MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIB 11163 plasmid pZA1001

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013356	GGTT	2	8	792	799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013356	ATCT	2	8	914	921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013356	TTAA	2	8	1474	1481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013356	ATTA	2	8	3395	3402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013356	ATCT	2	8	3430	3437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013356	ACCA	2	8	3837	3844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013356	ACGC	2	8	3876	3883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013356	ATAA	2	8	4161	4168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013356	GTAT	2	8	4885	4892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013356	TAGG	2	8	8557	8564	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013356	GACG	2	8	8650	8657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013356	GATA	2	8	8914	8921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013356	GATA	2	8	9096	9103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013356	CCTT	2	8	9347	9354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013356	CCTT	2	8	9382	9389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013356	AATA	2	8	9964	9971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013356	ACTT	2	8	10189	10196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013356	GCCA	2	8	10642	10649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013356	ATGA	2	8	11171	11178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013356	AGGC	2	8	11289	11296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013356	TTTA	2	8	12220	12227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013356	CCAC	2	8	28372	28379	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_013356	CTAT	2	8	28630	28637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013356	TCAG	2	8	28655	28662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013356	CATG	2	8	28757	28764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013356	CGTC	2	8	28883	28890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013356	AATA	2	8	29921	29928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013356	ATTA	2	8	31692	31699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013356	GATA	2	8	32350	32357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013356	AATG	2	8	32370	32377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013356	ATTT	2	8	32536	32543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013356	CTGA	2	8	33093	33100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013356	ACCG	2	8	35034	35041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013356	CTTA	2	8	35159	35166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013356	TTGT	2	8	36261	36268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013356	AGCG	2	8	36309	36316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013356	GCTC	2	8	36439	36446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013356	AAGC	2	8	36685	36692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013356	AGCG	2	8	36811	36818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013356	TTCT	2	8	37269	37276	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013356	AAAT	2	8	37538	37545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013356	CTTT	2	8	38414	38421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013356	ATCG	2	8	38499	38506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013356	AGCC	2	8	38727	38734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013356	GCTG	2	8	38858	38865	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013356	TATT	2	8	38914	38921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013356	TGTT	2	8	39236	39243	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013356	CGGT	2	8	39473	39480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013356	CAGG	2	8	45297	45304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013356	ATTA	2	8	51514	51521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013356	CTAT	2	8	52688	52695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.