MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013353	GAAAAT	2	12	11891	11902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013353	AAAGGA	2	12	20114	20125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013353	TTTCAC	2	12	20876	20887	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013353	GCTGGT	2	12	51534	51545	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013353	CGATGG	2	12	51680	51691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013353	GCCCGC	2	12	52444	52455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013353	AAGGGA	2	12	86048	86059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013353	TCTCCC	2	12	165942	165953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013353	TCACCC	2	12	165993	166004	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_013353	GTAGTG	2	12	200939	200950	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013353	AGAAAA	2	12	268683	268694	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013353	GTGCAG	2	12	294388	294399	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013353	TCTGGT	2	12	300532	300543	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013353	TTTTCT	2	12	320270	320281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013353	CTATTT	2	12	321306	321317	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013353	TTTATT	2	12	352966	352977	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013353	TATTGA	2	12	392604	392615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013353	AACAAT	2	12	413687	413698	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013353	TATTGA	2	12	416533	416544	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013353	TTTTCA	2	12	481068	481079	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013353	CAGGCG	2	12	499910	499921	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013353	CGCTAC	2	12	533277	533288	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013353	TGTCGC	2	12	534826	534837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013353	CTGTCA	2	12	588819	588830	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013353	AATATG	2	12	615274	615285	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013353	TGCAAA	2	12	650445	650456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013353	ATTTTT	2	12	746496	746507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013353	TTTACC	2	12	757407	757418	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013353	TTTTCT	2	12	827775	827786	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013353	TTGTGT	2	12	841035	841046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013353	TTAAAT	2	12	844394	844405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013353	TCGCTG	2	12	844554	844565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013353	TTGTAC	2	12	845431	845442	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013353	CAACTT	2	12	875523	875534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013353	TATTCA	2	12	875790	875801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013353	CAGAAA	2	12	907664	907675	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013353	TAACCG	2	12	1007485	1007496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013353	AAATAA	2	12	1039279	1039290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013353	CTGGAA	2	12	1048842	1048853	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013353	GGTGAT	2	12	1054570	1054581	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013353	AAAGAT	2	12	1073089	1073100	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013353	AAATAT	2	12	1083705	1083716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013353	TGTCCA	2	12	1093888	1093899	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013353	TAAGGA	2	12	1116155	1116166	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013353	ATAATG	2	12	1117569	1117580	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013353	AATGAT	2	12	1149543	1149554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013353	GATGGC	2	12	1149930	1149941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013353	CAAAAA	2	12	1205965	1205976	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013353	TTTATG	2	12	1288241	1288252	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013353	AGCCGG	2	12	1293298	1293309	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013353	CGGATG	2	12	1294525	1294536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013353	GCTGGT	2	12	1294733	1294744	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013353	CTTTTT	2	12	1299259	1299270	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013353	TTTTGT	2	12	1352945	1352956	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013353	ACGCTT	2	12	1373583	1373594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013353	ACTCGA	2	12	1373603	1373614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013353	CAGGCT	2	12	1373735	1373746	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013353	CTTATT	2	12	1425603	1425614	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013353	CAAAAG	2	12	1431499	1431510	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013353	GGGGGT	2	12	1439719	1439730	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013353	CTGATC	2	12	1441977	1441988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013353	GTTTTT	2	12	1457861	1457872	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013353	AAAAAT	2	12	1468173	1468184	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013353	AAAGTT	2	12	1492147	1492158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013353	CTATAA	2	12	1532123	1532134	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013353	GCCTTT	2	12	1548596	1548607	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013353	TTTTAT	2	12	1678655	1678666	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013353	AAAAGA	2	12	1678829	1678840	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013353	AAAAAC	2	12	1703125	1703136	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013353	ATTAAT	2	12	1703814	1703825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013353	ACCGTT	2	12	1713327	1713338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013353	TGGTTA	2	12	1722157	1722168	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013353	TTTCTG	2	12	1763327	1763338	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013353	CAAAAA	2	12	1782490	1782501	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013353	TTAAAT	2	12	1784289	1784300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013353	CCGGAA	2	12	1793918	1793929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013353	AAAAAC	2	12	1797946	1797957	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013353	ATACTT	2	12	1898270	1898281	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013353	AAAATA	2	12	1913240	1913251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013353	TGTTTT	2	12	1913873	1913884	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013353	AAGACT	2	12	1914133	1914144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013353	CTGAAA	2	12	1937447	1937458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013353	GAACAG	2	12	1999891	1999902	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013353	TATTAC	2	12	2059131	2059142	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_013353	TTTCTT	2	12	2079118	2079129	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013353	ACTGTC	2	12	2126718	2126729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013353	CGTCAG	2	12	2171527	2171538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013353	CCGGAA	2	12	2173338	2173349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013353	TTAATG	2	12	2220781	2220792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013353	AATTCA	2	12	2227906	2227917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013353	TCTTAT	2	12	2241722	2241733	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013353	ATATTT	2	12	2273125	2273136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013353	AAGTTG	2	12	2285476	2285487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013353	CACCGC	2	12	2356641	2356652	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013353	CACCAG	2	12	2356851	2356862	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013353	GCATCC	2	12	2357059	2357070	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013353	CCGGCT	2	12	2358287	2358298	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013353	CCGGAA	2	12	2367479	2367490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013353	AAATTT	3	18	2380051	2380068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013353	CCTGAC	2	12	2440009	2440020	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013353	ACGCTG	2	12	2440529	2440540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013353	TACTGA	2	12	2443261	2443272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013353	ACAGAC	2	12	2444545	2444556	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013353	ATTTTT	2	12	2453061	2453072	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013353	CTGATA	2	12	2462150	2462161	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013353	CCAGAA	2	12	2463966	2463977	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013353	TTTTGT	2	12	2534013	2534024	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013353	TCCCCC	2	12	2563868	2563879	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
109	NC_013353	CCTTAC	2	12	2615523	2615534	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013353	CCTTAC	2	12	2616131	2616142	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013353	CCTGTT	2	12	2627546	2627557	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013353	ACGCAG	2	12	2645953	2645964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013353	TCTTCC	2	12	2675619	2675630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013353	TTTGGC	2	12	2678111	2678122	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013353	CCACTA	2	12	2752144	2752155	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013353	TTACCC	2	12	2783071	2783082	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013353	TAAATG	2	12	2800943	2800954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013353	TGTCAC	2	12	2814572	2814583	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013353	AGAAAA	2	12	2824852	2824863	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013353	TCACAC	2	12	2878706	2878717	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013353	ATTAAA	2	12	2908606	2908617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013353	GTTAAC	2	12	2927174	2927185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013353	GTTAAC	2	12	2927238	2927249	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013353	CTGATG	2	12	2945999	2946010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_013353	GTTATG	2	12	2965119	2965130	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013353	CAAGTG	2	12	2981953	2981964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_013353	GGCGCG	2	12	3046107	3046118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013353	ACGTTG	2	12	3048199	3048210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013353	TCCTTC	2	12	3082312	3082323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013353	ATTTTG	2	12	3117518	3117529	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013353	CGATGC	2	12	3117656	3117667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013353	TGGACA	2	12	3133580	3133591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_013353	CAGTTT	2	12	3190893	3190904	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013353	ATCTTA	2	12	3320987	3320998	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_013353	ACCGGC	2	12	3348316	3348327	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013353	CGGTTT	2	12	3371040	3371051	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_013353	GGTTTT	2	12	3385061	3385072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013353	ACAAGA	2	12	3389392	3389403	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_013353	AATTTT	2	12	3490130	3490141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013353	ATCGCG	2	12	3548587	3548598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013353	GTAAGG	2	12	3565435	3565446	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013353	GTAAGG	2	12	3565827	3565838	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013353	GTCGCC	2	12	3585819	3585830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013353	ACTGAG	2	12	3593898	3593909	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_013353	ATGCTG	2	12	3640882	3640893	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_013353	ATGAAG	2	12	3641306	3641317	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_013353	GCAGAA	2	12	3661823	3661834	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_013353	CGTCAC	2	12	3671566	3671577	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013353	ATTAAA	2	12	3679804	3679815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_013353	TTTATT	2	12	3703631	3703642	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_013353	CTTATC	2	12	3710116	3710127	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013353	GTAAAG	2	12	3723226	3723237	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_013353	TTTTCG	2	12	3732567	3732578	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_013353	TTATAT	2	12	3796099	3796110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013353	GAGCAG	2	12	3802998	3803009	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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169	NC_013353	GTAACC	2	12	3946693	3946704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_013353	AGCGTT	2	12	4095122	4095133	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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181	NC_013353	TATTTA	2	12	4415557	4415568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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218	NC_013353	GGTATC	2	12	5382147	5382158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
219	NC_013353	TTTATT	2	12	5393500	5393511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_013353	AGTAAA	2	12	5438335	5438346	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.