MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009 plasmid pO103

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013354	CT	3	6	36	41	0 %	50 %	0 %	50 %	260718931
2	NC_013354	TC	3	6	1103	1108	0 %	50 %	0 %	50 %	260718931
3	NC_013354	AC	3	6	1683	1688	50 %	0 %	0 %	50 %	260718931
4	NC_013354	GA	3	6	2768	2773	50 %	0 %	50 %	0 %	260718932
5	NC_013354	CA	3	6	2958	2963	50 %	0 %	0 %	50 %	260718932
6	NC_013354	GA	3	6	3610	3615	50 %	0 %	50 %	0 %	260718932
7	NC_013354	AT	3	6	6935	6940	50 %	50 %	0 %	0 %	260718934
8	NC_013354	GC	3	6	7418	7423	0 %	0 %	50 %	50 %	260718935
9	NC_013354	GC	3	6	8503	8508	0 %	0 %	50 %	50 %	260718936
10	NC_013354	TA	3	6	8622	8627	50 %	50 %	0 %	0 %	260718936
11	NC_013354	AG	3	6	9637	9642	50 %	0 %	50 %	0 %	260718938
12	NC_013354	CG	3	6	9795	9800	0 %	0 %	50 %	50 %	260718939
13	NC_013354	GC	3	6	10173	10178	0 %	0 %	50 %	50 %	260718939
14	NC_013354	GA	3	6	11197	11202	50 %	0 %	50 %	0 %	260718940
15	NC_013354	TG	3	6	12037	12042	0 %	50 %	50 %	0 %	260718941
16	NC_013354	AT	3	6	12384	12389	50 %	50 %	0 %	0 %	260718941
17	NC_013354	GC	3	6	15876	15881	0 %	0 %	50 %	50 %	260718946
18	NC_013354	TC	3	6	17709	17714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013354	TG	3	6	17892	17897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013354	TG	3	6	19167	19172	0 %	50 %	50 %	0 %	260718948
21	NC_013354	TC	3	6	20270	20275	0 %	50 %	0 %	50 %	260718949
22	NC_013354	AG	3	6	20311	20316	50 %	0 %	50 %	0 %	260718949
23	NC_013354	TA	3	6	20372	20377	50 %	50 %	0 %	0 %	260718949
24	NC_013354	TA	3	6	20417	20422	50 %	50 %	0 %	0 %	260718949
25	NC_013354	GA	3	6	20683	20688	50 %	0 %	50 %	0 %	260718949
26	NC_013354	TG	3	6	21935	21940	0 %	50 %	50 %	0 %	260718950
27	NC_013354	GA	3	6	21964	21969	50 %	0 %	50 %	0 %	260718950
28	NC_013354	AC	3	6	22819	22824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013354	AG	3	6	23159	23164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013354	AT	3	6	24673	24678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013354	GA	3	6	24946	24951	50 %	0 %	50 %	0 %	260718953
32	NC_013354	TC	3	6	26819	26824	0 %	50 %	0 %	50 %	260718955
33	NC_013354	GT	3	6	26838	26843	0 %	50 %	50 %	0 %	260718955
34	NC_013354	TG	3	6	26987	26992	0 %	50 %	50 %	0 %	260718956
35	NC_013354	TG	3	6	27060	27065	0 %	50 %	50 %	0 %	260718956
36	NC_013354	TA	3	6	27487	27492	50 %	50 %	0 %	0 %	260718956
37	NC_013354	TC	3	6	27834	27839	0 %	50 %	0 %	50 %	260718956
38	NC_013354	TC	3	6	28296	28301	0 %	50 %	0 %	50 %	260718956
39	NC_013354	GA	3	6	28395	28400	50 %	0 %	50 %	0 %	260718956
40	NC_013354	AT	3	6	28791	28796	50 %	50 %	0 %	0 %	260718956
41	NC_013354	TG	4	8	28931	28938	0 %	50 %	50 %	0 %	260718956
42	NC_013354	GT	4	8	29123	29130	0 %	50 %	50 %	0 %	260718957
43	NC_013354	TA	3	6	29152	29157	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
44	NC_013354	TA	3	6	29279	29284	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
45	NC_013354	TC	3	6	29329	29334	0 %	50 %	0 %	50 %	260718957
46	NC_013354	CT	3	6	29491	29496	0 %	50 %	0 %	50 %	260718957
47	NC_013354	AT	3	6	29839	29844	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
48	NC_013354	AT	3	6	29923	29928	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
49	NC_013354	TA	3	6	30143	30148	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
50	NC_013354	AT	3	6	30432	30437	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
51	NC_013354	AT	3	6	30624	30629	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
52	NC_013354	AG	3	6	30765	30770	50 %	0 %	50 %	0 %	260718957
53	NC_013354	AT	3	6	31263	31268	50 %	50 %	0 %	0 %	260718957
54	NC_013354	GA	3	6	31695	31700	50 %	0 %	50 %	0 %	260718957
55	NC_013354	TA	3	6	32300	32305	50 %	50 %	0 %	0 %	260718958
56	NC_013354	TA	3	6	32400	32405	50 %	50 %	0 %	0 %	260718958
57	NC_013354	AG	3	6	32474	32479	50 %	0 %	50 %	0 %	260718958
58	NC_013354	TA	3	6	32653	32658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013354	TC	3	6	32725	32730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013354	AC	3	6	34695	34700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013354	CG	3	6	36047	36052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013354	GT	3	6	36484	36489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013354	TA	3	6	38222	38227	50 %	50 %	0 %	0 %	260718961
64	NC_013354	CT	3	6	38249	38254	0 %	50 %	0 %	50 %	260718961
65	NC_013354	AT	3	6	41145	41150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013354	AC	3	6	41766	41771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013354	GT	3	6	42105	42110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013354	AC	3	6	43470	43475	50 %	0 %	0 %	50 %	260718965
69	NC_013354	AG	3	6	44787	44792	50 %	0 %	50 %	0 %	260718965
70	NC_013354	CA	3	6	45378	45383	50 %	0 %	0 %	50 %	260718965
71	NC_013354	GA	3	6	45877	45882	50 %	0 %	50 %	0 %	260718965
72	NC_013354	CA	3	6	45999	46004	50 %	0 %	0 %	50 %	260718965
73	NC_013354	CA	3	6	46077	46082	50 %	0 %	0 %	50 %	260718965
74	NC_013354	CA	3	6	46692	46697	50 %	0 %	0 %	50 %	260718965
75	NC_013354	GT	3	6	46877	46882	0 %	50 %	50 %	0 %	260718965
76	NC_013354	CT	3	6	49119	49124	0 %	50 %	0 %	50 %	260718967
77	NC_013354	GA	3	6	49536	49541	50 %	0 %	50 %	0 %	260718967
78	NC_013354	AG	3	6	49739	49744	50 %	0 %	50 %	0 %	260718967
79	NC_013354	GA	3	6	50110	50115	50 %	0 %	50 %	0 %	260718968
80	NC_013354	TG	3	6	50461	50466	0 %	50 %	50 %	0 %	260718968
81	NC_013354	AG	4	8	50636	50643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013354	GT	3	6	51147	51152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013354	AT	3	6	51219	51224	50 %	50 %	0 %	0 %	260718970
84	NC_013354	TG	3	6	51260	51265	0 %	50 %	50 %	0 %	260718970
85	NC_013354	CT	3	6	53953	53958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013354	AT	3	6	54450	54455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013354	AT	3	6	54554	54559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013354	TC	3	6	54577	54582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013354	TA	3	6	54646	54651	50 %	50 %	0 %	0 %	260718975
90	NC_013354	CT	3	6	54696	54701	0 %	50 %	0 %	50 %	260718975
91	NC_013354	GA	3	6	54866	54871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013354	TA	3	6	54897	54902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013354	AT	3	6	55037	55042	50 %	50 %	0 %	0 %	260718976
94	NC_013354	AT	3	6	55523	55528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013354	CG	3	6	56093	56098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013354	CA	3	6	56714	56719	50 %	0 %	0 %	50 %	260718977
97	NC_013354	TA	3	6	56946	56951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013354	TA	3	6	56994	56999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013354	CT	3	6	57555	57560	0 %	50 %	0 %	50 %	260718978
100	NC_013354	CA	3	6	57853	57858	50 %	0 %	0 %	50 %	260718978
101	NC_013354	GT	3	6	58275	58280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013354	CA	3	6	58585	58590	50 %	0 %	0 %	50 %	260718979
103	NC_013354	TA	4	8	58742	58749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013354	CT	3	6	58768	58773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013354	AT	3	6	60407	60412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013354	AT	3	6	60460	60465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013354	GA	3	6	61773	61778	50 %	0 %	50 %	0 %	260718984
108	NC_013354	AG	3	6	62120	62125	50 %	0 %	50 %	0 %	260718984
109	NC_013354	TC	3	6	62211	62216	0 %	50 %	0 %	50 %	260718984
110	NC_013354	CT	3	6	63304	63309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013354	TC	3	6	63398	63403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013354	CG	3	6	63710	63715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013354	AG	3	6	63982	63987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013354	CA	3	6	65125	65130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013354	GC	3	6	65356	65361	0 %	0 %	50 %	50 %	260718986
116	NC_013354	GA	3	6	65555	65560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013354	TG	3	6	66956	66961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013354	TC	3	6	67283	67288	0 %	50 %	0 %	50 %	260718989
119	NC_013354	AC	3	6	67548	67553	50 %	0 %	0 %	50 %	260718989
120	NC_013354	CG	3	6	68328	68333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013354	AG	4	8	69052	69059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013354	TA	4	8	70461	70468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013354	TG	4	8	71970	71977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013354	CT	3	6	72705	72710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013354	GT	3	6	72836	72841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013354	TC	3	6	73217	73222	0 %	50 %	0 %	50 %	260718995
127	NC_013354	AT	3	6	75109	75114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013354	AT	3	6	75367	75372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013354	GT	3	6	75432	75437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.