MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013354	CATG	2	8	20	27	25 %	25 %	25 %	25 %	260718931
2	NC_013354	ATTT	2	8	88	95	25 %	75 %	0 %	0 %	260718931
3	NC_013354	CCTC	2	8	328	335	0 %	25 %	0 %	75 %	260718931
4	NC_013354	AAAC	2	8	441	448	75 %	0 %	0 %	25 %	260718931
5	NC_013354	CTGC	2	8	754	761	0 %	25 %	25 %	50 %	260718931
6	NC_013354	GAAG	2	8	999	1006	50 %	0 %	50 %	0 %	260718931
7	NC_013354	CTAC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	0 %	50 %	260718931
8	NC_013354	GAAA	2	8	1965	1972	75 %	0 %	25 %	0 %	260718931
9	NC_013354	TAAA	2	8	2651	2658	75 %	25 %	0 %	0 %	260718931
10	NC_013354	ACAG	2	8	3142	3149	50 %	0 %	25 %	25 %	260718932
11	NC_013354	TTCT	2	8	3858	3865	0 %	75 %	0 %	25 %	260718933
12	NC_013354	AAAG	2	8	4266	4273	75 %	0 %	25 %	0 %	260718933
13	NC_013354	CTGA	2	8	5960	5967	25 %	25 %	25 %	25 %	260718934
14	NC_013354	TCAG	2	8	6474	6481	25 %	25 %	25 %	25 %	260718934
15	NC_013354	ACTG	2	8	6613	6620	25 %	25 %	25 %	25 %	260718934
16	NC_013354	CTGA	2	8	7743	7750	25 %	25 %	25 %	25 %	260718935
17	NC_013354	TGGC	2	8	8239	8246	0 %	25 %	50 %	25 %	260718935
18	NC_013354	TGGC	2	8	9458	9465	0 %	25 %	50 %	25 %	260718938
19	NC_013354	GGGA	2	8	9580	9587	25 %	0 %	75 %	0 %	260718938
20	NC_013354	GTAA	2	8	10263	10270	50 %	25 %	25 %	0 %	260718939
21	NC_013354	ATTA	2	8	10607	10614	50 %	50 %	0 %	0 %	260718940
22	NC_013354	GATC	2	8	10732	10739	25 %	25 %	25 %	25 %	260718940
23	NC_013354	GCCA	2	8	10811	10818	25 %	0 %	25 %	50 %	260718940
24	NC_013354	GCTG	2	8	10963	10970	0 %	25 %	50 %	25 %	260718940
25	NC_013354	CAGC	2	8	11173	11180	25 %	0 %	25 %	50 %	260718940
26	NC_013354	GAGG	2	8	11245	11252	25 %	0 %	75 %	0 %	260718940
27	NC_013354	AACA	2	8	11269	11276	75 %	0 %	0 %	25 %	260718941
28	NC_013354	AGGC	2	8	11282	11289	25 %	0 %	50 %	25 %	260718941
29	NC_013354	GGTT	2	8	11339	11346	0 %	50 %	50 %	0 %	260718941
30	NC_013354	CAGA	2	8	11447	11454	50 %	0 %	25 %	25 %	260718941
31	NC_013354	GCAG	2	8	12330	12337	25 %	0 %	50 %	25 %	260718941
32	NC_013354	TTAT	2	8	13379	13386	25 %	75 %	0 %	0 %	260718943
33	NC_013354	TCTG	2	8	13599	13606	0 %	50 %	25 %	25 %	260718943
34	NC_013354	AGCT	2	8	13671	13678	25 %	25 %	25 %	25 %	260718943
35	NC_013354	ATGG	2	8	13693	13700	25 %	25 %	50 %	0 %	260718943
36	NC_013354	TCAG	2	8	13736	13743	25 %	25 %	25 %	25 %	260718943
37	NC_013354	GTAT	2	8	16211	16218	25 %	50 %	25 %	0 %	260718946
38	NC_013354	GTGG	2	8	16391	16398	0 %	25 %	75 %	0 %	260718946
39	NC_013354	AATA	2	8	16654	16661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013354	AAAT	2	8	17081	17088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013354	AATA	2	8	17148	17155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013354	CTGC	2	8	17251	17258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013354	ACGT	2	8	18271	18278	25 %	25 %	25 %	25 %	260718947
44	NC_013354	GCAG	2	8	18280	18287	25 %	0 %	50 %	25 %	260718947
45	NC_013354	TTAT	2	8	18605	18612	25 %	75 %	0 %	0 %	260718947
46	NC_013354	GGCT	2	8	18696	18703	0 %	25 %	50 %	25 %	260718947
47	NC_013354	TAAT	2	8	18782	18789	50 %	50 %	0 %	0 %	260718947
48	NC_013354	CCTT	2	8	18982	18989	0 %	50 %	0 %	50 %	260718948
49	NC_013354	CGGG	2	8	19665	19672	0 %	0 %	75 %	25 %	260718948
50	NC_013354	CAGC	2	8	19791	19798	25 %	0 %	25 %	50 %	260718948
51	NC_013354	TGAA	2	8	20630	20637	50 %	25 %	25 %	0 %	260718949
52	NC_013354	GCAG	2	8	20937	20944	25 %	0 %	50 %	25 %	260718949
53	NC_013354	ACCA	2	8	20965	20972	50 %	0 %	0 %	50 %	260718949
54	NC_013354	GCAG	2	8	21822	21829	25 %	0 %	50 %	25 %	260718950
55	NC_013354	GCAC	2	8	22387	22394	25 %	0 %	25 %	50 %	260718950
56	NC_013354	TCGT	2	8	22695	22702	0 %	50 %	25 %	25 %	260718950
57	NC_013354	TCAG	2	8	22842	22849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013354	CCAC	2	8	23369	23376	25 %	0 %	0 %	75 %	260718951
59	NC_013354	ATAC	2	8	23549	23556	50 %	25 %	0 %	25 %	260718951
60	NC_013354	CCAC	2	8	23750	23757	25 %	0 %	0 %	75 %	260718951
61	NC_013354	TCTT	2	8	23992	23999	0 %	75 %	0 %	25 %	260718951
62	NC_013354	AAAC	2	8	24540	24547	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013354	ATTT	2	8	24747	24754	25 %	75 %	0 %	0 %	260718953
64	NC_013354	CTTT	2	8	25143	25150	0 %	75 %	0 %	25 %	260718954
65	NC_013354	GAAC	2	8	25278	25285	50 %	0 %	25 %	25 %	260718954
66	NC_013354	GATA	2	8	25323	25330	50 %	25 %	25 %	0 %	260718954
67	NC_013354	GTTT	2	8	25400	25407	0 %	75 %	25 %	0 %	260718954
68	NC_013354	TTAT	2	8	25472	25479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013354	TGTA	2	8	25885	25892	25 %	50 %	25 %	0 %	260718955
70	NC_013354	CTTC	2	8	26216	26223	0 %	50 %	0 %	50 %	260718955
71	NC_013354	AGAA	2	8	26452	26459	75 %	0 %	25 %	0 %	260718955
72	NC_013354	CCAT	2	8	27861	27868	25 %	25 %	0 %	50 %	260718956
73	NC_013354	TATT	2	8	28023	28030	25 %	75 %	0 %	0 %	260718956
74	NC_013354	GCAA	2	8	28337	28344	50 %	0 %	25 %	25 %	260718956
75	NC_013354	GCAA	2	8	28994	29001	50 %	0 %	25 %	25 %	260718956
76	NC_013354	TCCA	2	8	29645	29652	25 %	25 %	0 %	50 %	260718957
77	NC_013354	CATA	2	8	30124	30131	50 %	25 %	0 %	25 %	260718957
78	NC_013354	TTTC	2	8	30456	30463	0 %	75 %	0 %	25 %	260718957
79	NC_013354	TAAT	2	8	30618	30625	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
80	NC_013354	AGCA	2	8	30752	30759	50 %	0 %	25 %	25 %	260718957
81	NC_013354	CATT	2	8	30840	30847	25 %	50 %	0 %	25 %	260718957
82	NC_013354	TATT	2	8	31018	31025	25 %	75 %	0 %	0 %	260718957
83	NC_013354	GCTC	2	8	31137	31144	0 %	25 %	25 %	50 %	260718957
84	NC_013354	GAAA	2	8	31166	31173	75 %	0 %	25 %	0 %	260718957
85	NC_013354	TTTC	2	8	32099	32106	0 %	75 %	0 %	25 %	260718958
86	NC_013354	CTTT	2	8	32349	32356	0 %	75 %	0 %	25 %	260718958
87	NC_013354	TAAA	2	8	32616	32623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013354	CCAA	2	8	32731	32738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013354	GTAT	2	8	33962	33969	25 %	50 %	25 %	0 %	260718960
90	NC_013354	GTGG	2	8	34142	34149	0 %	25 %	75 %	0 %	260718960
91	NC_013354	CCGC	2	8	35127	35134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_013354	GGAG	2	8	35168	35175	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013354	TGAA	2	8	35183	35190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013354	CAGC	2	8	35980	35987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013354	CAGC	2	8	36064	36071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013354	GTCC	2	8	36242	36249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013354	GATG	2	8	36695	36702	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013354	CGGT	2	8	36727	36734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013354	TCAG	2	8	36853	36860	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013354	GCCA	2	8	37188	37195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013354	TGAG	2	8	38668	38675	25 %	25 %	50 %	0 %	260718962
102	NC_013354	AATC	2	8	39262	39269	50 %	25 %	0 %	25 %	260718962
103	NC_013354	GAAA	2	8	39353	39360	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013354	AAAT	2	8	39363	39370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013354	AAAT	2	8	39394	39401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013354	GACT	2	8	39508	39515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013354	CCAC	2	8	39707	39714	25 %	0 %	0 %	75 %	260718963
108	NC_013354	ATAC	2	8	39887	39894	50 %	25 %	0 %	25 %	260718963
109	NC_013354	CCAC	2	8	40088	40095	25 %	0 %	0 %	75 %	260718963
110	NC_013354	TCTT	2	8	40330	40337	0 %	75 %	0 %	25 %	260718963
111	NC_013354	TCTG	2	8	41411	41418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013354	GGCT	2	8	41987	41994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013354	CGGA	2	8	43184	43191	25 %	0 %	50 %	25 %	260718965
114	NC_013354	TGAT	2	8	43307	43314	25 %	50 %	25 %	0 %	260718965
115	NC_013354	CGGA	2	8	43382	43389	25 %	0 %	50 %	25 %	260718965
116	NC_013354	CGCA	2	8	43906	43913	25 %	0 %	25 %	50 %	260718965
117	NC_013354	CCGT	2	8	44289	44296	0 %	25 %	25 %	50 %	260718965
118	NC_013354	TCGC	2	8	44412	44419	0 %	25 %	25 %	50 %	260718965
119	NC_013354	CTGG	2	8	44913	44920	0 %	25 %	50 %	25 %	260718965
120	NC_013354	CCGG	2	8	45117	45124	0 %	0 %	50 %	50 %	260718965
121	NC_013354	GCGA	2	8	45146	45153	25 %	0 %	50 %	25 %	260718965
122	NC_013354	GGGC	2	8	45253	45260	0 %	0 %	75 %	25 %	260718965
123	NC_013354	CCTG	2	8	45273	45280	0 %	25 %	25 %	50 %	260718965
124	NC_013354	CGGA	2	8	47126	47133	25 %	0 %	50 %	25 %	260718965
125	NC_013354	GGCG	2	8	47263	47270	0 %	0 %	75 %	25 %	260718965
126	NC_013354	GCCG	2	8	47488	47495	0 %	0 %	50 %	50 %	260718965
127	NC_013354	CAGG	2	8	47509	47516	25 %	0 %	50 %	25 %	260718965
128	NC_013354	GTGG	2	8	48693	48700	0 %	25 %	75 %	0 %	260718966
129	NC_013354	CAGT	2	8	48786	48793	25 %	25 %	25 %	25 %	260718966
130	NC_013354	CAGC	2	8	49478	49485	25 %	0 %	25 %	50 %	260718967
131	NC_013354	ATGA	2	8	49524	49531	50 %	25 %	25 %	0 %	260718967
132	NC_013354	CAGC	2	8	49747	49754	25 %	0 %	25 %	50 %	260718967
133	NC_013354	ATGC	2	8	49873	49880	25 %	25 %	25 %	25 %	260718967
134	NC_013354	TGCC	2	8	50480	50487	0 %	25 %	25 %	50 %	260718968
135	NC_013354	CCTC	2	8	50628	50635	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_013354	TGGA	2	8	50847	50854	25 %	25 %	50 %	0 %	260718969
137	NC_013354	GACA	2	8	51399	51406	50 %	0 %	25 %	25 %	260718970
138	NC_013354	GAAT	2	8	51503	51510	50 %	25 %	25 %	0 %	260718970
139	NC_013354	TAAA	2	8	51666	51673	75 %	25 %	0 %	0 %	260718970
140	NC_013354	TCAT	2	8	51689	51696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013354	TAAT	2	8	51938	51945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013354	CTGA	2	8	52245	52252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013354	CCAC	2	8	52399	52406	25 %	0 %	0 %	75 %	260718972
144	NC_013354	ATAC	2	8	52579	52586	50 %	25 %	0 %	25 %	260718972
145	NC_013354	CCAC	2	8	52780	52787	25 %	0 %	0 %	75 %	260718972
146	NC_013354	TCTT	2	8	53022	53029	0 %	75 %	0 %	25 %	260718972
147	NC_013354	CGGA	2	8	54106	54113	25 %	0 %	50 %	25 %	260718974
148	NC_013354	AATC	2	8	54773	54780	50 %	25 %	0 %	25 %	260718975
149	NC_013354	ATGA	2	8	54837	54844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013354	TTCA	2	8	55218	55225	25 %	50 %	0 %	25 %	260718976
151	NC_013354	CAAA	2	8	56079	56086	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013354	AGTG	2	8	56334	56341	25 %	25 %	50 %	0 %	260718977
153	NC_013354	GTGC	2	8	56494	56501	0 %	25 %	50 %	25 %	260718977
154	NC_013354	CGCC	2	8	56512	56519	0 %	0 %	25 %	75 %	260718977
155	NC_013354	CTGG	2	8	56785	56792	0 %	25 %	50 %	25 %	260718977
156	NC_013354	CGGG	2	8	56880	56887	0 %	0 %	75 %	25 %	260718977
157	NC_013354	ACAG	2	8	57097	57104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_013354	CACT	2	8	57143	57150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_013354	GACT	2	8	57295	57302	25 %	25 %	25 %	25 %	260718978
160	NC_013354	GTCC	2	8	57396	57403	0 %	25 %	25 %	50 %	260718978
161	NC_013354	GAAT	2	8	57921	57928	50 %	25 %	25 %	0 %	260718978
162	NC_013354	CCCA	2	8	57933	57940	25 %	0 %	0 %	75 %	260718978
163	NC_013354	ACTG	2	8	58294	58301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_013354	TCAT	2	8	58518	58525	25 %	50 %	0 %	25 %	260718979
165	NC_013354	ACAG	2	8	58710	58717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_013354	TTGT	2	8	58895	58902	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013354	TATT	2	8	59092	59099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_013354	TGAA	2	8	59124	59131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013354	TAAT	2	8	59313	59320	50 %	50 %	0 %	0 %	260718980
170	NC_013354	GGAA	2	8	59407	59414	50 %	0 %	50 %	0 %	260718980
171	NC_013354	GGTT	2	8	59560	59567	0 %	50 %	50 %	0 %	260718981
172	NC_013354	AATG	2	8	60233	60240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013354	GGTG	2	8	60257	60264	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013354	ATCT	2	8	60475	60482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_013354	TCGC	2	8	61749	61756	0 %	25 %	25 %	50 %	260718984
176	NC_013354	CGTT	2	8	61860	61867	0 %	50 %	25 %	25 %	260718984
177	NC_013354	ACAG	2	8	62110	62117	50 %	0 %	25 %	25 %	260718984
178	NC_013354	CAAC	2	8	62340	62347	50 %	0 %	0 %	50 %	260718984
179	NC_013354	AGAA	2	8	62540	62547	75 %	0 %	25 %	0 %	260718984
180	NC_013354	GTTC	2	8	62820	62827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
181	NC_013354	TTGG	2	8	63565	63572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_013354	TTCA	2	8	63993	64000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
183	NC_013354	TGGC	2	8	64115	64122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
184	NC_013354	CGGG	2	8	64274	64281	0 %	0 %	75 %	25 %	260718985
185	NC_013354	CCGG	2	8	64388	64395	0 %	0 %	50 %	50 %	260718985
186	NC_013354	TCGG	2	8	64537	64544	0 %	25 %	50 %	25 %	260718985
187	NC_013354	TGCG	2	8	64670	64677	0 %	25 %	50 %	25 %	260718985
188	NC_013354	GCAG	2	8	65159	65166	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
189	NC_013354	ATGA	2	8	65408	65415	50 %	25 %	25 %	0 %	260718986
190	NC_013354	GTGA	2	8	65800	65807	25 %	25 %	50 %	0 %	260718987
191	NC_013354	CAGT	2	8	66300	66307	25 %	25 %	25 %	25 %	260718988
192	NC_013354	ACGG	2	8	67641	67648	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
193	NC_013354	GGCA	2	8	67974	67981	25 %	0 %	50 %	25 %	260718990
194	NC_013354	CTGA	2	8	69175	69182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
195	NC_013354	GGGA	2	8	69410	69417	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
196	NC_013354	GAAA	2	8	69978	69985	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
197	NC_013354	ATTT	2	8	70010	70017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_013354	CTGC	2	8	71280	71287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
199	NC_013354	CAGT	2	8	71940	71947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
200	NC_013354	TTTA	2	8	72663	72670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_013354	ATTA	2	8	73411	73418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_013354	ATTT	2	8	73642	73649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_013354	CCAC	2	8	73808	73815	25 %	0 %	0 %	75 %	260718996
204	NC_013354	ATAC	2	8	73988	73995	50 %	25 %	0 %	25 %	260718996
205	NC_013354	CCAC	2	8	74189	74196	25 %	0 %	0 %	75 %	260718996
206	NC_013354	TCTT	2	8	74431	74438	0 %	75 %	0 %	25 %	260718996
207	NC_013354	TTAT	3	12	75154	75165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
208	NC_013354	TGTT	2	8	75305	75312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.