MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013354	CACCAG	2	12	2318	2329	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260718931
2	NC_013354	AAATAA	2	12	3553	3564	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	260718932
3	NC_013354	GCGAAG	2	12	4449	4460	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	260718933
4	NC_013354	TTTTCC	2	12	5633	5644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260718934
5	NC_013354	ATAAGG	2	12	8449	8460	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	260718936
6	NC_013354	TAGAGG	2	12	9614	9625	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	260718938
7	NC_013354	GTGAAT	2	12	10925	10936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718940
8	NC_013354	GCAGAA	2	12	16449	16460	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260718946
9	NC_013354	AACAGA	2	12	25675	25686	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	260718955
10	NC_013354	ATTAAA	2	12	32112	32123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718958
11	NC_013354	GCAGAA	2	12	34200	34211	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	260718960
12	NC_013354	TGTAAG	2	12	38320	38331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718961
13	NC_013354	TTCTGC	2	12	39645	39656	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260718963
14	NC_013354	ATGTGG	2	12	45758	45769	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260718965
15	NC_013354	TGCCCT	2	12	46857	46868	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260718965
16	NC_013354	CGGGAG	2	12	48154	48165	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260718965
17	NC_013354	AACACG	2	12	48305	48316	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260718966
18	NC_013354	TGGGGA	2	12	48572	48583	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	260718966
19	NC_013354	TATCCA	2	12	57955	57966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718978
20	NC_013354	GTGTCA	2	12	58153	58164	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260718978
21	NC_013354	TCCTCT	2	12	68485	68496	0 %	50 %	0 %	50 %	260718992
22	NC_013354	TCTGGT	2	12	72152	72163	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	260718994

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.