MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 plasmid pO26_2

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013362	A	6	6	2222	2227	100 %	0 %	0 %	0 %	260751933
2	NC_013362	T	7	7	5404	5410	0 %	100 %	0 %	0 %	260751936
3	NC_013362	T	6	6	5501	5506	0 %	100 %	0 %	0 %	260751936
4	NC_013362	A	6	6	5594	5599	100 %	0 %	0 %	0 %	260751936
5	NC_013362	T	7	7	5772	5778	0 %	100 %	0 %	0 %	260751936
6	NC_013362	T	6	6	6007	6012	0 %	100 %	0 %	0 %	260751937
7	NC_013362	T	6	6	6064	6069	0 %	100 %	0 %	0 %	260751937
8	NC_013362	T	6	6	6327	6332	0 %	100 %	0 %	0 %	260751937
9	NC_013362	T	6	6	6591	6596	0 %	100 %	0 %	0 %	260751937
10	NC_013362	A	6	6	7650	7655	100 %	0 %	0 %	0 %	260751938
11	NC_013362	G	6	6	7995	8000	0 %	0 %	100 %	0 %	260751938
12	NC_013362	T	6	6	8296	8301	0 %	100 %	0 %	0 %	260751939
13	NC_013362	A	6	6	8665	8670	100 %	0 %	0 %	0 %	260751940
14	NC_013362	T	7	7	12278	12284	0 %	100 %	0 %	0 %	260751948
15	NC_013362	A	6	6	13078	13083	100 %	0 %	0 %	0 %	260751949
16	NC_013362	A	6	6	13586	13591	100 %	0 %	0 %	0 %	260751951
17	NC_013362	A	7	7	14018	14024	100 %	0 %	0 %	0 %	260751951
18	NC_013362	A	6	6	14187	14192	100 %	0 %	0 %	0 %	260751951
19	NC_013362	A	6	6	16724	16729	100 %	0 %	0 %	0 %	260751953
20	NC_013362	A	7	7	22354	22360	100 %	0 %	0 %	0 %	260751963
21	NC_013362	T	6	6	22629	22634	0 %	100 %	0 %	0 %	260751964
22	NC_013362	T	6	6	23849	23854	0 %	100 %	0 %	0 %	260751965
23	NC_013362	T	6	6	24166	24171	0 %	100 %	0 %	0 %	260751965
24	NC_013362	A	6	6	24620	24625	100 %	0 %	0 %	0 %	260751966
25	NC_013362	A	6	6	24945	24950	100 %	0 %	0 %	0 %	260751966
26	NC_013362	T	7	7	25282	25288	0 %	100 %	0 %	0 %	260751967
27	NC_013362	T	6	6	25527	25532	0 %	100 %	0 %	0 %	260751967
28	NC_013362	A	7	7	25656	25662	100 %	0 %	0 %	0 %	260751967
29	NC_013362	A	6	6	25677	25682	100 %	0 %	0 %	0 %	260751967
30	NC_013362	T	7	7	26237	26243	0 %	100 %	0 %	0 %	260751969
31	NC_013362	A	6	6	26746	26751	100 %	0 %	0 %	0 %	260751970
32	NC_013362	A	6	6	26755	26760	100 %	0 %	0 %	0 %	260751970
33	NC_013362	A	6	6	27454	27459	100 %	0 %	0 %	0 %	260751971
34	NC_013362	T	7	7	27488	27494	0 %	100 %	0 %	0 %	260751972
35	NC_013362	G	6	6	28988	28993	0 %	0 %	100 %	0 %	260751973
36	NC_013362	G	6	6	29892	29897	0 %	0 %	100 %	0 %	260751974
37	NC_013362	A	7	7	30511	30517	100 %	0 %	0 %	0 %	260751976
38	NC_013362	A	6	6	30867	30872	100 %	0 %	0 %	0 %	260751977
39	NC_013362	T	6	6	31197	31202	0 %	100 %	0 %	0 %	260751977
40	NC_013362	A	6	6	31612	31617	100 %	0 %	0 %	0 %	260751979
41	NC_013362	A	6	6	31932	31937	100 %	0 %	0 %	0 %	260751979
42	NC_013362	A	6	6	32055	32060	100 %	0 %	0 %	0 %	260751979
43	NC_013362	A	6	6	32178	32183	100 %	0 %	0 %	0 %	260751980
44	NC_013362	G	7	7	32353	32359	0 %	0 %	100 %	0 %	260751980
45	NC_013362	A	7	7	33375	33381	100 %	0 %	0 %	0 %	260751982
46	NC_013362	G	6	6	33910	33915	0 %	0 %	100 %	0 %	260751982
47	NC_013362	G	6	6	34445	34450	0 %	0 %	100 %	0 %	260751982
48	NC_013362	A	6	6	35505	35510	100 %	0 %	0 %	0 %	260751983
49	NC_013362	T	6	6	35666	35671	0 %	100 %	0 %	0 %	260751983
50	NC_013362	A	6	6	37424	37429	100 %	0 %	0 %	0 %	260751985
51	NC_013362	T	6	6	39597	39602	0 %	100 %	0 %	0 %	260751989
52	NC_013362	G	6	6	39942	39947	0 %	0 %	100 %	0 %	260751989
53	NC_013362	T	6	6	40981	40986	0 %	100 %	0 %	0 %	260751990
54	NC_013362	C	6	6	41213	41218	0 %	0 %	0 %	100 %	260751991
55	NC_013362	A	6	6	41380	41385	100 %	0 %	0 %	0 %	260751991
56	NC_013362	T	7	7	42058	42064	0 %	100 %	0 %	0 %	260751992
57	NC_013362	A	7	7	42737	42743	100 %	0 %	0 %	0 %	260751993
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59	NC_013362	T	6	6	42910	42915	0 %	100 %	0 %	0 %	260751994
60	NC_013362	T	6	6	43289	43294	0 %	100 %	0 %	0 %	260751995
61	NC_013362	A	6	6	43599	43604	100 %	0 %	0 %	0 %	260751996
62	NC_013362	A	6	6	43621	43626	100 %	0 %	0 %	0 %	260751996
63	NC_013362	T	6	6	43688	43693	0 %	100 %	0 %	0 %	260751996
64	NC_013362	T	6	6	43714	43719	0 %	100 %	0 %	0 %	260751996
65	NC_013362	G	6	6	43901	43906	0 %	0 %	100 %	0 %	260751996
66	NC_013362	T	6	6	44319	44324	0 %	100 %	0 %	0 %	260751997
67	NC_013362	T	6	6	45909	45914	0 %	100 %	0 %	0 %	260751998
68	NC_013362	G	6	6	47232	47237	0 %	0 %	100 %	0 %	260751998
69	NC_013362	A	7	7	48334	48340	100 %	0 %	0 %	0 %	260751999
70	NC_013362	A	7	7	48490	48496	100 %	0 %	0 %	0 %	260751999
71	NC_013362	A	7	7	48717	48723	100 %	0 %	0 %	0 %	260752000
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78	NC_013362	A	6	6	54751	54756	100 %	0 %	0 %	0 %	260752003
79	NC_013362	A	6	6	55447	55452	100 %	0 %	0 %	0 %	260752003
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81	NC_013362	A	7	7	58884	58890	100 %	0 %	0 %	0 %	260752005
82	NC_013362	C	6	6	58994	58999	0 %	0 %	0 %	100 %	260752005
83	NC_013362	A	6	6	59071	59076	100 %	0 %	0 %	0 %	260752005
84	NC_013362	A	8	8	59279	59286	100 %	0 %	0 %	0 %	260752005
85	NC_013362	T	6	6	61740	61745	0 %	100 %	0 %	0 %	260752009

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.