MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_2

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013362	TACC	2	8	390	397	25 %	25 %	0 %	50 %	260751931
2	NC_013362	CCGA	2	8	433	440	25 %	0 %	25 %	50 %	260751931
3	NC_013362	ACAG	2	8	530	537	50 %	0 %	25 %	25 %	260751931
4	NC_013362	CAGA	2	8	625	632	50 %	0 %	25 %	25 %	260751931
5	NC_013362	CCCT	2	8	1332	1339	0 %	25 %	0 %	75 %	260751932
6	NC_013362	CCCG	2	8	1363	1370	0 %	0 %	25 %	75 %	260751932
7	NC_013362	ATCC	2	8	2138	2145	25 %	25 %	0 %	50 %	260751933
8	NC_013362	GGCA	2	8	2926	2933	25 %	0 %	50 %	25 %	260751933
9	NC_013362	CCGC	2	8	3069	3076	0 %	0 %	25 %	75 %	260751933
10	NC_013362	AGGA	2	8	3081	3088	50 %	0 %	50 %	0 %	260751933
11	NC_013362	GAAT	2	8	4169	4176	50 %	25 %	25 %	0 %	260751934
12	NC_013362	TGGC	2	8	4218	4225	0 %	25 %	50 %	25 %	260751934
13	NC_013362	GAAA	2	8	4242	4249	75 %	0 %	25 %	0 %	260751934
14	NC_013362	TTGT	2	8	5706	5713	0 %	75 %	25 %	0 %	260751936
15	NC_013362	CTTT	3	12	5763	5774	0 %	75 %	0 %	25 %	260751936
16	NC_013362	CCTG	2	8	5951	5958	0 %	25 %	25 %	50 %	260751937
17	NC_013362	GTTT	2	8	6260	6267	0 %	75 %	25 %	0 %	260751937
18	NC_013362	TCTT	2	8	6274	6281	0 %	75 %	0 %	25 %	260751937
19	NC_013362	TTCT	2	8	6398	6405	0 %	75 %	0 %	25 %	260751937
20	NC_013362	GTAT	2	8	7191	7198	25 %	50 %	25 %	0 %	260751938
21	NC_013362	GCTG	2	8	7416	7423	0 %	25 %	50 %	25 %	260751938
22	NC_013362	TGGC	2	8	7951	7958	0 %	25 %	50 %	25 %	260751938
23	NC_013362	CGGG	2	8	8109	8116	0 %	0 %	75 %	25 %	260751939
24	NC_013362	CCGG	2	8	8223	8230	0 %	0 %	50 %	50 %	260751939
25	NC_013362	TGCG	2	8	8503	8510	0 %	25 %	50 %	25 %	260751940
26	NC_013362	GCAG	2	8	8992	8999	25 %	0 %	50 %	25 %	260751940
27	NC_013362	ATGA	2	8	9241	9248	50 %	25 %	25 %	0 %	260751941
28	NC_013362	CAGT	2	8	10128	10135	25 %	25 %	25 %	25 %	260751943
29	NC_013362	AGTG	2	8	10477	10484	25 %	25 %	50 %	0 %	260751943
30	NC_013362	GTCT	2	8	11110	11117	0 %	50 %	25 %	25 %	260751945
31	NC_013362	AGGC	2	8	12151	12158	25 %	0 %	50 %	25 %	260751948
32	NC_013362	CTGC	2	8	12364	12371	0 %	25 %	25 %	50 %	260751948
33	NC_013362	ATTT	2	8	12960	12967	25 %	75 %	0 %	0 %	260751949
34	NC_013362	GTCA	2	8	12999	13006	25 %	25 %	25 %	25 %	260751949
35	NC_013362	CGCT	2	8	13713	13720	0 %	25 %	25 %	50 %	260751951
36	NC_013362	CCCG	2	8	13825	13832	0 %	0 %	25 %	75 %	260751951
37	NC_013362	GAAG	2	8	14201	14208	50 %	0 %	50 %	0 %	260751951
38	NC_013362	CAGT	2	8	14868	14875	25 %	25 %	25 %	25 %	260751952
39	NC_013362	GTCT	2	8	15301	15308	0 %	50 %	25 %	25 %	260751952
40	NC_013362	GTCG	2	8	16316	16323	0 %	25 %	50 %	25 %	260751953
41	NC_013362	TAAG	2	8	17116	17123	50 %	25 %	25 %	0 %	260751954
42	NC_013362	CCTG	2	8	17425	17432	0 %	25 %	25 %	50 %	260751955
43	NC_013362	GAAC	2	8	18196	18203	50 %	0 %	25 %	25 %	260751955
44	NC_013362	ACGC	2	8	18493	18500	25 %	0 %	25 %	50 %	260751955
45	NC_013362	GAAG	2	8	18661	18668	50 %	0 %	50 %	0 %	260751955
46	NC_013362	CTGG	2	8	19071	19078	0 %	25 %	50 %	25 %	260751955
47	NC_013362	GGCG	2	8	19685	19692	0 %	0 %	75 %	25 %	260751957
48	NC_013362	TTGA	2	8	19882	19889	25 %	50 %	25 %	0 %	260751957
49	NC_013362	CGGG	2	8	20681	20688	0 %	0 %	75 %	25 %	260751958
50	NC_013362	TGGC	2	8	20702	20709	0 %	25 %	50 %	25 %	260751958
51	NC_013362	GTGG	2	8	20723	20730	0 %	25 %	75 %	0 %	260751958
52	NC_013362	CAAA	2	8	20755	20762	75 %	0 %	0 %	25 %	260751958
53	NC_013362	ACTG	2	8	21249	21256	25 %	25 %	25 %	25 %	260751961
54	NC_013362	GAAA	2	8	23044	23051	75 %	0 %	25 %	0 %	260751964
55	NC_013362	ATTT	2	8	23076	23083	25 %	75 %	0 %	0 %	260751964
56	NC_013362	GAGT	2	8	25402	25409	25 %	25 %	50 %	0 %	260751967
57	NC_013362	TTTG	2	8	25484	25491	0 %	75 %	25 %	0 %	260751967
58	NC_013362	TAGT	2	8	25516	25523	25 %	50 %	25 %	0 %	260751967
59	NC_013362	AAAC	2	8	26031	26038	75 %	0 %	0 %	25 %	260751968
60	NC_013362	TATT	2	8	26511	26518	25 %	75 %	0 %	0 %	260751969
61	NC_013362	ACCA	2	8	26614	26621	50 %	0 %	0 %	50 %	260751970
62	NC_013362	CTGG	2	8	27420	27427	0 %	25 %	50 %	25 %	260751971
63	NC_013362	CCGT	2	8	27888	27895	0 %	25 %	25 %	50 %	260751972
64	NC_013362	CAGC	2	8	28102	28109	25 %	0 %	25 %	50 %	260751972
65	NC_013362	GCCA	2	8	28112	28119	25 %	0 %	25 %	50 %	260751972
66	NC_013362	TCTG	2	8	28272	28279	0 %	50 %	25 %	25 %	260751973
67	NC_013362	AACA	2	8	28462	28469	75 %	0 %	0 %	25 %	260751973
68	NC_013362	TGCC	2	8	28589	28596	0 %	25 %	25 %	50 %	260751973
69	NC_013362	ACGC	2	8	29430	29437	25 %	0 %	25 %	50 %	260751973
70	NC_013362	AGGG	2	8	29579	29586	25 %	0 %	75 %	0 %	260751973
71	NC_013362	GTTG	2	8	29661	29668	0 %	50 %	50 %	0 %	260751974
72	NC_013362	ATGT	2	8	29975	29982	25 %	50 %	25 %	0 %	260751974
73	NC_013362	GAAG	2	8	30067	30074	50 %	0 %	50 %	0 %	260751974
74	NC_013362	AACA	2	8	30142	30149	75 %	0 %	0 %	25 %	260751974
75	NC_013362	ATGC	2	8	30237	30244	25 %	25 %	25 %	25 %	260751975
76	NC_013362	TCCT	2	8	30274	30281	0 %	50 %	0 %	50 %	260751975
77	NC_013362	TTTA	2	8	30743	30750	25 %	75 %	0 %	0 %	260751977
78	NC_013362	TCCG	2	8	30974	30981	0 %	25 %	25 %	50 %	260751977
79	NC_013362	ATTA	2	8	31236	31243	50 %	50 %	0 %	0 %	260751977
80	NC_013362	GTGA	2	8	31379	31386	25 %	25 %	50 %	0 %	260751978
81	NC_013362	AAAT	2	8	31455	31462	75 %	25 %	0 %	0 %	260751978
82	NC_013362	CTGA	2	8	31875	31882	25 %	25 %	25 %	25 %	260751979
83	NC_013362	TGTA	2	8	32455	32462	25 %	50 %	25 %	0 %	260751981
84	NC_013362	ATGA	2	8	33036	33043	50 %	25 %	25 %	0 %	260751982
85	NC_013362	TGGT	2	8	33181	33188	0 %	50 %	50 %	0 %	260751982
86	NC_013362	GAAT	2	8	33310	33317	50 %	25 %	25 %	0 %	260751982
87	NC_013362	CCGT	2	8	33882	33889	0 %	25 %	25 %	50 %	260751982
88	NC_013362	CCTG	2	8	34099	34106	0 %	25 %	25 %	50 %	260751982
89	NC_013362	CACC	2	8	34240	34247	25 %	0 %	0 %	75 %	260751982
90	NC_013362	CCGT	2	8	34853	34860	0 %	25 %	25 %	50 %	260751982
91	NC_013362	TTCC	2	8	35258	35265	0 %	50 %	0 %	50 %	260751982
92	NC_013362	CTGG	2	8	35456	35463	0 %	25 %	50 %	25 %	260751982
93	NC_013362	AGCC	2	8	35746	35753	25 %	0 %	25 %	50 %	260751983
94	NC_013362	CGTC	2	8	36140	36147	0 %	25 %	25 %	50 %	260751984
95	NC_013362	AGTC	2	8	36656	36663	25 %	25 %	25 %	25 %	260751985
96	NC_013362	GACG	2	8	36779	36786	25 %	0 %	50 %	25 %	260751985
97	NC_013362	GGAC	2	8	37015	37022	25 %	0 %	50 %	25 %	260751985
98	NC_013362	CAGT	2	8	38990	38997	25 %	25 %	25 %	25 %	260751989
99	NC_013362	CGGG	2	8	39028	39035	0 %	0 %	75 %	25 %	260751989
100	NC_013362	TCAT	2	8	39238	39245	25 %	50 %	0 %	25 %	260751989
101	NC_013362	GTGG	2	8	39876	39883	0 %	25 %	75 %	0 %	260751989
102	NC_013362	GCTG	2	8	40269	40276	0 %	25 %	50 %	25 %	260751989
103	NC_013362	CTGC	2	8	40521	40528	0 %	25 %	25 %	50 %	260751989
104	NC_013362	CAGG	2	8	40792	40799	25 %	0 %	50 %	25 %	260751989
105	NC_013362	CTGA	2	8	41031	41038	25 %	25 %	25 %	25 %	260751990
106	NC_013362	AAAT	2	8	41171	41178	75 %	25 %	0 %	0 %	260751991
107	NC_013362	GGCA	2	8	42396	42403	25 %	0 %	50 %	25 %	260751993
108	NC_013362	GGAT	2	8	42706	42713	25 %	25 %	50 %	0 %	260751993
109	NC_013362	GGAT	2	8	42931	42938	25 %	25 %	50 %	0 %	260751994
110	NC_013362	TGAA	2	8	42977	42984	50 %	25 %	25 %	0 %	260751994
111	NC_013362	CAAA	2	8	43020	43027	75 %	0 %	0 %	25 %	260751994
112	NC_013362	ATGG	2	8	43183	43190	25 %	25 %	50 %	0 %	260751995
113	NC_013362	AGGG	2	8	43376	43383	25 %	0 %	75 %	0 %	260751995
114	NC_013362	GAAA	2	8	43594	43601	75 %	0 %	25 %	0 %	260751996
115	NC_013362	ATGT	2	8	43814	43821	25 %	50 %	25 %	0 %	260751996
116	NC_013362	AGGG	2	8	43955	43962	25 %	0 %	75 %	0 %	260751996
117	NC_013362	CCGC	2	8	45286	45293	0 %	0 %	25 %	75 %	260751997
118	NC_013362	GGAG	2	8	45327	45334	25 %	0 %	75 %	0 %	260751997
119	NC_013362	TGAA	2	8	45342	45349	50 %	25 %	25 %	0 %	260751997
120	NC_013362	CAGC	2	8	46140	46147	25 %	0 %	25 %	50 %	260751998
121	NC_013362	GTCC	2	8	46402	46409	0 %	25 %	25 %	50 %	260751998
122	NC_013362	GATG	2	8	46855	46862	25 %	25 %	50 %	0 %	260751998
123	NC_013362	TCAG	2	8	47013	47020	25 %	25 %	25 %	25 %	260751998
124	NC_013362	TGGT	2	8	48243	48250	0 %	50 %	50 %	0 %	260751999
125	NC_013362	TGAG	2	8	48824	48831	25 %	25 %	50 %	0 %	260752000
126	NC_013362	AATC	2	8	49418	49425	50 %	25 %	0 %	25 %	260752000
127	NC_013362	GCTG	2	8	49999	50006	0 %	25 %	50 %	25 %	260752001
128	NC_013362	CTGA	2	8	50282	50289	25 %	25 %	25 %	25 %	260752001
129	NC_013362	GACA	2	8	50886	50893	50 %	0 %	25 %	25 %	260752002
130	NC_013362	TCTG	2	8	50993	51000	0 %	50 %	25 %	25 %	260752002
131	NC_013362	GGCT	2	8	51568	51575	0 %	25 %	50 %	25 %	260752002
132	NC_013362	CGGA	2	8	52810	52817	25 %	0 %	50 %	25 %	260752003
133	NC_013362	TGAT	2	8	52933	52940	25 %	50 %	25 %	0 %	260752003
134	NC_013362	CGGA	2	8	53008	53015	25 %	0 %	50 %	25 %	260752003
135	NC_013362	CGCA	2	8	53532	53539	25 %	0 %	25 %	50 %	260752003
136	NC_013362	GTCC	2	8	53798	53805	0 %	25 %	25 %	50 %	260752003
137	NC_013362	CCGT	2	8	53915	53922	0 %	25 %	25 %	50 %	260752003
138	NC_013362	TCGC	2	8	54038	54045	0 %	25 %	25 %	50 %	260752003
139	NC_013362	CTGG	2	8	54539	54546	0 %	25 %	50 %	25 %	260752003
140	NC_013362	CCGG	2	8	54743	54750	0 %	0 %	50 %	50 %	260752003
141	NC_013362	GCGA	2	8	54772	54779	25 %	0 %	50 %	25 %	260752003
142	NC_013362	GGGC	2	8	54879	54886	0 %	0 %	75 %	25 %	260752003
143	NC_013362	CCTG	2	8	54899	54906	0 %	25 %	25 %	50 %	260752003
144	NC_013362	CGGA	2	8	56752	56759	25 %	0 %	50 %	25 %	260752003
145	NC_013362	TGCC	2	8	59139	59146	0 %	25 %	25 %	50 %	260752005
146	NC_013362	TGGA	2	8	59505	59512	25 %	25 %	50 %	0 %	260752006
147	NC_013362	CAGG	2	8	60096	60103	25 %	0 %	50 %	25 %	260752007
148	NC_013362	GCCA	2	8	61325	61332	25 %	0 %	25 %	50 %	260752008
149	NC_013362	AGGC	2	8	61382	61389	25 %	0 %	50 %	25 %	260752008
150	NC_013362	CAGA	2	8	62813	62820	50 %	0 %	25 %	25 %	260752011
151	NC_013362	CTAA	2	8	63052	63059	50 %	25 %	0 %	25 %	260752011

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.