260866269
82	NC_013364	GGGCA	2	10	136199	136208	20 %	0 %	60 %	20 %	260866270
83	NC_013364	CAGCG	2	10	136478	136487	20 %	0 %	40 %	40 %	260866271
84	NC_013364	ACGAC	2	10	137758	137767	40 %	0 %	20 %	40 %	260866272
85	NC_013364	GGCTG	2	10	139189	139198	0 %	20 %	60 %	20 %	260866274
86	NC_013364	CCGTC	2	10	143308	143317	0 %	20 %	20 %	60 %	260866276
87	NC_013364	GTGAA	2	10	143318	143327	40 %	20 %	40 %	0 %	260866276
88	NC_013364	GGCAT	2	10	143480	143489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013364	GTTCA	2	10	143705	143714	20 %	40 %	20 %	20 %	260866277
90	NC_013364	ATCCA	2	10	144031	144040	40 %	20 %	0 %	40 %	260866277
91	NC_013364	GTAAG	2	10	144244	144253	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013364	CTTTA	2	10	145294	145303	20 %	60 %	0 %	20 %	260866279
93	NC_013364	TGGCG	2	10	145521	145530	0 %	20 %	60 %	20 %	260866279
94	NC_013364	TCCTC	2	10	145964	145973	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_013364	CGGGC	2	10	146709	146718	0 %	0 %	60 %	40 %	260866281
96	NC_013364	TTTCA	2	10	147834	147843	20 %	60 %	0 %	20 %	260866282
97	NC_013364	GGGAG	2	10	149159	149168	20 %	0 %	80 %	0 %	260866283
98	NC_013364	TGAAG	2	10	151057	151066	40 %	20 %	40 %	0 %	260866285
99	NC_013364	GCGGT	2	10	151181	151190	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013364	TTTGC	2	10	158147	158156	0 %	60 %	20 %	20 %	260866291
101	NC_013364	AAATT	2	10	158588	158597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013364	GCGAG	2	10	159955	159964	20 %	0 %	60 %	20 %	260866293
103	NC_013364	GGCGT	2	10	160393	160402	0 %	20 %	60 %	20 %	260866293
104	NC_013364	ATCAG	2	10	161031	161040	40 %	20 %	20 %	20 %	260866294
105	NC_013364	ACCAC	2	10	163296	163305	40 %	0 %	0 %	60 %	260866297
106	NC_013364	GGCGT	2	10	164999	165008	0 %	20 %	60 %	20 %	260866298
107	NC_013364	CGACG	2	10	166038	166047	20 %	0 %	40 %	40 %	260866298
108	NC_013364	TTATC	2	10	168886	168895	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013364	AAAAC	2	10	169961	169970	80 %	0 %	0 %	20 %	260866300
110	NC_013364	TGGTT	2	10	170218	170227	0 %	60 %	40 %	0 %	260866300
111	NC_013364	AACCT	2	10	172299	172308	40 %	20 %	0 %	40 %	260866302
112	NC_013364	TGGTC	2	10	172341	172350	0 %	40 %	40 %	20 %	260866302
113	NC_013364	TGGCG	2	10	173586	173595	0 %	20 %	60 %	20 %	260866303
114	NC_013364	CGGCG	2	10	174297	174306	0 %	0 %	60 %	40 %	260866303
115	NC_013364	TTCCA	2	10	174827	174836	20 %	40 %	0 %	40 %	260866303
116	NC_013364	GGTCC	2	10	179150	179159	0 %	20 %	40 %	40 %	260866308
117	NC_013364	ACGGG	2	10	181067	181076	20 %	0 %	60 %	20 %	260866310
118	NC_013364	GTGAT	2	10	183226	183235	20 %	40 %	40 %	0 %	260866311
119	NC_013364	GTGAT	2	10	183517	183526	20 %	40 %	40 %	0 %	260866311
120	NC_013364	TACGT	2	10	183762	183771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013364	TGGCC	2	10	185487	185496	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_013364	CCACG	2	10	185664	185673	20 %	0 %	20 %	60 %	260866314
123	NC_013364	GCCAG	2	10	187950	187959	20 %	0 %	40 %	40 %	260866316
124	NC_013364	GTTCT	2	10	189391	189400	0 %	60 %	20 %	20 %	260866316
125	NC_013364	CTGAA	2	10	191383	191392	40 %	20 %	20 %	20 %	260866318
126	NC_013364	AAGCG	2	10	191447	191456	40 %	0 %	40 %	20 %	260866318
127	NC_013364	TGCTG	2	10	192607	192616	0 %	40 %	40 %	20 %	260866319
128	NC_013364	TGGTG	2	10	193353	193362	0 %	40 %	60 %	0 %	260866320
129	NC_013364	TGCAC	2	10	193479	193488	20 %	20 %	20 %	40 %	260866320
130	NC_013364	TGCGC	2	10	193872	193881	0 %	20 %	40 %	40 %	260866320
131	NC_013364	AAATA	2	10	194094	194103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013364	GTCTG	2	10	194179	194188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013364	CATGG	2	10	195715	195724	20 %	20 %	40 %	20 %	260866322
134	NC_013364	CAGAT	2	10	196754	196763	40 %	20 %	20 %	20 %	260866323
135	NC_013364	ACTTT	2	10	196887	196896	20 %	60 %	0 %	20 %	260866323
136	NC_013364	GTTGG	2	10	197298	197307	0 %	40 %	60 %	0 %	260866324
137	NC_013364	GACGT	2	10	200807	200816	20 %	20 %	40 %	20 %	260866326
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139	NC_013364	ATGCC	2	10	205202	205211	20 %	20 %	20 %	40 %	260866331
140	NC_013364	GGATG	2	10	205464	205473	20 %	20 %	60 %	0 %	260866331
141	NC_013364	TGGCC	2	10	206528	206537	0 %	20 %	40 %	40 %	260866333
142	NC_013364	GTAAC	2	10	207271	207280	40 %	20 %	20 %	20 %	260866333
143	NC_013364	AGCCG	2	10	207899	207908	20 %	0 %	40 %	40 %	260866333
144	NC_013364	GGTGG	2	10	208008	208017	0 %	20 %	80 %	0 %	260866333
145	NC_013364	TTAAC	2	10	216151	216160	40 %	40 %	0 %	20 %	260866340
146	NC_013364	TGCGC	2	10	217363	217372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_013364	ACGGT	2	10	219019	219028	20 %	20 %	40 %	20 %	260866343
148	NC_013364	TGATT	2	10	221861	221870	20 %	60 %	20 %	0 %	260866346
149	NC_013364	CGGTT	2	10	224824	224833	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_013364	ACAAT	2	10	233442	233451	60 %	20 %	0 %	20 %	260866353
151	NC_013364	GTGAA	2	10	233830	233839	40 %	20 %	40 %	0 %	260866353
152	NC_013364	TAATT	2	10	234014	234023	40 %	60 %	0 %	0 %	260866353
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154	NC_013364	ACTGG	2	10	236952	236961	20 %	20 %	40 %	20 %	260866356
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157	NC_013364	TGATC	2	10	241685	241694	20 %	40 %	20 %	20 %	260866361
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159	NC_013364	CCAGA	2	10	243459	243468	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_013364	ATCGC	2	10	245827	245836	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_013364	CGCTG	2	10	247719	247728	0 %	20 %	40 %	40 %	260866363
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166	NC_013364	CCAGG	2	10	256376	256385	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
167	NC_013364	AAGGC	2	10	256503	256512	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
168	NC_013364	GCCGT	2	10	256983	256992	0 %	20 %	40 %	40 %	260866370
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171	NC_013364	CTAAT	2	10	261571	261580	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_013364	ACTGT	2	10	262626	262635	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_013364	AAGGC	2	10	264639	264648	40 %	0 %	40 %	20 %	260866376
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175	NC_013364	CGGGG	2	10	265332	265341	0 %	0 %	80 %	20 %	260866377
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182	NC_013364	AAAAG	2	10	270143	270152	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_013364	ATATT	2	10	270626	270635	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_013364	GATGC	2	10	277131	277140	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_013364	CTGCG	2	10	288001	288010	0 %	20 %	40 %	40 %	260866397
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233	NC_013364	ATAAA	2	10	361576	361585	80 %	20 %	0 %	0 %	260866478
234	NC_013364	AAAAT	2	10	361638	361647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_013364	GCAGG	2	10	362555	362564	20 %	0 %	60 %	20 %	260866479
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250	NC_013364	CGCTT	2	10	390042	390051	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
251	NC_013364	CACGG	2	10	391639	391648	20 %	0 %	40 %	40 %	260866501
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260	NC_013364	TGACC	2	10	408733	408742	20 %	20 %	20 %	40 %	260866514
261	NC_013364	TTGCG	2	10	409946	409955	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
262	NC_013364	TTTTC	2	10	410059	410068	0 %	80 %	0 %	20 %	260866515
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