MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013354	CGGCA	2	10	2990	2999	20 %	0 %	40 %	40 %	260718932
2	NC_013354	ATGCT	2	10	5206	5215	20 %	40 %	20 %	20 %	260718933
3	NC_013354	CCCGG	2	10	8709	8718	0 %	0 %	40 %	60 %	260718936
4	NC_013354	GAGGT	2	10	9210	9219	20 %	20 %	60 %	0 %	260718937
5	NC_013354	GAGGT	2	10	11665	11674	20 %	20 %	60 %	0 %	260718941
6	NC_013354	AGTGG	2	10	12625	12634	20 %	20 %	60 %	0 %	260718942
7	NC_013354	TCGTT	2	10	13627	13636	0 %	60 %	20 %	20 %	260718943
8	NC_013354	TGGTA	2	10	19609	19618	20 %	40 %	40 %	0 %	260718948
9	NC_013354	GTTCC	2	10	21448	21457	0 %	40 %	20 %	40 %	260718949
10	NC_013354	TCCAT	2	10	25358	25367	20 %	40 %	0 %	40 %	260718954
11	NC_013354	AAGAG	2	10	26702	26711	60 %	0 %	40 %	0 %	260718955
12	NC_013354	GTTCT	2	10	27080	27089	0 %	60 %	20 %	20 %	260718956
13	NC_013354	TGACC	2	10	27786	27795	20 %	20 %	20 %	40 %	260718956
14	NC_013354	ATAAC	2	10	28130	28139	60 %	20 %	0 %	20 %	260718956
15	NC_013354	GAATC	2	10	29181	29190	40 %	20 %	20 %	20 %	260718957
16	NC_013354	TTTAT	2	10	32073	32082	20 %	80 %	0 %	0 %	260718957
17	NC_013354	GACCT	2	10	43243	43252	20 %	20 %	20 %	40 %	260718965
18	NC_013354	ACCTG	2	10	48030	48039	20 %	20 %	20 %	40 %	260718965
19	NC_013354	CTGGT	2	10	48368	48377	0 %	40 %	40 %	20 %	260718966
20	NC_013354	GAACG	2	10	48819	48828	40 %	0 %	40 %	20 %	260718966
21	NC_013354	CCGGG	2	10	51528	51537	0 %	0 %	60 %	40 %	260718970
22	NC_013354	CTTCT	2	10	56344	56353	0 %	60 %	0 %	40 %	260718977
23	NC_013354	ATTTT	2	10	59367	59376	20 %	80 %	0 %	0 %	260718980
24	NC_013354	AAAGA	2	10	60580	60589	80 %	0 %	20 %	0 %	260718983
25	NC_013354	CAGTA	2	10	60869	60878	40 %	20 %	20 %	20 %	260718983
26	NC_013354	ACCGG	2	10	64213	64222	20 %	0 %	40 %	40 %	260718985
27	NC_013354	CGCGG	2	10	64346	64355	0 %	0 %	60 %	40 %	260718985
28	NC_013354	ACGGG	2	10	64398	64407	20 %	0 %	60 %	20 %	260718985
29	NC_013354	ATGGA	2	10	65672	65681	40 %	20 %	40 %	0 %	260718987
30	NC_013354	CCGCC	2	10	66715	66724	0 %	0 %	20 %	80 %	260718988
31	NC_013354	TGTAC	2	10	67685	67694	20 %	40 %	20 %	20 %	260718990
32	NC_013354	GGCGG	2	10	68542	68551	0 %	0 %	80 %	20 %	260718992
33	NC_013354	TGGCA	2	10	72482	72491	20 %	20 %	40 %	20 %	260718994

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.