Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103
Total Repeats: 26
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_013354 | CACCAG | 2 | 12 | 2318 | 2329 | 33.33 % | 0 % | 16.67 % | 50 % | 260718931 |
2 | NC_013354 | AAATAA | 2 | 12 | 3553 | 3564 | 83.33 % | 16.67 % | 0 % | 0 % | 260718932 |
3 | NC_013354 | GCGAAG | 2 | 12 | 4449 | 4460 | 33.33 % | 0 % | 50 % | 16.67 % | 260718933 |
4 | NC_013354 | TTTTCC | 2 | 12 | 5633 | 5644 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 260718934 |
5 | NC_013354 | ATAAGG | 2 | 12 | 8449 | 8460 | 50 % | 16.67 % | 33.33 % | 0 % | 260718936 |
6 | NC_013354 | TAGAGG | 2 | 12 | 9614 | 9625 | 33.33 % | 16.67 % | 50 % | 0 % | 260718938 |
7 | NC_013354 | GTGAAT | 2 | 12 | 10925 | 10936 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 260718940 |
8 | NC_013354 | GCAGAA | 2 | 12 | 16449 | 16460 | 50 % | 0 % | 33.33 % | 16.67 % | 260718946 |
9 | NC_013354 | AACAGA | 2 | 12 | 25675 | 25686 | 66.67 % | 0 % | 16.67 % | 16.67 % | 260718955 |
10 | NC_013354 | ATTAAA | 2 | 12 | 32112 | 32123 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 260718958 |
11 | NC_013354 | GCAGAA | 2 | 12 | 34200 | 34211 | 50 % | 0 % | 33.33 % | 16.67 % | 260718960 |
12 | NC_013354 | ACATCA | 2 | 12 | 34461 | 34472 | 50 % | 16.67 % | 0 % | 33.33 % | Non-Coding |
13 | NC_013354 | ACAGTT | 2 | 12 | 35947 | 35958 | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 16.67 % | Non-Coding |
14 | NC_013354 | TTGGTG | 2 | 12 | 37093 | 37104 | 0 % | 50 % | 50 % | 0 % | Non-Coding |
15 | NC_013354 | TGTAAG | 2 | 12 | 38320 | 38331 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 260718961 |
16 | NC_013354 | TTCTGC | 2 | 12 | 39645 | 39656 | 0 % | 50 % | 16.67 % | 33.33 % | 260718963 |
17 | NC_013354 | ATGTGG | 2 | 12 | 45758 | 45769 | 16.67 % | 33.33 % | 50 % | 0 % | 260718965 |
18 | NC_013354 | TGCCCT | 2 | 12 | 46857 | 46868 | 0 % | 33.33 % | 16.67 % | 50 % | 260718965 |
19 | NC_013354 | CGGGAG | 2 | 12 | 48154 | 48165 | 16.67 % | 0 % | 66.67 % | 16.67 % | 260718965 |
20 | NC_013354 | AACACG | 2 | 12 | 48305 | 48316 | 50 % | 0 % | 16.67 % | 33.33 % | 260718966 |
21 | NC_013354 | TGGGGA | 2 | 12 | 48572 | 48583 | 16.67 % | 16.67 % | 66.67 % | 0 % | 260718966 |
22 | NC_013354 | TATCCA | 2 | 12 | 57955 | 57966 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 260718978 |
23 | NC_013354 | GTGTCA | 2 | 12 | 58153 | 58164 | 16.67 % | 33.33 % | 33.33 % | 16.67 % | 260718978 |
24 | NC_013354 | TCCTCT | 2 | 12 | 68485 | 68496 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 260718992 |
25 | NC_013354 | TCTGGT | 2 | 12 | 72152 | 72163 | 0 % | 50 % | 33.33 % | 16.67 % | 260718994 |
26 | NC_013354 | TTGAAA | 2 | 12 | 73442 | 73453 | 50 % | 33.33 % | 16.67 % | 0 % | Non-Coding |