MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013354	CATG	2	8	20	27	25 %	25 %	25 %	25 %	260718931
2	NC_013354	ATTT	2	8	88	95	25 %	75 %	0 %	0 %	260718931
3	NC_013354	CCTC	2	8	328	335	0 %	25 %	0 %	75 %	260718931
4	NC_013354	AAAC	2	8	441	448	75 %	0 %	0 %	25 %	260718931
5	NC_013354	CTGC	2	8	754	761	0 %	25 %	25 %	50 %	260718931
6	NC_013354	GAAG	2	8	999	1006	50 %	0 %	50 %	0 %	260718931
7	NC_013354	CTAC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	0 %	50 %	260718931
8	NC_013354	GAAA	2	8	1965	1972	75 %	0 %	25 %	0 %	260718931
9	NC_013354	TAAA	2	8	2651	2658	75 %	25 %	0 %	0 %	260718931
10	NC_013354	ACAG	2	8	3142	3149	50 %	0 %	25 %	25 %	260718932
11	NC_013354	TTCT	2	8	3858	3865	0 %	75 %	0 %	25 %	260718933
12	NC_013354	AAAG	2	8	4266	4273	75 %	0 %	25 %	0 %	260718933
13	NC_013354	CTGA	2	8	5960	5967	25 %	25 %	25 %	25 %	260718934
14	NC_013354	TCAG	2	8	6474	6481	25 %	25 %	25 %	25 %	260718934
15	NC_013354	ACTG	2	8	6613	6620	25 %	25 %	25 %	25 %	260718934
16	NC_013354	CTGA	2	8	7743	7750	25 %	25 %	25 %	25 %	260718935
17	NC_013354	TGGC	2	8	8239	8246	0 %	25 %	50 %	25 %	260718935
18	NC_013354	TGGC	2	8	9458	9465	0 %	25 %	50 %	25 %	260718938
19	NC_013354	GGGA	2	8	9580	9587	25 %	0 %	75 %	0 %	260718938
20	NC_013354	GTAA	2	8	10263	10270	50 %	25 %	25 %	0 %	260718939
21	NC_013354	ATTA	2	8	10607	10614	50 %	50 %	0 %	0 %	260718940
22	NC_013354	GATC	2	8	10732	10739	25 %	25 %	25 %	25 %	260718940
23	NC_013354	GCCA	2	8	10811	10818	25 %	0 %	25 %	50 %	260718940
24	NC_013354	GCTG	2	8	10963	10970	0 %	25 %	50 %	25 %	260718940
25	NC_013354	CAGC	2	8	11173	11180	25 %	0 %	25 %	50 %	260718940
26	NC_013354	GAGG	2	8	11245	11252	25 %	0 %	75 %	0 %	260718940
27	NC_013354	AACA	2	8	11269	11276	75 %	0 %	0 %	25 %	260718941
28	NC_013354	AGGC	2	8	11282	11289	25 %	0 %	50 %	25 %	260718941
29	NC_013354	GGTT	2	8	11339	11346	0 %	50 %	50 %	0 %	260718941
30	NC_013354	CAGA	2	8	11447	11454	50 %	0 %	25 %	25 %	260718941
31	NC_013354	GCAG	2	8	12330	12337	25 %	0 %	50 %	25 %	260718941
32	NC_013354	TTAT	2	8	13379	13386	25 %	75 %	0 %	0 %	260718943
33	NC_013354	TCTG	2	8	13599	13606	0 %	50 %	25 %	25 %	260718943
34	NC_013354	AGCT	2	8	13671	13678	25 %	25 %	25 %	25 %	260718943
35	NC_013354	ATGG	2	8	13693	13700	25 %	25 %	50 %	0 %	260718943
36	NC_013354	TCAG	2	8	13736	13743	25 %	25 %	25 %	25 %	260718943
37	NC_013354	GTAT	2	8	16211	16218	25 %	50 %	25 %	0 %	260718946
38	NC_013354	GTGG	2	8	16391	16398	0 %	25 %	75 %	0 %	260718946
39	NC_013354	ACGT	2	8	18271	18278	25 %	25 %	25 %	25 %	260718947
40	NC_013354	GCAG	2	8	18280	18287	25 %	0 %	50 %	25 %	260718947
41	NC_013354	TTAT	2	8	18605	18612	25 %	75 %	0 %	0 %	260718947
42	NC_013354	GGCT	2	8	18696	18703	0 %	25 %	50 %	25 %	260718947
43	NC_013354	TAAT	2	8	18782	18789	50 %	50 %	0 %	0 %	260718947
44	NC_013354	CCTT	2	8	18982	18989	0 %	50 %	0 %	50 %	260718948
45	NC_013354	CGGG	2	8	19665	19672	0 %	0 %	75 %	25 %	260718948
46	NC_013354	CAGC	2	8	19791	19798	25 %	0 %	25 %	50 %	260718948
47	NC_013354	TGAA	2	8	20630	20637	50 %	25 %	25 %	0 %	260718949
48	NC_013354	GCAG	2	8	20937	20944	25 %	0 %	50 %	25 %	260718949
49	NC_013354	ACCA	2	8	20965	20972	50 %	0 %	0 %	50 %	260718949
50	NC_013354	GCAG	2	8	21822	21829	25 %	0 %	50 %	25 %	260718950
51	NC_013354	GCAC	2	8	22387	22394	25 %	0 %	25 %	50 %	260718950
52	NC_013354	TCGT	2	8	22695	22702	0 %	50 %	25 %	25 %	260718950
53	NC_013354	CCAC	2	8	23369	23376	25 %	0 %	0 %	75 %	260718951
54	NC_013354	ATAC	2	8	23549	23556	50 %	25 %	0 %	25 %	260718951
55	NC_013354	CCAC	2	8	23750	23757	25 %	0 %	0 %	75 %	260718951
56	NC_013354	TCTT	2	8	23992	23999	0 %	75 %	0 %	25 %	260718951
57	NC_013354	ATTT	2	8	24747	24754	25 %	75 %	0 %	0 %	260718953
58	NC_013354	CTTT	2	8	25143	25150	0 %	75 %	0 %	25 %	260718954
59	NC_013354	GAAC	2	8	25278	25285	50 %	0 %	25 %	25 %	260718954
60	NC_013354	GATA	2	8	25323	25330	50 %	25 %	25 %	0 %	260718954
61	NC_013354	GTTT	2	8	25400	25407	0 %	75 %	25 %	0 %	260718954
62	NC_013354	TGTA	2	8	25885	25892	25 %	50 %	25 %	0 %	260718955
63	NC_013354	CTTC	2	8	26216	26223	0 %	50 %	0 %	50 %	260718955
64	NC_013354	AGAA	2	8	26452	26459	75 %	0 %	25 %	0 %	260718955
65	NC_013354	CCAT	2	8	27861	27868	25 %	25 %	0 %	50 %	260718956
66	NC_013354	TATT	2	8	28023	28030	25 %	75 %	0 %	0 %	260718956
67	NC_013354	GCAA	2	8	28337	28344	50 %	0 %	25 %	25 %	260718956
68	NC_013354	GCAA	2	8	28994	29001	50 %	0 %	25 %	25 %	260718956
69	NC_013354	TCCA	2	8	29645	29652	25 %	25 %	0 %	50 %	260718957
70	NC_013354	CATA	2	8	30124	30131	50 %	25 %	0 %	25 %	260718957
71	NC_013354	TTTC	2	8	30456	30463	0 %	75 %	0 %	25 %	260718957
72	NC_013354	TAAT	2	8	30618	30625	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
73	NC_013354	AGCA	2	8	30752	30759	50 %	0 %	25 %	25 %	260718957
74	NC_013354	CATT	2	8	30840	30847	25 %	50 %	0 %	25 %	260718957
75	NC_013354	TATT	2	8	31018	31025	25 %	75 %	0 %	0 %	260718957
76	NC_013354	GCTC	2	8	31137	31144	0 %	25 %	25 %	50 %	260718957
77	NC_013354	GAAA	2	8	31166	31173	75 %	0 %	25 %	0 %	260718957
78	NC_013354	TTTC	2	8	32099	32106	0 %	75 %	0 %	25 %	260718958
79	NC_013354	CTTT	2	8	32349	32356	0 %	75 %	0 %	25 %	260718958
80	NC_013354	GTAT	2	8	33962	33969	25 %	50 %	25 %	0 %	260718960
81	NC_013354	GTGG	2	8	34142	34149	0 %	25 %	75 %	0 %	260718960
82	NC_013354	TGAG	2	8	38668	38675	25 %	25 %	50 %	0 %	260718962
83	NC_013354	AATC	2	8	39262	39269	50 %	25 %	0 %	25 %	260718962
84	NC_013354	CCAC	2	8	39707	39714	25 %	0 %	0 %	75 %	260718963
85	NC_013354	ATAC	2	8	39887	39894	50 %	25 %	0 %	25 %	260718963
86	NC_013354	CCAC	2	8	40088	40095	25 %	0 %	0 %	75 %	260718963
87	NC_013354	TCTT	2	8	40330	40337	0 %	75 %	0 %	25 %	260718963
88	NC_013354	CGGA	2	8	43184	43191	25 %	0 %	50 %	25 %	260718965
89	NC_013354	TGAT	2	8	43307	43314	25 %	50 %	25 %	0 %	260718965
90	NC_013354	CGGA	2	8	43382	43389	25 %	0 %	50 %	25 %	260718965
91	NC_013354	CGCA	2	8	43906	43913	25 %	0 %	25 %	50 %	260718965
92	NC_013354	CCGT	2	8	44289	44296	0 %	25 %	25 %	50 %	260718965
93	NC_013354	TCGC	2	8	44412	44419	0 %	25 %	25 %	50 %	260718965
94	NC_013354	CTGG	2	8	44913	44920	0 %	25 %	50 %	25 %	260718965
95	NC_013354	CCGG	2	8	45117	45124	0 %	0 %	50 %	50 %	260718965
96	NC_013354	GCGA	2	8	45146	45153	25 %	0 %	50 %	25 %	260718965
97	NC_013354	GGGC	2	8	45253	45260	0 %	0 %	75 %	25 %	260718965
98	NC_013354	CCTG	2	8	45273	45280	0 %	25 %	25 %	50 %	260718965
99	NC_013354	CGGA	2	8	47126	47133	25 %	0 %	50 %	25 %	260718965
100	NC_013354	GGCG	2	8	47263	47270	0 %	0 %	75 %	25 %	260718965
101	NC_013354	GCCG	2	8	47488	47495	0 %	0 %	50 %	50 %	260718965
102	NC_013354	CAGG	2	8	47509	47516	25 %	0 %	50 %	25 %	260718965
103	NC_013354	GTGG	2	8	48693	48700	0 %	25 %	75 %	0 %	260718966
104	NC_013354	CAGT	2	8	48786	48793	25 %	25 %	25 %	25 %	260718966
105	NC_013354	CAGC	2	8	49478	49485	25 %	0 %	25 %	50 %	260718967
106	NC_013354	ATGA	2	8	49524	49531	50 %	25 %	25 %	0 %	260718967
107	NC_013354	CAGC	2	8	49747	49754	25 %	0 %	25 %	50 %	260718967
108	NC_013354	ATGC	2	8	49873	49880	25 %	25 %	25 %	25 %	260718967
109	NC_013354	TGCC	2	8	50480	50487	0 %	25 %	25 %	50 %	260718968
110	NC_013354	TGGA	2	8	50847	50854	25 %	25 %	50 %	0 %	260718969
111	NC_013354	GACA	2	8	51399	51406	50 %	0 %	25 %	25 %	260718970
112	NC_013354	GAAT	2	8	51503	51510	50 %	25 %	25 %	0 %	260718970
113	NC_013354	TAAA	2	8	51666	51673	75 %	25 %	0 %	0 %	260718970
114	NC_013354	CCAC	2	8	52399	52406	25 %	0 %	0 %	75 %	260718972
115	NC_013354	ATAC	2	8	52579	52586	50 %	25 %	0 %	25 %	260718972
116	NC_013354	CCAC	2	8	52780	52787	25 %	0 %	0 %	75 %	260718972
117	NC_013354	TCTT	2	8	53022	53029	0 %	75 %	0 %	25 %	260718972
118	NC_013354	CGGA	2	8	54106	54113	25 %	0 %	50 %	25 %	260718974
119	NC_013354	AATC	2	8	54773	54780	50 %	25 %	0 %	25 %	260718975
120	NC_013354	TTCA	2	8	55218	55225	25 %	50 %	0 %	25 %	260718976
121	NC_013354	AGTG	2	8	56334	56341	25 %	25 %	50 %	0 %	260718977
122	NC_013354	GTGC	2	8	56494	56501	0 %	25 %	50 %	25 %	260718977
123	NC_013354	CGCC	2	8	56512	56519	0 %	0 %	25 %	75 %	260718977
124	NC_013354	CTGG	2	8	56785	56792	0 %	25 %	50 %	25 %	260718977
125	NC_013354	CGGG	2	8	56880	56887	0 %	0 %	75 %	25 %	260718977
126	NC_013354	GACT	2	8	57295	57302	25 %	25 %	25 %	25 %	260718978
127	NC_013354	GTCC	2	8	57396	57403	0 %	25 %	25 %	50 %	260718978
128	NC_013354	GAAT	2	8	57921	57928	50 %	25 %	25 %	0 %	260718978
129	NC_013354	CCCA	2	8	57933	57940	25 %	0 %	0 %	75 %	260718978
130	NC_013354	TCAT	2	8	58518	58525	25 %	50 %	0 %	25 %	260718979
131	NC_013354	TAAT	2	8	59313	59320	50 %	50 %	0 %	0 %	260718980
132	NC_013354	GGAA	2	8	59407	59414	50 %	0 %	50 %	0 %	260718980
133	NC_013354	GGTT	2	8	59560	59567	0 %	50 %	50 %	0 %	260718981
134	NC_013354	TCGC	2	8	61749	61756	0 %	25 %	25 %	50 %	260718984
135	NC_013354	CGTT	2	8	61860	61867	0 %	50 %	25 %	25 %	260718984
136	NC_013354	ACAG	2	8	62110	62117	50 %	0 %	25 %	25 %	260718984
137	NC_013354	CAAC	2	8	62340	62347	50 %	0 %	0 %	50 %	260718984
138	NC_013354	AGAA	2	8	62540	62547	75 %	0 %	25 %	0 %	260718984
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140	NC_013354	CCGG	2	8	64388	64395	0 %	0 %	50 %	50 %	260718985
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.