MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIMB 11163 chromosome

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013355	TCCGAA	2	12	8820	8831	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013355	GCGAAA	2	12	17299	17310	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013355	TAATTT	2	12	36923	36934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013355	TGAAAA	2	12	44576	44587	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013355	ATTCTT	2	12	80347	80358	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013355	GACATC	2	12	80859	80870	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013355	TTTTTC	2	12	90874	90885	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013355	AAAATT	2	12	90896	90907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013355	TTTCCG	2	12	98368	98379	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013355	ATTTTT	2	12	110990	111001	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013355	AAAAAC	2	12	140045	140056	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013355	GCATCC	2	12	156262	156273	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013355	TTTTCT	2	12	186589	186600	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013355	CTTGGC	2	12	196429	196440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013355	CAAAAA	2	12	196594	196605	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013355	AGAAAT	2	12	265492	265503	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013355	AGAGAA	2	12	297764	297775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013355	GATAAA	2	12	301568	301579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013355	TAAGGC	2	12	346027	346038	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013355	ATCTAT	2	12	359696	359707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013355	AAAAAT	2	12	419236	419247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013355	TATCGC	2	12	433661	433672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013355	GACAAA	2	12	442915	442926	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013355	AAAATT	2	12	476698	476709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013355	TATTTT	2	12	515960	515971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013355	AAAGAT	2	12	548084	548095	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013355	TTGTCT	2	12	652686	652697	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013355	CACTTA	2	12	652798	652809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013355	AATATT	2	12	691608	691619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013355	GATCTA	2	12	721738	721749	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013355	TTTGCC	2	12	755177	755188	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013355	AGAAAA	2	12	773827	773838	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013355	AAAATC	2	12	800841	800852	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013355	AAACAT	2	12	800876	800887	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013355	TGATTT	2	12	804325	804336	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013355	AAAAAT	2	12	811956	811967	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013355	ATTTAT	2	12	835171	835182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013355	GCAAAA	2	12	837987	837998	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013355	TCGCTT	2	12	841607	841618	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013355	GAACAG	2	12	872725	872736	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013355	AAATTG	2	12	910439	910450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013355	CTTTTG	2	12	918779	918790	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013355	ATTTAT	3	18	991282	991299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013355	AAAATA	2	12	1088457	1088468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013355	AGCAGA	2	12	1126500	1126511	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013355	AATATA	2	12	1126631	1126642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013355	AATCGC	2	12	1130301	1130312	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013355	AGTGAC	2	12	1139332	1139343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013355	TTCAAA	2	12	1141435	1141446	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013355	CAAAAA	2	12	1142809	1142820	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013355	TTAAAA	2	12	1174928	1174939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013355	ATAAAA	2	12	1175221	1175232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013355	ATTTTT	2	12	1175272	1175283	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013355	AGAAAA	2	12	1186362	1186373	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013355	AAAGGA	2	12	1214501	1214512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013355	AAAAAG	2	12	1225404	1225415	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013355	AATAAA	2	12	1229468	1229479	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013355	CCGCCC	2	12	1241603	1241614	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
59	NC_013355	TAAAAA	2	12	1269293	1269304	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013355	TAAAAA	2	12	1285249	1285260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013355	AAGAGC	2	12	1308327	1308338	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013355	GGCAAA	2	12	1319573	1319584	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013355	AAAAGA	2	12	1332150	1332161	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013355	TAAAAA	2	12	1339854	1339865	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013355	TAAAAA	2	12	1370534	1370545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013355	AATTAA	2	12	1370550	1370561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013355	TAAAAA	2	12	1370621	1370632	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013355	ATTTAT	2	12	1380902	1380913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013355	AGGCTC	2	12	1420789	1420800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013355	TTTTAA	2	12	1439087	1439098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013355	CTGTTT	2	12	1476606	1476617	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013355	GATCCT	2	12	1492935	1492946	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013355	GTAGAG	2	12	1554645	1554656	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013355	AGGCAC	2	12	1555381	1555392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013355	CGGAAA	2	12	1555818	1555829	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013355	TATTGA	2	12	1613126	1613137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013355	GATAAA	2	12	1616023	1616034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013355	TCGGTA	2	12	1641762	1641773	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013355	TAAATA	2	12	1643710	1643721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013355	TATATT	2	12	1644109	1644120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013355	TTTCCT	2	12	1658766	1658777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013355	GACAGT	2	12	1677249	1677260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013355	ATTCTT	2	12	1694013	1694024	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013355	GAAAAG	2	12	1710234	1710245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013355	ATTTGT	2	12	1725579	1725590	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013355	GAATAA	2	12	1727401	1727412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013355	AAATCG	2	12	1734124	1734135	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013355	TTCTTT	2	12	1744149	1744160	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013355	GTTCTT	2	12	1753946	1753957	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013355	GCTTTT	2	12	1755810	1755821	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013355	TAAAAA	2	12	1771136	1771147	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013355	TTTAAT	2	12	1776087	1776098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013355	ATTTTT	2	12	1807114	1807125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013355	CAATAA	2	12	1825503	1825514	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013355	TTTAAT	2	12	1825646	1825657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013355	CTTTTC	2	12	1841939	1841950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013355	ATTTTT	2	12	1853983	1853994	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013355	TTTTAT	2	12	1859285	1859296	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013355	AAACAA	2	12	1864401	1864412	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013355	GATGGG	2	12	1888076	1888087	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013355	CAAAAA	2	12	1913869	1913880	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013355	ATTTTT	2	12	1920740	1920751	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013355	CACATA	2	12	1934510	1934521	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013355	GTGATT	2	12	1941217	1941228	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013355	ATTTAA	2	12	1952940	1952951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013355	ATCAAA	2	12	1976465	1976476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013355	ATTGAT	2	12	1981403	1981414	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013355	TATTTT	2	12	1982167	1982178	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013355	TAATTT	2	12	2006601	2006612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013355	ATGATA	2	12	2074943	2074954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013355	ATAAGT	2	12	2078411	2078422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013355	GAAAAA	2	12	2087386	2087397	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013355	TAAAAA	2	12	2119670	2119681	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.