MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_2

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013362	GTGATG	2	12	11815	11826	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260751946
2	NC_013362	TCAGCA	2	12	14296	14307	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260751951
3	NC_013362	GCAGAA	2	12	14702	14713	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260751951
4	NC_013362	TACCGC	2	12	14726	14737	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260751951
5	NC_013362	CTGCTA	2	12	15603	15614	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013362	GGCGCT	2	12	17779	17790	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260751955
7	NC_013362	CAGGTG	2	12	17810	17821	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260751955
8	NC_013362	GCCGGA	2	12	18151	18162	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260751955
9	NC_013362	CACTGG	2	12	19545	19556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260751956
10	NC_013362	TGGCAG	2	12	20221	20232	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260751957
11	NC_013362	ACAAGA	2	12	23264	23275	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	260751964
12	NC_013362	TATTGA	2	12	25337	25348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	260751967
13	NC_013362	ATGAGC	2	12	31633	31644	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260751979
14	NC_013362	TGGAAA	2	12	33397	33408	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	260751982
15	NC_013362	ATAAAT	2	12	41946	41957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260751992
16	NC_013362	GTCAAC	2	12	42636	42647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260751993
17	NC_013362	TCTGTT	2	12	42895	42906	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	260751994
18	NC_013362	GGCAGG	2	12	43534	43545	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013362	ATTATG	2	12	43644	43655	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	260751996
20	NC_013362	GGCAGG	2	12	44113	44124	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260751997
21	NC_013362	ACAGTT	2	12	46107	46118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	260751998
22	NC_013362	TTGGTG	2	12	47253	47264	0 %	50 %	50 %	0 %	260751998
23	NC_013362	ATAAGT	2	12	48147	48158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	260751998
24	NC_013362	AGTTTA	2	12	48357	48368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	260751999
25	NC_013362	GCATAA	2	12	48480	48491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260751999
26	NC_013362	ATGTGG	2	12	55384	55395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260752003
27	NC_013362	AACACG	2	12	57931	57942	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260752004
28	NC_013362	TGGGGA	2	12	58198	58209	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260752004
29	NC_013362	GTTGCG	2	12	60624	60635	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.