MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIB 11163 plasmid pZA1001

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013356	ATTT	2	8	232	239	25 %	75 %	0 %	0 %	260712884
2	NC_013356	GGTT	2	8	792	799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013356	ATCT	2	8	914	921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013356	TTAA	2	8	1474	1481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013356	GGTC	2	8	2095	2102	0 %	25 %	50 %	25 %	260712888
6	NC_013356	TGAT	2	8	2378	2385	25 %	50 %	25 %	0 %	260712888
7	NC_013356	AACC	2	8	2456	2463	50 %	0 %	0 %	50 %	260712888
8	NC_013356	ACTT	2	8	2928	2935	25 %	50 %	0 %	25 %	260712888
9	NC_013356	ATTA	2	8	3395	3402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013356	ATCT	2	8	3430	3437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013356	ACCA	2	8	3837	3844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013356	ACGC	2	8	3876	3883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013356	ATAA	2	8	4161	4168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013356	CAAG	2	8	4375	4382	50 %	0 %	25 %	25 %	260712890
15	NC_013356	TGAG	2	8	4423	4430	25 %	25 %	50 %	0 %	260712890
16	NC_013356	CATT	2	8	4612	4619	25 %	50 %	0 %	25 %	260712891
17	NC_013356	GTAT	2	8	4885	4892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013356	GCAA	2	8	5964	5971	50 %	0 %	25 %	25 %	260712893
19	NC_013356	CGGA	2	8	5975	5982	25 %	0 %	50 %	25 %	260712893
20	NC_013356	ATTG	2	8	6269	6276	25 %	50 %	25 %	0 %	260712893
21	NC_013356	ATTC	2	8	6814	6821	25 %	50 %	0 %	25 %	260712895
22	NC_013356	TATT	2	8	6848	6855	25 %	75 %	0 %	0 %	260712895
23	NC_013356	CAAA	2	8	7692	7699	75 %	0 %	0 %	25 %	260712896
24	NC_013356	TAGG	2	8	8557	8564	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013356	GACG	2	8	8650	8657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013356	GATA	2	8	8914	8921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013356	GATA	2	8	9096	9103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013356	CCTT	2	8	9347	9354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013356	CCTT	2	8	9382	9389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013356	CAGT	2	8	9761	9768	25 %	25 %	25 %	25 %	260712898
31	NC_013356	AATA	2	8	9964	9971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013356	ACTT	2	8	10189	10196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013356	GCCA	2	8	10642	10649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013356	ATGA	2	8	11171	11178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013356	AGGC	2	8	11289	11296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013356	TTTA	2	8	12220	12227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013356	TGAT	2	8	12780	12787	25 %	50 %	25 %	0 %	260712899
38	NC_013356	GAAA	2	8	13285	13292	75 %	0 %	25 %	0 %	260712899
39	NC_013356	AATG	2	8	13732	13739	50 %	25 %	25 %	0 %	260712899
40	NC_013356	ATCA	2	8	13941	13948	50 %	25 %	0 %	25 %	260712899
41	NC_013356	CGGA	2	8	14897	14904	25 %	0 %	50 %	25 %	260712899
42	NC_013356	AAAC	2	8	15360	15367	75 %	0 %	0 %	25 %	260712900
43	NC_013356	TATT	2	8	15444	15451	25 %	75 %	0 %	0 %	260712900
44	NC_013356	ATTG	2	8	15779	15786	25 %	50 %	25 %	0 %	260712900
45	NC_013356	AAGG	2	8	16608	16615	50 %	0 %	50 %	0 %	260712900
46	NC_013356	AACC	2	8	16684	16691	50 %	0 %	0 %	50 %	260712900
47	NC_013356	TTGA	2	8	17070	17077	25 %	50 %	25 %	0 %	260712900
48	NC_013356	CAGA	2	8	18521	18528	50 %	0 %	25 %	25 %	260712901
49	NC_013356	CTTT	2	8	19690	19697	0 %	75 %	0 %	25 %	260712902
50	NC_013356	AATA	2	8	20382	20389	75 %	25 %	0 %	0 %	260712902
51	NC_013356	GCTA	2	8	20439	20446	25 %	25 %	25 %	25 %	260712902
52	NC_013356	TTCT	2	8	20657	20664	0 %	75 %	0 %	25 %	260712902
53	NC_013356	GATA	2	8	20787	20794	50 %	25 %	25 %	0 %	260712902
54	NC_013356	CAGG	2	8	20833	20840	25 %	0 %	50 %	25 %	260712902
55	NC_013356	TTCT	2	8	20954	20961	0 %	75 %	0 %	25 %	260712902
56	NC_013356	AAGT	2	8	21592	21599	50 %	25 %	25 %	0 %	260712903
57	NC_013356	CTTA	2	8	22432	22439	25 %	50 %	0 %	25 %	260712904
58	NC_013356	GGTA	2	8	22483	22490	25 %	25 %	50 %	0 %	260712904
59	NC_013356	AAGA	2	8	22773	22780	75 %	0 %	25 %	0 %	260712904
60	NC_013356	GATC	2	8	22918	22925	25 %	25 %	25 %	25 %	260712904
61	NC_013356	GATG	2	8	23412	23419	25 %	25 %	50 %	0 %	260712904
62	NC_013356	GTAG	2	8	23762	23769	25 %	25 %	50 %	0 %	260712905
63	NC_013356	ATTG	2	8	23936	23943	25 %	50 %	25 %	0 %	260712905
64	NC_013356	TATT	2	8	24336	24343	25 %	75 %	0 %	0 %	260712905
65	NC_013356	AATC	2	8	24545	24552	50 %	25 %	0 %	25 %	260712905
66	NC_013356	TATT	2	8	24862	24869	25 %	75 %	0 %	0 %	260712905
67	NC_013356	TAAC	2	8	25353	25360	50 %	25 %	0 %	25 %	260712905
68	NC_013356	ACCT	2	8	25701	25708	25 %	25 %	0 %	50 %	260712905
69	NC_013356	GAAG	2	8	25786	25793	50 %	0 %	50 %	0 %	260712905
70	NC_013356	TCGT	2	8	26004	26011	0 %	50 %	25 %	25 %	260712905
71	NC_013356	AGGC	2	8	28164	28171	25 %	0 %	50 %	25 %	260712909
72	NC_013356	CCAC	2	8	28372	28379	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_013356	CTAT	2	8	28630	28637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013356	TCAG	2	8	28655	28662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013356	CATG	2	8	28757	28764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013356	CGTC	2	8	28883	28890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013356	CCAA	2	8	29143	29150	50 %	0 %	0 %	50 %	260712910
78	NC_013356	AATA	2	8	29921	29928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013356	ATTA	2	8	31692	31699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013356	ATTA	2	8	32096	32103	50 %	50 %	0 %	0 %	260712912
81	NC_013356	GATA	2	8	32350	32357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013356	AATG	2	8	32370	32377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013356	ATTT	2	8	32536	32543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013356	AATG	2	8	32974	32981	50 %	25 %	25 %	0 %	260712913
85	NC_013356	TGGT	2	8	33006	33013	0 %	50 %	50 %	0 %	260712913
86	NC_013356	CTGA	2	8	33093	33100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013356	CTGA	2	8	33173	33180	25 %	25 %	25 %	25 %	260712914
88	NC_013356	GTTG	2	8	33650	33657	0 %	50 %	50 %	0 %	260712915
89	NC_013356	ATCA	2	8	34271	34278	50 %	25 %	0 %	25 %	260712915
90	NC_013356	CGGA	2	8	34288	34295	25 %	0 %	50 %	25 %	260712915
91	NC_013356	ATCG	2	8	34563	34570	25 %	25 %	25 %	25 %	260712915
92	NC_013356	TTAT	2	8	34733	34740	25 %	75 %	0 %	0 %	260712915
93	NC_013356	GCAG	2	8	34806	34813	25 %	0 %	50 %	25 %	260712915
94	NC_013356	ATGG	2	8	34936	34943	25 %	25 %	50 %	0 %	260712915
95	NC_013356	CGCC	2	8	34967	34974	0 %	0 %	25 %	75 %	260712915
96	NC_013356	ACAA	2	8	34982	34989	75 %	0 %	0 %	25 %	260712915
97	NC_013356	ACCG	2	8	35034	35041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013356	CTTA	2	8	35159	35166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013356	ATGG	2	8	35504	35511	25 %	25 %	50 %	0 %	260712916
100	NC_013356	CATT	2	8	35634	35641	25 %	50 %	0 %	25 %	260712916
101	NC_013356	TGGA	2	8	35704	35711	25 %	25 %	50 %	0 %	260712916
102	NC_013356	ACCA	2	8	35759	35766	50 %	0 %	0 %	50 %	260712916
103	NC_013356	TTGT	2	8	36261	36268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013356	AGCG	2	8	36309	36316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013356	GCTC	2	8	36439	36446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013356	AAGC	2	8	36685	36692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013356	AGCG	2	8	36811	36818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013356	TTCT	2	8	37269	37276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013356	AAAT	2	8	37538	37545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013356	CTTT	2	8	38414	38421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013356	ATCG	2	8	38499	38506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013356	AGCC	2	8	38727	38734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013356	GCTG	2	8	38858	38865	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013356	TATT	2	8	38914	38921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013356	TGTT	2	8	39236	39243	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013356	CGGT	2	8	39473	39480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013356	TTCC	2	8	40055	40062	0 %	50 %	0 %	50 %	260712917
118	NC_013356	ACTG	2	8	40984	40991	25 %	25 %	25 %	25 %	260712919
119	NC_013356	GAAC	2	8	41195	41202	50 %	0 %	25 %	25 %	260712919
120	NC_013356	CCTG	2	8	41317	41324	0 %	25 %	25 %	50 %	260712919
121	NC_013356	GACA	2	8	41419	41426	50 %	0 %	25 %	25 %	260712919
122	NC_013356	TGGT	2	8	41451	41458	0 %	50 %	50 %	0 %	260712919
123	NC_013356	TGTC	2	8	41550	41557	0 %	50 %	25 %	25 %	260712919
124	NC_013356	TGGT	2	8	43431	43438	0 %	50 %	50 %	0 %	260712920
125	NC_013356	TCCG	2	8	43868	43875	0 %	25 %	25 %	50 %	260712921
126	NC_013356	TTCG	2	8	44767	44774	0 %	50 %	25 %	25 %	260712922
127	NC_013356	CAGG	2	8	45297	45304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013356	CCGC	2	8	45894	45901	0 %	0 %	25 %	75 %	260712923
129	NC_013356	CTGC	2	8	46061	46068	0 %	25 %	25 %	50 %	260712923
130	NC_013356	CGGG	2	8	46483	46490	0 %	0 %	75 %	25 %	260712923
131	NC_013356	CATT	2	8	46567	46574	25 %	50 %	0 %	25 %	260712923
132	NC_013356	GACA	2	8	47596	47603	50 %	0 %	25 %	25 %	260712923
133	NC_013356	CCAT	2	8	48698	48705	25 %	25 %	0 %	50 %	260712924
134	NC_013356	ATCC	2	8	49266	49273	25 %	25 %	0 %	50 %	260712924
135	NC_013356	CTTT	2	8	49417	49424	0 %	75 %	0 %	25 %	260712924
136	NC_013356	GACT	2	8	50270	50277	25 %	25 %	25 %	25 %	260712925
137	NC_013356	TTCT	2	8	51183	51190	0 %	75 %	0 %	25 %	260712925
138	NC_013356	ATTA	2	8	51514	51521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013356	TATC	2	8	52367	52374	25 %	50 %	0 %	25 %	260712927
140	NC_013356	CTAT	2	8	52688	52695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.