MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_2

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013362	CA	3	6	1274	1279	50 %	0 %	0 %	50 %	260751932
2	NC_013362	CG	3	6	1986	1991	0 %	0 %	50 %	50 %	260751933
3	NC_013362	CA	3	6	2053	2058	50 %	0 %	0 %	50 %	260751933
4	NC_013362	TC	3	6	2173	2178	0 %	50 %	0 %	50 %	260751933
5	NC_013362	CA	4	8	2179	2186	50 %	0 %	0 %	50 %	260751933
6	NC_013362	CG	3	6	5084	5089	0 %	0 %	50 %	50 %	260751935
7	NC_013362	CT	3	6	5465	5470	0 %	50 %	0 %	50 %	260751936
8	NC_013362	GA	3	6	5695	5700	50 %	0 %	50 %	0 %	260751936
9	NC_013362	AC	3	6	7424	7429	50 %	0 %	0 %	50 %	260751938
10	NC_013362	TG	3	6	7629	7634	0 %	50 %	50 %	0 %	260751938
11	NC_013362	CA	3	6	8958	8963	50 %	0 %	0 %	50 %	260751940
12	NC_013362	GC	3	6	9554	9559	0 %	0 %	50 %	50 %	260751942
13	NC_013362	TG	3	6	10483	10488	0 %	50 %	50 %	0 %	260751943
14	NC_013362	CG	3	6	12180	12185	0 %	0 %	50 %	50 %	260751948
15	NC_013362	CG	3	6	13514	13519	0 %	0 %	50 %	50 %	260751951
16	NC_013362	GA	3	6	13689	13694	50 %	0 %	50 %	0 %	260751951
17	NC_013362	GC	3	6	14898	14903	0 %	0 %	50 %	50 %	260751952
18	NC_013362	TG	3	6	15089	15094	0 %	50 %	50 %	0 %	260751952
19	NC_013362	AG	3	6	17122	17127	50 %	0 %	50 %	0 %	260751954
20	NC_013362	AT	3	6	17182	17187	50 %	50 %	0 %	0 %	260751955
21	NC_013362	TG	4	8	18358	18365	0 %	50 %	50 %	0 %	260751955
22	NC_013362	CG	3	6	18991	18996	0 %	0 %	50 %	50 %	260751955
23	NC_013362	TC	3	6	19446	19451	0 %	50 %	0 %	50 %	260751956
24	NC_013362	AC	3	6	20373	20378	50 %	0 %	0 %	50 %	260751958
25	NC_013362	TG	3	6	20386	20391	0 %	50 %	50 %	0 %	260751958
26	NC_013362	GT	4	8	21072	21079	0 %	50 %	50 %	0 %	260751959
27	NC_013362	GT	3	6	21085	21090	0 %	50 %	50 %	0 %	260751959
28	NC_013362	AT	3	6	22672	22677	50 %	50 %	0 %	0 %	260751964
29	NC_013362	GA	3	6	24663	24668	50 %	0 %	50 %	0 %	260751966
30	NC_013362	TC	3	6	24844	24849	0 %	50 %	0 %	50 %	260751966
31	NC_013362	AG	3	6	24907	24912	50 %	0 %	50 %	0 %	260751966
32	NC_013362	TG	4	8	25156	25163	0 %	50 %	50 %	0 %	260751967
33	NC_013362	AG	3	6	26009	26014	50 %	0 %	50 %	0 %	260751968
34	NC_013362	AG	3	6	26119	26124	50 %	0 %	50 %	0 %	260751968
35	NC_013362	CT	3	6	26977	26982	0 %	50 %	0 %	50 %	260751971
36	NC_013362	AT	3	6	27189	27194	50 %	50 %	0 %	0 %	260751971
37	NC_013362	GC	3	6	28133	28138	0 %	0 %	50 %	50 %	260751972
38	NC_013362	GC	3	6	29196	29201	0 %	0 %	50 %	50 %	260751973
39	NC_013362	AT	3	6	32402	32407	50 %	50 %	0 %	0 %	260751981
40	NC_013362	CT	3	6	32906	32911	0 %	50 %	0 %	50 %	260751982
41	NC_013362	CG	3	6	33139	33144	0 %	0 %	50 %	50 %	260751982
42	NC_013362	GT	3	6	33575	33580	0 %	50 %	50 %	0 %	260751982
43	NC_013362	GC	3	6	34163	34168	0 %	0 %	50 %	50 %	260751982
44	NC_013362	AG	3	6	34169	34174	50 %	0 %	50 %	0 %	260751982
45	NC_013362	TG	3	6	34432	34437	0 %	50 %	50 %	0 %	260751982
46	NC_013362	GC	3	6	34638	34643	0 %	0 %	50 %	50 %	260751982
47	NC_013362	CA	3	6	35057	35062	50 %	0 %	0 %	50 %	260751982
48	NC_013362	CG	3	6	35106	35111	0 %	0 %	50 %	50 %	260751982
49	NC_013362	AC	3	6	37650	37655	50 %	0 %	0 %	50 %	260751986
50	NC_013362	CA	3	6	39987	39992	50 %	0 %	0 %	50 %	260751989
51	NC_013362	TC	3	6	42213	42218	0 %	50 %	0 %	50 %	260751992
52	NC_013362	AT	3	6	42952	42957	50 %	50 %	0 %	0 %	260751994
53	NC_013362	AT	4	8	43671	43678	50 %	50 %	0 %	0 %	260751996
54	NC_013362	CA	3	6	44096	44101	50 %	0 %	0 %	50 %	260751997
55	NC_013362	AC	3	6	44854	44859	50 %	0 %	0 %	50 %	260751997
56	NC_013362	AC	3	6	46011	46016	50 %	0 %	0 %	50 %	260751998
57	NC_013362	GT	3	6	46644	46649	0 %	50 %	50 %	0 %	260751998
58	NC_013362	CA	3	6	46828	46833	50 %	0 %	0 %	50 %	260751998
59	NC_013362	TA	3	6	48383	48388	50 %	50 %	0 %	0 %	260751999
60	NC_013362	CT	3	6	48410	48415	0 %	50 %	0 %	50 %	260751999
61	NC_013362	TC	3	6	49853	49858	0 %	50 %	0 %	50 %	260752001
62	NC_013362	TG	4	8	49962	49969	0 %	50 %	50 %	0 %	260752001
63	NC_013362	AT	3	6	50727	50732	50 %	50 %	0 %	0 %	260752002
64	NC_013362	AC	3	6	51347	51352	50 %	0 %	0 %	50 %	260752002
65	NC_013362	TG	3	6	51687	51692	0 %	50 %	50 %	0 %	260752002
66	NC_013362	CT	4	8	52102	52109	0 %	50 %	0 %	50 %	260752002
67	NC_013362	AC	3	6	53096	53101	50 %	0 %	0 %	50 %	260752003
68	NC_013362	AG	3	6	54413	54418	50 %	0 %	50 %	0 %	260752003
69	NC_013362	CA	3	6	55004	55009	50 %	0 %	0 %	50 %	260752003
70	NC_013362	GA	3	6	55503	55508	50 %	0 %	50 %	0 %	260752003
71	NC_013362	GC	3	6	55547	55552	0 %	0 %	50 %	50 %	260752003
72	NC_013362	CA	3	6	55625	55630	50 %	0 %	0 %	50 %	260752003
73	NC_013362	CG	3	6	55710	55715	0 %	0 %	50 %	50 %	260752003
74	NC_013362	GA	3	6	57367	57372	50 %	0 %	50 %	0 %	260752003
75	NC_013362	CA	3	6	60458	60463	50 %	0 %	0 %	50 %	260752007
76	NC_013362	AG	3	6	61811	61816	50 %	0 %	50 %	0 %	260752009
77	NC_013362	CA	3	6	61866	61871	50 %	0 %	0 %	50 %	260752009
78	NC_013362	AG	3	6	62358	62363	50 %	0 %	50 %	0 %	260752010
79	NC_013362	TG	3	6	62982	62987	0 %	50 %	50 %	0 %	260752011

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.