MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis NCIMB 11163 chromosome

Total Repeats: 339

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013355	GCAAA	2	10	213	222	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013355	TATTT	2	10	3860	3869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013355	ACAAA	2	10	3898	3907	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013355	TGACG	2	10	26589	26598	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013355	AAAGC	2	10	33283	33292	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013355	CTTTG	2	10	37304	37313	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013355	ACCCC	2	10	57310	57319	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8	NC_013355	TAAAA	2	10	57387	57396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013355	GTCTT	2	10	70440	70449	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013355	TAAAA	2	10	90938	90947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013355	GTCAG	2	10	98447	98456	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013355	ATTGA	2	10	127269	127278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013355	CAGAA	2	10	128190	128199	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013355	GAAAA	2	10	130450	130459	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013355	AAAGG	2	10	134517	134526	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013355	ATATT	2	10	136218	136227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013355	TCCTA	2	10	138372	138381	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013355	TAAAA	2	10	138766	138775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013355	AATAA	2	10	142263	142272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013355	TAAAA	2	10	146446	146455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013355	ATGTT	2	10	161438	161447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013355	TTCCT	2	10	165194	165203	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013355	TTTCT	2	10	170914	170923	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013355	AATCT	2	10	189893	189902	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013355	TTGTT	2	10	196659	196668	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013355	GGGGT	2	10	203905	203914	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013355	TTTTA	2	10	217049	217058	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013355	GATAG	2	10	221289	221298	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013355	GGTCT	2	10	223547	223556	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013355	TCCAA	2	10	231530	231539	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013355	AAAGG	2	10	233253	233262	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013355	GAAAA	2	10	287574	287583	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013355	AAAAC	2	10	296173	296182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013355	AAAAT	2	10	311635	311644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013355	TAAAA	2	10	317910	317919	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013355	ATTTT	2	10	317920	317929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013355	ACCCT	2	10	333509	333518	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_013355	AAGAA	2	10	335855	335864	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013355	TTTAA	2	10	345931	345940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013355	TTCAT	2	10	360400	360409	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013355	CAATC	2	10	362294	362303	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013355	CTGTC	2	10	376073	376082	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013355	TTTTC	2	10	411954	411963	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013355	ATTAT	2	10	416761	416770	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013355	ATAGA	2	10	419281	419290	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013355	TAAAA	2	10	432937	432946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013355	GCCAG	2	10	433528	433537	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_013355	TCCAA	2	10	434679	434688	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_013355	TCCAA	2	10	434820	434829	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013355	ATCCA	2	10	435092	435101	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_013355	AGTTT	2	10	438835	438844	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013355	CTCAT	2	10	460383	460392	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013355	CATTT	2	10	460417	460426	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013355	ATGTT	2	10	460467	460476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013355	ATATC	2	10	475220	475229	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013355	TTTAT	2	10	481463	481472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013355	TTTAA	2	10	483399	483408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013355	TTTTA	2	10	497583	497592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013355	TTGTT	2	10	511626	511635	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013355	TAAAA	2	10	511928	511937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013355	TGATT	2	10	512057	512066	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013355	TATTC	2	10	516515	516524	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013355	TTTAA	2	10	516575	516584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013355	GAAAA	2	10	547201	547210	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013355	TTTAA	2	10	554202	554211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013355	AAATG	2	10	554439	554448	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013355	TAGGA	2	10	573532	573541	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013355	ATGTT	2	10	574537	574546	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013355	GTAAA	2	10	574703	574712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013355	GATAT	2	10	574813	574822	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013355	GAACC	2	10	589702	589711	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_013355	ATAAA	2	10	622492	622501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013355	TTTTA	2	10	625773	625782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013355	AAAAG	2	10	625849	625858	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013355	TTCAT	2	10	628102	628111	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013355	CTAAA	2	10	629580	629589	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013355	CATGA	2	10	631814	631823	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013355	TAAAA	2	10	631939	631948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013355	GAGAA	2	10	632430	632439	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013355	GAAAA	2	10	632853	632862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013355	ACCGC	2	10	642271	642280	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_013355	ATAAA	2	10	652738	652747	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013355	AAGGA	2	10	672379	672388	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013355	CTTTT	2	10	676158	676167	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013355	ATTTT	2	10	691762	691771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013355	AAATA	2	10	700650	700659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013355	ATTTT	2	10	746923	746932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013355	ATTTT	2	10	748444	748453	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013355	TTTTA	2	10	748799	748808	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013355	AGAAA	2	10	750610	750619	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013355	CATGC	2	10	752083	752092	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_013355	GCAAA	2	10	758923	758932	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013355	GATCT	2	10	770553	770562	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013355	AGCAT	2	10	771080	771089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013355	TCCGC	2	10	771162	771171	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_013355	AAAAT	2	10	790579	790588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013355	AATAA	2	10	800521	800530	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013355	ATTTT	2	10	805777	805786	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013355	CTTTT	2	10	810695	810704	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013355	TGACT	2	10	826618	826627	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013355	CCCTT	2	10	835841	835850	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
102	NC_013355	ATCTC	2	10	838430	838439	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_013355	GCCTA	2	10	841094	841103	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_013355	CAAAA	2	10	841669	841678	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013355	CCCTT	2	10	850652	850661	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_013355	TATTG	2	10	852385	852394	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013355	AATTA	2	10	855500	855509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013355	TTATC	2	10	866929	866938	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013355	CTATC	2	10	890700	890709	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_013355	GAAAA	2	10	890712	890721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013355	TCTTG	2	10	913987	913996	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_013355	GTAAT	2	10	921950	921959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013355	GTCGT	2	10	924645	924654	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_013355	TTATC	2	10	924736	924745	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013355	ACCCT	2	10	924788	924797	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_013355	ATGCT	2	10	933306	933315	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013355	CTAAT	2	10	934976	934985	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_013355	GCAAA	2	10	945847	945856	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013355	AAAGA	2	10	946116	946125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013355	AAAAT	2	10	963910	963919	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013355	AGGAC	2	10	964384	964393	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013355	ATAAA	2	10	973355	973364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013355	AGCCC	2	10	978032	978041	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
124	NC_013355	TAAAA	2	10	984906	984915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013355	GGCAT	2	10	992902	992911	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013355	TAATT	2	10	993691	993700	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013355	ATCAA	2	10	993859	993868	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013355	AAAAT	2	10	1007674	1007683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013355	AAAAG	2	10	1028016	1028025	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013355	AGTAA	2	10	1033192	1033201	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013355	AGAAA	2	10	1036957	1036966	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013355	GAAAG	2	10	1049020	1049029	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013355	TATCA	2	10	1050336	1050345	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_013355	TTTTA	2	10	1051476	1051485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013355	AAATA	2	10	1052815	1052824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013355	AATAA	2	10	1058807	1058816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013355	ATAAA	2	10	1062012	1062021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013355	TTCTT	2	10	1062607	1062616	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013355	CTTTT	2	10	1068675	1068684	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013355	AAAGA	2	10	1070161	1070170	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013355	GATTT	2	10	1071764	1071773	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013355	AATAG	2	10	1094156	1094165	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013355	AACAA	2	10	1107315	1107324	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_013355	AAAAG	2	10	1110465	1110474	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013355	GGATG	2	10	1137568	1137577	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013355	ATAAA	2	10	1137626	1137635	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013355	TGAAA	2	10	1138848	1138857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013355	ATTTT	2	10	1139095	1139104	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013355	GCTGA	2	10	1150602	1150611	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
150	NC_013355	TAATA	2	10	1153468	1153477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013355	TCATA	2	10	1153493	1153502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_013355	TAAAA	2	10	1153958	1153967	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013355	TAAAA	2	10	1154771	1154780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013355	TAAAA	2	10	1161092	1161101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_013355	AAAAT	2	10	1174856	1174865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013355	AGAAT	2	10	1175057	1175066	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013355	CATTT	2	10	1175286	1175295	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_013355	TAAAA	2	10	1194200	1194209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013355	CCTCA	2	10	1197515	1197524	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
163	NC_013355	ATTTT	2	10	1198119	1198128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013355	AAATA	2	10	1198188	1198197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013355	TTATC	2	10	1200349	1200358	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_013355	TAAAA	2	10	1204878	1204887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013355	GAACA	2	10	1212438	1212447	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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180	NC_013355	GGCTC	2	10	1254679	1254688	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
181	NC_013355	GGCTC	2	10	1254692	1254701	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
182	NC_013355	GGCTC	2	10	1254705	1254714	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
183	NC_013355	GGCTC	2	10	1254718	1254727	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
184	NC_013355	GGCTC	2	10	1254731	1254740	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
185	NC_013355	GGCTC	2	10	1254744	1254753	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
186	NC_013355	GGCTC	2	10	1254757	1254766	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_013355	ATTTA	2	10	1269495	1269504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_013355	TTTTA	2	10	1285185	1285194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_013355	TTATT	2	10	1293916	1293925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_013355	AAATT	2	10	1332133	1332142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_013355	GCCTT	2	10	1337030	1337039	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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250	NC_013355	ATGGG	2	10	1638378	1638387	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
251	NC_013355	GTCCT	2	10	1643790	1643799	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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269	NC_013355	TTCTG	2	10	1706858	1706867	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_013355	AATCT	2	10	1717059	1717068	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_013355	TTATA	2	10	1722273	1722282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_013355	ATTCT	2	10	1724112	1724121	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_013355	CCTGT	2	10	1731919	1731928	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
274	NC_013355	TATTT	2	10	1734324	1734333	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_013355	TTTAA	2	10	1738234	1738243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_013355	AAAAT	2	10	1762868	1762877	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013355	TTATT	2	10	1771036	1771045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013355	ATAGA	2	10	1776198	1776207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013355	ATATT	2	10	1783404	1783413	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_013355	AGAAA	2	10	1804792	1804801	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_013355	GATAA	2	10	1820580	1820589	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_013355	ACTCT	2	10	1820590	1820599	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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335	NC_013355	CATGA	2	10	2111451	2111460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
336	NC_013355	AAATA	2	10	2112846	2112855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
337	NC_013355	AAAAT	2	10	2119611	2119620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
338	NC_013355	TTTTC	2	10	2123959	2123968	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
339	NC_013355	AAAAG	2	10	2124021	2124030	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.