MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIB 11163 plasmid pZA1001

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013356	ATTT	2	8	232	239	25 %	75 %	0 %	0 %	260712884
2	NC_013356	GGTC	2	8	2095	2102	0 %	25 %	50 %	25 %	260712888
3	NC_013356	TGAT	2	8	2378	2385	25 %	50 %	25 %	0 %	260712888
4	NC_013356	AACC	2	8	2456	2463	50 %	0 %	0 %	50 %	260712888
5	NC_013356	ACTT	2	8	2928	2935	25 %	50 %	0 %	25 %	260712888
6	NC_013356	CAAG	2	8	4375	4382	50 %	0 %	25 %	25 %	260712890
7	NC_013356	TGAG	2	8	4423	4430	25 %	25 %	50 %	0 %	260712890
8	NC_013356	CATT	2	8	4612	4619	25 %	50 %	0 %	25 %	260712891
9	NC_013356	GCAA	2	8	5964	5971	50 %	0 %	25 %	25 %	260712893
10	NC_013356	CGGA	2	8	5975	5982	25 %	0 %	50 %	25 %	260712893
11	NC_013356	ATTG	2	8	6269	6276	25 %	50 %	25 %	0 %	260712893
12	NC_013356	ATTC	2	8	6814	6821	25 %	50 %	0 %	25 %	260712895
13	NC_013356	TATT	2	8	6848	6855	25 %	75 %	0 %	0 %	260712895
14	NC_013356	CAAA	2	8	7692	7699	75 %	0 %	0 %	25 %	260712896
15	NC_013356	CAGT	2	8	9761	9768	25 %	25 %	25 %	25 %	260712898
16	NC_013356	TGAT	2	8	12780	12787	25 %	50 %	25 %	0 %	260712899
17	NC_013356	GAAA	2	8	13285	13292	75 %	0 %	25 %	0 %	260712899
18	NC_013356	AATG	2	8	13732	13739	50 %	25 %	25 %	0 %	260712899
19	NC_013356	ATCA	2	8	13941	13948	50 %	25 %	0 %	25 %	260712899
20	NC_013356	CGGA	2	8	14897	14904	25 %	0 %	50 %	25 %	260712899
21	NC_013356	AAAC	2	8	15360	15367	75 %	0 %	0 %	25 %	260712900
22	NC_013356	TATT	2	8	15444	15451	25 %	75 %	0 %	0 %	260712900
23	NC_013356	ATTG	2	8	15779	15786	25 %	50 %	25 %	0 %	260712900
24	NC_013356	AAGG	2	8	16608	16615	50 %	0 %	50 %	0 %	260712900
25	NC_013356	AACC	2	8	16684	16691	50 %	0 %	0 %	50 %	260712900
26	NC_013356	TTGA	2	8	17070	17077	25 %	50 %	25 %	0 %	260712900
27	NC_013356	CAGA	2	8	18521	18528	50 %	0 %	25 %	25 %	260712901
28	NC_013356	CTTT	2	8	19690	19697	0 %	75 %	0 %	25 %	260712902
29	NC_013356	AATA	2	8	20382	20389	75 %	25 %	0 %	0 %	260712902
30	NC_013356	GCTA	2	8	20439	20446	25 %	25 %	25 %	25 %	260712902
31	NC_013356	TTCT	2	8	20657	20664	0 %	75 %	0 %	25 %	260712902
32	NC_013356	GATA	2	8	20787	20794	50 %	25 %	25 %	0 %	260712902
33	NC_013356	CAGG	2	8	20833	20840	25 %	0 %	50 %	25 %	260712902
34	NC_013356	TTCT	2	8	20954	20961	0 %	75 %	0 %	25 %	260712902
35	NC_013356	AAGT	2	8	21592	21599	50 %	25 %	25 %	0 %	260712903
36	NC_013356	CTTA	2	8	22432	22439	25 %	50 %	0 %	25 %	260712904
37	NC_013356	GGTA	2	8	22483	22490	25 %	25 %	50 %	0 %	260712904
38	NC_013356	AAGA	2	8	22773	22780	75 %	0 %	25 %	0 %	260712904
39	NC_013356	GATC	2	8	22918	22925	25 %	25 %	25 %	25 %	260712904
40	NC_013356	GATG	2	8	23412	23419	25 %	25 %	50 %	0 %	260712904
41	NC_013356	GTAG	2	8	23762	23769	25 %	25 %	50 %	0 %	260712905
42	NC_013356	ATTG	2	8	23936	23943	25 %	50 %	25 %	0 %	260712905
43	NC_013356	TATT	2	8	24336	24343	25 %	75 %	0 %	0 %	260712905
44	NC_013356	AATC	2	8	24545	24552	50 %	25 %	0 %	25 %	260712905
45	NC_013356	TATT	2	8	24862	24869	25 %	75 %	0 %	0 %	260712905
46	NC_013356	TAAC	2	8	25353	25360	50 %	25 %	0 %	25 %	260712905
47	NC_013356	ACCT	2	8	25701	25708	25 %	25 %	0 %	50 %	260712905
48	NC_013356	GAAG	2	8	25786	25793	50 %	0 %	50 %	0 %	260712905
49	NC_013356	TCGT	2	8	26004	26011	0 %	50 %	25 %	25 %	260712905
50	NC_013356	AGGC	2	8	28164	28171	25 %	0 %	50 %	25 %	260712909
51	NC_013356	CCAA	2	8	29143	29150	50 %	0 %	0 %	50 %	260712910
52	NC_013356	ATTA	2	8	32096	32103	50 %	50 %	0 %	0 %	260712912
53	NC_013356	AATG	2	8	32974	32981	50 %	25 %	25 %	0 %	260712913
54	NC_013356	TGGT	2	8	33006	33013	0 %	50 %	50 %	0 %	260712913
55	NC_013356	CTGA	2	8	33173	33180	25 %	25 %	25 %	25 %	260712914
56	NC_013356	GTTG	2	8	33650	33657	0 %	50 %	50 %	0 %	260712915
57	NC_013356	ATCA	2	8	34271	34278	50 %	25 %	0 %	25 %	260712915
58	NC_013356	CGGA	2	8	34288	34295	25 %	0 %	50 %	25 %	260712915
59	NC_013356	ATCG	2	8	34563	34570	25 %	25 %	25 %	25 %	260712915
60	NC_013356	TTAT	2	8	34733	34740	25 %	75 %	0 %	0 %	260712915
61	NC_013356	GCAG	2	8	34806	34813	25 %	0 %	50 %	25 %	260712915
62	NC_013356	ATGG	2	8	34936	34943	25 %	25 %	50 %	0 %	260712915
63	NC_013356	CGCC	2	8	34967	34974	0 %	0 %	25 %	75 %	260712915
64	NC_013356	ACAA	2	8	34982	34989	75 %	0 %	0 %	25 %	260712915
65	NC_013356	ATGG	2	8	35504	35511	25 %	25 %	50 %	0 %	260712916
66	NC_013356	CATT	2	8	35634	35641	25 %	50 %	0 %	25 %	260712916
67	NC_013356	TGGA	2	8	35704	35711	25 %	25 %	50 %	0 %	260712916
68	NC_013356	ACCA	2	8	35759	35766	50 %	0 %	0 %	50 %	260712916
69	NC_013356	TTCC	2	8	40055	40062	0 %	50 %	0 %	50 %	260712917
70	NC_013356	ACTG	2	8	40984	40991	25 %	25 %	25 %	25 %	260712919
71	NC_013356	GAAC	2	8	41195	41202	50 %	0 %	25 %	25 %	260712919
72	NC_013356	CCTG	2	8	41317	41324	0 %	25 %	25 %	50 %	260712919
73	NC_013356	GACA	2	8	41419	41426	50 %	0 %	25 %	25 %	260712919
74	NC_013356	TGGT	2	8	41451	41458	0 %	50 %	50 %	0 %	260712919
75	NC_013356	TGTC	2	8	41550	41557	0 %	50 %	25 %	25 %	260712919
76	NC_013356	TGGT	2	8	43431	43438	0 %	50 %	50 %	0 %	260712920
77	NC_013356	TCCG	2	8	43868	43875	0 %	25 %	25 %	50 %	260712921
78	NC_013356	TTCG	2	8	44767	44774	0 %	50 %	25 %	25 %	260712922
79	NC_013356	CCGC	2	8	45894	45901	0 %	0 %	25 %	75 %	260712923
80	NC_013356	CTGC	2	8	46061	46068	0 %	25 %	25 %	50 %	260712923
81	NC_013356	CGGG	2	8	46483	46490	0 %	0 %	75 %	25 %	260712923
82	NC_013356	CATT	2	8	46567	46574	25 %	50 %	0 %	25 %	260712923
83	NC_013356	GACA	2	8	47596	47603	50 %	0 %	25 %	25 %	260712923
84	NC_013356	CCAT	2	8	48698	48705	25 %	25 %	0 %	50 %	260712924
85	NC_013356	ATCC	2	8	49266	49273	25 %	25 %	0 %	50 %	260712924
86	NC_013356	CTTT	2	8	49417	49424	0 %	75 %	0 %	25 %	260712924
87	NC_013356	GACT	2	8	50270	50277	25 %	25 %	25 %	25 %	260712925
88	NC_013356	TTCT	2	8	51183	51190	0 %	75 %	0 %	25 %	260712925
89	NC_013356	TATC	2	8	52367	52374	25 %	50 %	0 %	25 %	260712927

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.