MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013354	AATA	2	8	16654	16661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013354	AAAT	2	8	17081	17088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013354	AATA	2	8	17148	17155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013354	CTGC	2	8	17251	17258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013354	TCAG	2	8	22842	22849	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013354	AAAC	2	8	24540	24547	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013354	TTAT	2	8	25472	25479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013354	TAAA	2	8	32616	32623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013354	CCAA	2	8	32731	32738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013354	CCGC	2	8	35127	35134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_013354	GGAG	2	8	35168	35175	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013354	TGAA	2	8	35183	35190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013354	CAGC	2	8	35980	35987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013354	CAGC	2	8	36064	36071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013354	GTCC	2	8	36242	36249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013354	GATG	2	8	36695	36702	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013354	CGGT	2	8	36727	36734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013354	TCAG	2	8	36853	36860	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013354	GCCA	2	8	37188	37195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013354	GAAA	2	8	39353	39360	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013354	AAAT	2	8	39363	39370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013354	AAAT	2	8	39394	39401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013354	GACT	2	8	39508	39515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013354	TCTG	2	8	41411	41418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013354	GGCT	2	8	41987	41994	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013354	CCTC	2	8	50628	50635	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_013354	TCAT	2	8	51689	51696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013354	TAAT	2	8	51938	51945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013354	CTGA	2	8	52245	52252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013354	ATGA	2	8	54837	54844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013354	CAAA	2	8	56079	56086	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013354	ACAG	2	8	57097	57104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013354	CACT	2	8	57143	57150	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013354	ACTG	2	8	58294	58301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013354	ACAG	2	8	58710	58717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013354	TTGT	2	8	58895	58902	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013354	TATT	2	8	59092	59099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013354	TGAA	2	8	59124	59131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013354	AATG	2	8	60233	60240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013354	GGTG	2	8	60257	60264	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013354	ATCT	2	8	60475	60482	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013354	GTTC	2	8	62820	62827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013354	TTGG	2	8	63565	63572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013354	TTCA	2	8	63993	64000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013354	TGGC	2	8	64115	64122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013354	GCAG	2	8	65159	65166	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013354	ACGG	2	8	67641	67648	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013354	CTGA	2	8	69175	69182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013354	GGGA	2	8	69410	69417	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013354	GAAA	2	8	69978	69985	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013354	ATTT	2	8	70010	70017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013354	CTGC	2	8	71280	71287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013354	CAGT	2	8	71940	71947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013354	TTTA	2	8	72663	72670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013354	ATTA	2	8	73411	73418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013354	ATTT	2	8	73642	73649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013354	TTAT	3	12	75154	75165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013354	TGTT	2	8	75305	75312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.