MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103

Total Repeats: 1017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013354	TGC	2	6	57	62	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718931
2	NC_013354	CTG	3	9	65	73	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718931
3	NC_013354	ATA	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718931
4	NC_013354	ACC	2	6	100	105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260718931
5	NC_013354	AAG	2	6	185	190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260718931
6	NC_013354	CAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260718931
7	NC_013354	TGA	2	6	255	260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718931
8	NC_013354	ACC	2	6	356	361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260718931
9	NC_013354	CTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718931
10	NC_013354	CTC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260718931
11	NC_013354	AAT	2	6	490	495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718931
12	NC_013354	TGG	2	6	500	505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718931
13	NC_013354	CTG	2	6	661	666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718931
14	NC_013354	TGT	2	6	854	859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260718931
15	NC_013354	CAA	2	6	975	980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260718931
16	NC_013354	CTG	2	6	1145	1150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718931
17	NC_013354	AGC	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718931
18	NC_013354	ACT	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718931
19	NC_013354	GGT	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718931
20	NC_013354	ATC	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718931
21	NC_013354	TCC	2	6	1627	1632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260718931
22	NC_013354	GAT	2	6	1752	1757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718931
23	NC_013354	GGT	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718931
24	NC_013354	AAG	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260718931
25	NC_013354	GTG	2	6	1978	1983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718931
26	NC_013354	GAC	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718931
27	NC_013354	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718931
28	NC_013354	TTA	2	6	2043	2048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718931
29	NC_013354	TGA	2	6	2118	2123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718931
30	NC_013354	TAA	2	6	2199	2204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718931
31	NC_013354	TGA	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718931
32	NC_013354	TAA	2	6	2286	2291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718931
33	NC_013354	TGC	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718931
34	NC_013354	CAG	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718931
35	NC_013354	CCA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013354	TGT	2	6	2746	2751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260718932
37	NC_013354	ATC	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718932
38	NC_013354	GAA	2	6	2964	2969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260718932
39	NC_013354	CCG	2	6	3003	3008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260718932
40	NC_013354	ACA	2	6	3033	3038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260718932
41	NC_013354	TGA	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718932
42	NC_013354	ATA	2	6	3136	3141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718932
43	NC_013354	TTA	2	6	3223	3228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718932
44	NC_013354	ATA	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718932
45	NC_013354	AAT	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718932
46	NC_013354	ATG	2	6	3589	3594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718932
47	NC_013354	TAA	2	6	3781	3786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718933
48	NC_013354	GTG	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718933
49	NC_013354	CGG	2	6	3952	3957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260718933
50	NC_013354	TGA	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718933
51	NC_013354	GTT	2	6	3999	4004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260718933
52	NC_013354	GGT	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718933
53	NC_013354	TGC	2	6	4054	4059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718933
54	NC_013354	CTG	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718933
55	NC_013354	TGC	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718933
56	NC_013354	GTG	2	6	4143	4148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718933
57	NC_013354	TTG	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260718933
58	NC_013354	AGG	2	6	4183	4188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260718933
59	NC_013354	ATC	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718933
60	NC_013354	AGG	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260718933
61	NC_013354	CAG	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718933
62	NC_013354	ACG	2	6	4504	4509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718933
63	NC_013354	TCG	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718933
64	NC_013354	TGG	2	6	4663	4668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718933
65	NC_013354	CAT	2	6	4673	4678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718933
66	NC_013354	GCA	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718933
67	NC_013354	TGC	2	6	4885	4890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718933
68	NC_013354	ACC	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260718933
69	NC_013354	AGG	2	6	5125	5130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260718933
70	NC_013354	CAG	2	6	5149	5154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718933
71	NC_013354	ACT	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718933
72	NC_013354	GGT	3	9	5234	5242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718933
73	NC_013354	CGG	2	6	5243	5248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260718933
74	NC_013354	CTG	2	6	5292	5297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718933
75	NC_013354	TGT	2	6	5365	5370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260718933
76	NC_013354	CAA	2	6	5380	5385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260718933
77	NC_013354	TGC	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718933
78	NC_013354	TGC	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718934
79	NC_013354	GGA	2	6	5701	5706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260718934
80	NC_013354	GCT	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718934
81	NC_013354	TGA	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718934
82	NC_013354	ATG	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718934
83	NC_013354	TAT	2	6	5935	5940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718934
84	NC_013354	TCC	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260718934
85	NC_013354	TGC	2	6	6165	6170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718934
86	NC_013354	TGC	2	6	6237	6242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718934
87	NC_013354	CGC	2	6	6294	6299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260718934
88	NC_013354	CCG	2	6	6328	6333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260718934
89	NC_013354	ATT	2	6	6344	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718934
90	NC_013354	ACG	2	6	6383	6388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718934
91	NC_013354	TGC	2	6	6394	6399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718934
92	NC_013354	CAT	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718934
93	NC_013354	TTG	2	6	6719	6724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260718934
94	NC_013354	GTC	2	6	6768	6773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718934
95	NC_013354	GAG	2	6	7043	7048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260718934
96	NC_013354	GTT	2	6	7097	7102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260718935
97	NC_013354	TGC	2	6	7183	7188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718935
98	NC_013354	AGC	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718935
99	NC_013354	ATT	2	6	7301	7306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718935
100	NC_013354	TGG	2	6	7327	7332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718935
101	NC_013354	TGG	2	6	7501	7506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718935
102	NC_013354	CGG	2	6	7507	7512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260718935
103	NC_013354	GTC	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718935
104	NC_013354	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718935
105	NC_013354	GCT	3	9	7775	7783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718935
106	NC_013354	ATG	2	6	7815	7820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718935
107	NC_013354	TCA	2	6	7850	7855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718935
108	NC_013354	CTG	3	9	7857	7865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718935
109	NC_013354	TCA	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718935
110	NC_013354	ATG	2	6	8094	8099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718935
111	NC_013354	GCC	2	6	8157	8162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260718935
112	NC_013354	TGG	3	9	8227	8235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718935
113	NC_013354	GTC	2	6	8247	8252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718935
114	NC_013354	CAA	2	6	8294	8299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260718935
115	NC_013354	ATG	2	6	8301	8306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718935
116	NC_013354	TTC	2	6	8317	8322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013354	TTG	2	6	8376	8381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260718936
118	NC_013354	TGG	2	6	8389	8394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718936
119	NC_013354	TGG	2	6	8425	8430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718936
120	NC_013354	AAC	2	6	8529	8534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260718936
121	NC_013354	CAA	2	6	8542	8547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260718936
122	NC_013354	CGT	2	6	8628	8633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718936
123	NC_013354	TCT	2	6	8701	8706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260718936
124	NC_013354	GAT	2	6	8739	8744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718936
125	NC_013354	GAT	2	6	8806	8811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718937
126	NC_013354	TTG	2	6	8822	8827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260718937
127	NC_013354	CAA	2	6	8888	8893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260718937
128	NC_013354	TGC	2	6	9091	9096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718937
129	NC_013354	GAT	2	6	9116	9121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718937
130	NC_013354	TGC	2	6	9201	9206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718937
131	NC_013354	AGG	2	6	9250	9255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260718937
132	NC_013354	TGA	2	6	9280	9285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718937
133	NC_013354	TGA	2	6	9294	9299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718937
134	NC_013354	AAG	2	6	9335	9340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260718938
135	NC_013354	TGG	2	6	9362	9367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718938
136	NC_013354	CAG	2	6	9418	9423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718938
137	NC_013354	CAG	2	6	9693	9698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718939
138	NC_013354	TAC	2	6	9778	9783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718939
139	NC_013354	GAT	2	6	9881	9886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718939
140	NC_013354	CTG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718939
141	NC_013354	GCT	2	6	9924	9929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718939
142	NC_013354	CTG	2	6	9936	9941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718939
143	NC_013354	CCG	2	6	9991	9996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260718939
144	NC_013354	GTG	2	6	10113	10118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718939
145	NC_013354	GAT	2	6	10230	10235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718939
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147	NC_013354	CGG	2	6	10546	10551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260718940
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150	NC_013354	CAG	2	6	10713	10718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718940
151	NC_013354	TGA	2	6	10741	10746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718940
152	NC_013354	AGG	2	6	10758	10763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260718940
153	NC_013354	CTG	2	6	10940	10945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718940
154	NC_013354	CTG	2	6	11015	11020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718940
155	NC_013354	AGC	2	6	11120	11125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718940
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157	NC_013354	GGA	2	6	11352	11357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260718941
158	NC_013354	GGC	2	6	11365	11370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260718941
159	NC_013354	CTG	2	6	11410	11415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718941
160	NC_013354	TCT	2	6	11520	11525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260718941
161	NC_013354	AGC	2	6	11552	11557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718941
162	NC_013354	TTC	2	6	11570	11575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260718941
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229	NC_013354	ATT	2	6	16969	16974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_013354	TAT	3	9	16988	16996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
231	NC_013354	ATT	2	6	17002	17007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_013354	AAC	2	6	17060	17065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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234	NC_013354	ACA	2	6	17170	17175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_013354	TTA	2	6	17297	17302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_013354	AGA	2	6	17444	17449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_013354	TCT	2	6	17682	17687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_013354	TGT	2	6	17842	17847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
244	NC_013354	AAT	2	6	17879	17884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_013354	ATG	2	6	19199	19204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718948
257	NC_013354	CAG	2	6	19329	19334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718948
258	NC_013354	TGC	2	6	19395	19400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260718948
259	NC_013354	GTG	2	6	19448	19453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718948
260	NC_013354	GAA	2	6	19466	19471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260718948
261	NC_013354	CAG	2	6	19490	19495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260718948
262	NC_013354	GTG	2	6	19577	19582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260718948
263	NC_013354	AGA	2	6	19689	19694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260718948
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266	NC_013354	CGG	2	6	19895	19900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_013354	TCA	2	6	20081	20086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718949
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383	NC_013354	AAT	2	6	28151	28156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718956
384	NC_013354	GTA	2	6	28388	28393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718956
385	NC_013354	TAA	2	6	28449	28454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718956
386	NC_013354	ATA	2	6	28466	28471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260718956
387	NC_013354	TTA	2	6	28536	28541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718956
388	NC_013354	TCC	2	6	28590	28595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260718956
389	NC_013354	ACT	2	6	28652	28657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718956
390	NC_013354	TGT	2	6	28736	28741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260718956
391	NC_013354	TGA	2	6	28765	28770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260718956
392	NC_013354	ATT	2	6	28838	28843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718956
393	NC_013354	TAT	2	6	28941	28946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718956
394	NC_013354	TAT	2	6	28980	28985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718956
395	NC_013354	TAT	2	6	29019	29024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718956
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398	NC_013354	CCT	2	6	29081	29086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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403	NC_013354	ATT	3	9	29297	29305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260718957
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412	NC_013354	ATC	2	6	29684	29689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260718957
413	NC_013354	ACC	2	6	29696	29701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260718957
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500	NC_013354	TGG	2	6	35516	35521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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