MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_2

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013362	CCT	2	6	865	870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013362	AAT	2	6	874	879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013362	CAC	2	6	937	942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013362	TCG	2	6	1523	1528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013362	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013362	GCC	2	6	1681	1686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013362	CAC	2	6	1854	1859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013362	GGT	2	6	1863	1868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013362	GCT	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013362	GTC	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013362	GGT	2	6	3240	3245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013362	TAA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013362	CAA	2	6	3411	3416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013362	GCC	2	6	3448	3453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_013362	CGG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013362	CTT	2	6	3544	3549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013362	ATG	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013362	CAT	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013362	CGG	2	6	4554	4559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013362	GCA	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013362	GGC	2	6	4624	4629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013362	GCG	2	6	4665	4670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013362	GCG	2	6	4675	4680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013362	GGC	2	6	4762	4767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013362	GGC	2	6	4798	4803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013362	CAA	2	6	4854	4859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013362	GTG	2	6	4870	4875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013362	GGT	2	6	4975	4980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013362	TTG	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013362	GAT	2	6	5308	5313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013362	GGT	2	6	5371	5376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013362	TTG	2	6	6903	6908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013362	TGT	2	6	6926	6931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013362	ACT	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013362	CCT	2	6	7033	7038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013362	TCG	2	6	7053	7058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013362	TCC	3	9	7060	7068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013362	GAG	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013362	CAC	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013362	AGG	2	6	8468	8473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013362	CGC	2	6	9839	9844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013362	GCC	2	6	11510	11515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_013362	CGT	2	6	12633	12638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013362	GCG	2	6	12640	12645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013362	GCG	2	6	12841	12846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013362	CAG	3	9	12886	12894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013362	GCC	2	6	13411	13416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013362	GGC	2	6	13425	13430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013362	GGA	2	6	15443	15448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013362	CGC	2	6	15517	15522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013362	TTC	2	6	15561	15566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013362	TGT	3	9	15592	15600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013362	TTC	2	6	15618	15623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013362	CTG	2	6	15630	15635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013362	ACT	2	6	15647	15652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013362	GGC	2	6	15700	15705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013362	GTC	2	6	15711	15716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013362	GCT	2	6	15737	15742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013362	CCG	2	6	15760	15765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013362	CGC	2	6	15844	15849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013362	GCC	2	6	15893	15898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013362	TCG	2	6	15937	15942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013362	GCG	2	6	15945	15950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013362	GTT	2	6	15962	15967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013362	GCG	2	6	16147	16152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013362	GCA	2	6	19179	19184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013362	GGT	2	6	20907	20912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013362	GCG	2	6	21398	21403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013362	ATT	2	6	21470	21475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013362	TTC	2	6	21482	21487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013362	ACT	2	6	21502	21507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013362	GGC	2	6	21555	21560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013362	GCG	2	6	22002	22007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013362	AGG	2	6	22126	22131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013362	TTG	2	6	22448	22453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013362	TAA	2	6	22463	22468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013362	GAG	2	6	22524	22529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013362	TAT	2	6	23404	23409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013362	GTC	2	6	23429	23434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013362	TCA	2	6	23450	23455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013362	GTC	2	6	23468	23473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013362	AGG	2	6	23507	23512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013362	AAT	2	6	24195	24200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013362	TGG	2	6	24232	24237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013362	CAC	2	6	24242	24247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013362	CAC	2	6	24254	24259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_013362	AGC	2	6	24351	24356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013362	GGT	2	6	24401	24406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013362	ATT	2	6	24429	24434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013362	TGC	2	6	24447	24452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013362	GCG	2	6	24455	24460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013362	GCT	2	6	24494	24499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013362	TGA	2	6	25017	25022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013362	AAT	2	6	25024	25029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013362	AAT	2	6	25033	25038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013362	GAG	2	6	25143	25148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013362	TGT	2	6	25853	25858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013362	CGG	2	6	31278	31283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013362	GGA	2	6	31366	31371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013362	TAA	2	6	32140	32145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013362	AGG	2	6	38526	38531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013362	AAC	2	6	40816	40821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013362	TAA	2	6	41877	41882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013362	GCC	2	6	43425	43430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_013362	GAT	2	6	48178	48183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013362	AGG	2	6	49449	49454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013362	CCT	2	6	49468	49473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013362	CAT	2	6	50386	50391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013362	GAT	2	6	58693	58698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013362	ATT	2	6	59366	59371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013362	ATA	2	6	59379	59384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013362	AAT	2	6	59667	59672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013362	CAG	2	6	59719	59724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013362	ATT	2	6	59738	59743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013362	CGT	2	6	59795	59800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013362	GAT	2	6	60666	60671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013362	TTA	2	6	60674	60679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013362	ATA	2	6	60731	60736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013362	GCA	2	6	60790	60795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013362	TTC	2	6	60800	60805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013362	GGT	2	6	60842	60847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013362	TTA	2	6	60861	60866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013362	TAA	2	6	61572	61577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013362	TGG	2	6	61589	61594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013362	ACC	2	6	61614	61619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_013362	ATG	3	9	61660	61668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013362	GTA	2	6	62167	62172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013362	TAT	2	6	62216	62221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013362	CGG	2	6	62224	62229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013362	GTA	2	6	62759	62764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013362	GAG	2	6	62796	62801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013362	CGA	2	6	63226	63231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013362	AGA	2	6	63232	63237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013362	CAA	2	6	63267	63272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013362	CTT	2	6	63319	63324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.