MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIB 11163 plasmid pZA1001

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013356	AAGGA	2	10	331	340	60 %	0 %	40 %	0 %	260712884
2	NC_013356	AGCGA	2	10	1763	1772	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013356	AAAGG	2	10	1964	1973	60 %	0 %	40 %	0 %	260712888
4	NC_013356	ATCTG	2	10	4314	4323	20 %	40 %	20 %	20 %	260712890
5	NC_013356	CTCAT	2	10	5215	5224	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013356	TAAAA	2	10	5335	5344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013356	CTCTC	2	10	13850	13859	0 %	40 %	0 %	60 %	260712899
8	NC_013356	TGATA	2	10	14395	14404	40 %	40 %	20 %	0 %	260712899
9	NC_013356	CGCTT	2	10	15735	15744	0 %	40 %	20 %	40 %	260712900
10	NC_013356	AAAAG	2	10	17317	17326	80 %	0 %	20 %	0 %	260712900
11	NC_013356	ATCGT	2	10	18602	18611	20 %	40 %	20 %	20 %	260712901
12	NC_013356	AATTT	2	10	19330	19339	40 %	60 %	0 %	0 %	260712902
13	NC_013356	AAGTG	2	10	20121	20130	40 %	20 %	40 %	0 %	260712902
14	NC_013356	CAATG	2	10	26231	26240	40 %	20 %	20 %	20 %	260712905
15	NC_013356	CAGAA	2	10	26752	26761	60 %	0 %	20 %	20 %	260712906
16	NC_013356	ATGAG	2	10	29573	29582	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013356	CTGTT	2	10	33059	33068	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013356	ACTGC	2	10	34786	34795	20 %	20 %	20 %	40 %	260712915
19	NC_013356	TCCTT	2	10	34850	34859	0 %	60 %	0 %	40 %	260712915
20	NC_013356	TACAC	2	10	35168	35177	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013356	TGAAT	2	10	35578	35587	40 %	40 %	20 %	0 %	260712916
22	NC_013356	CATGA	2	10	37240	37249	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013356	AGGTC	2	10	37332	37341	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013356	TGCCC	2	10	39492	39501	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_013356	TAACG	2	10	39693	39702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013356	GGCTG	2	10	41134	41143	0 %	20 %	60 %	20 %	260712919
27	NC_013356	GCCAT	2	10	43203	43212	20 %	20 %	20 %	40 %	260712920
28	NC_013356	GAACT	2	10	46583	46592	40 %	20 %	20 %	20 %	260712923
29	NC_013356	GATGA	2	10	47783	47792	40 %	20 %	40 %	0 %	260712923
30	NC_013356	CATGC	2	10	48766	48775	20 %	20 %	20 %	40 %	260712924
31	NC_013356	AAATA	2	10	50501	50510	80 %	20 %	0 %	0 %	260712925
32	NC_013356	AATTA	2	10	50859	50868	60 %	40 %	0 %	0 %	260712925
33	NC_013356	TAATA	2	10	51396	51405	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013356	ATTTT	2	10	51479	51488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013356	AAAAT	2	10	51491	51500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013356	TAAAG	2	10	51786	51795	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013356	CCAGT	2	10	51921	51930	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.