MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013354	CGTTC	2	10	2705	2714	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_013354	CGGCA	2	10	2990	2999	20 %	0 %	40 %	40 %	260718932
3	NC_013354	ATGCT	2	10	5206	5215	20 %	40 %	20 %	20 %	260718933
4	NC_013354	CCCGG	2	10	8709	8718	0 %	0 %	40 %	60 %	260718936
5	NC_013354	GAGGT	2	10	9210	9219	20 %	20 %	60 %	0 %	260718937
6	NC_013354	GAGGT	2	10	11665	11674	20 %	20 %	60 %	0 %	260718941
7	NC_013354	AGTGG	2	10	12625	12634	20 %	20 %	60 %	0 %	260718942
8	NC_013354	TCGTT	2	10	13627	13636	0 %	60 %	20 %	20 %	260718943
9	NC_013354	GTTCA	2	10	14708	14717	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013354	TGGTA	2	10	19609	19618	20 %	40 %	40 %	0 %	260718948
11	NC_013354	GTTCC	2	10	21448	21457	0 %	40 %	20 %	40 %	260718949
12	NC_013354	TCCAT	2	10	25358	25367	20 %	40 %	0 %	40 %	260718954
13	NC_013354	AAGAG	2	10	26702	26711	60 %	0 %	40 %	0 %	260718955
14	NC_013354	GTTCT	2	10	27080	27089	0 %	60 %	20 %	20 %	260718956
15	NC_013354	TGACC	2	10	27786	27795	20 %	20 %	20 %	40 %	260718956
16	NC_013354	ATAAC	2	10	28130	28139	60 %	20 %	0 %	20 %	260718956
17	NC_013354	GAATC	2	10	29181	29190	40 %	20 %	20 %	20 %	260718957
18	NC_013354	TTTAT	2	10	32073	32082	20 %	80 %	0 %	0 %	260718957
19	NC_013354	TTATA	2	10	32797	32806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013354	GCTGG	2	10	35352	35361	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013354	GCGCA	2	10	36950	36959	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013354	CACGG	2	10	41419	41428	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013354	GTGCT	2	10	41871	41880	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013354	GACCT	2	10	43243	43252	20 %	20 %	20 %	40 %	260718965
25	NC_013354	ACCTG	2	10	48030	48039	20 %	20 %	20 %	40 %	260718965
26	NC_013354	CTGGT	2	10	48368	48377	0 %	40 %	40 %	20 %	260718966
27	NC_013354	GAACG	2	10	48819	48828	40 %	0 %	40 %	20 %	260718966
28	NC_013354	CCGGG	2	10	51528	51537	0 %	0 %	60 %	40 %	260718970
29	NC_013354	ACGTA	2	10	55889	55898	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013354	CTTCT	2	10	56344	56353	0 %	60 %	0 %	40 %	260718977
31	NC_013354	ACATA	2	10	56972	56981	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013354	CAGCT	2	10	57087	57096	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013354	ATTTT	2	10	59367	59376	20 %	80 %	0 %	0 %	260718980
34	NC_013354	TGGCA	2	10	60221	60230	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013354	AAAGA	2	10	60580	60589	80 %	0 %	20 %	0 %	260718983
36	NC_013354	CAGTA	2	10	60869	60878	40 %	20 %	20 %	20 %	260718983
37	NC_013354	ACCGG	2	10	64213	64222	20 %	0 %	40 %	40 %	260718985
38	NC_013354	CGCGG	2	10	64346	64355	0 %	0 %	60 %	40 %	260718985
39	NC_013354	ACGGG	2	10	64398	64407	20 %	0 %	60 %	20 %	260718985
40	NC_013354	GCTGG	2	10	65044	65053	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013354	ATGGA	2	10	65672	65681	40 %	20 %	40 %	0 %	260718987
42	NC_013354	CCGCC	2	10	66715	66724	0 %	0 %	20 %	80 %	260718988
43	NC_013354	GGCAC	2	10	67184	67193	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_013354	TGTAC	2	10	67685	67694	20 %	40 %	20 %	20 %	260718990
45	NC_013354	GGAAG	2	10	68361	68370	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013354	GGCGG	2	10	68542	68551	0 %	0 %	80 %	20 %	260718992
47	NC_013354	CCGCT	2	10	71893	71902	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_013354	TGGCA	2	10	72482	72491	20 %	20 %	40 %	20 %	260718994
49	NC_013354	TTTAT	2	10	72922	72931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.