MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O103:H2 str. 12009

Total Repeats: 2905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013353	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	260842241
2	NC_013353	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	260842242
3	NC_013353	GAAAG	2	10	6655	6664	60 %	0 %	40 %	0 %	260842245
4	NC_013353	CGCAG	2	10	9638	9647	20 %	0 %	40 %	40 %	260842248
5	NC_013353	CGTAC	2	10	11066	11075	20 %	20 %	20 %	40 %	260842249
6	NC_013353	CGCGC	2	10	12053	12062	0 %	0 %	40 %	60 %	260842251
7	NC_013353	CCGAT	2	10	17770	17779	20 %	20 %	20 %	40 %	260842257
8	NC_013353	AGCGA	2	10	18158	18167	40 %	0 %	40 %	20 %	260842257
9	NC_013353	ATTGC	2	10	22953	22962	20 %	40 %	20 %	20 %	260842259
10	NC_013353	CAGTA	2	10	29863	29872	40 %	20 %	20 %	20 %	260842266
11	NC_013353	GCGAA	2	10	35658	35667	40 %	0 %	40 %	20 %	260842270
12	NC_013353	CCGTT	2	10	36552	36561	0 %	40 %	20 %	40 %	260842270
13	NC_013353	CACGG	2	10	36929	36938	20 %	0 %	40 %	40 %	260842270
14	NC_013353	CGAAT	2	10	39638	39647	40 %	20 %	20 %	20 %	260842275
15	NC_013353	CCATG	2	10	41176	41185	20 %	20 %	20 %	40 %	260842276
16	NC_013353	CCGTA	2	10	42822	42831	20 %	20 %	20 %	40 %	260842277
17	NC_013353	GTACA	2	10	43312	43321	40 %	20 %	20 %	20 %	260842277
18	NC_013353	TTAAA	2	10	43560	43569	60 %	40 %	0 %	0 %	260842277
19	NC_013353	ACCCA	2	10	44303	44312	40 %	0 %	0 %	60 %	260842278
20	NC_013353	TTTGA	2	10	45930	45939	20 %	60 %	20 %	0 %	260842279
21	NC_013353	CGGCG	2	10	46181	46190	0 %	0 %	60 %	40 %	260842279
22	NC_013353	AATCA	2	10	46463	46472	60 %	20 %	0 %	20 %	260842280
23	NC_013353	CGGTT	2	10	47418	47427	0 %	40 %	40 %	20 %	260842281
24	NC_013353	TGGCG	2	10	49110	49119	0 %	20 %	60 %	20 %	260842283
25	NC_013353	TGCAC	2	10	50872	50881	20 %	20 %	20 %	40 %	260842284
26	NC_013353	AACGT	2	10	54716	54725	40 %	20 %	20 %	20 %	260842287
27	NC_013353	GCGTC	2	10	57700	57709	0 %	20 %	40 %	40 %	260842290
28	NC_013353	ATGTT	2	10	58514	58523	20 %	60 %	20 %	0 %	260842291
29	NC_013353	CTTCG	2	10	58947	58956	0 %	40 %	20 %	40 %	260842291
30	NC_013353	TGCGT	2	10	59233	59242	0 %	40 %	40 %	20 %	260842291
31	NC_013353	AAAGT	2	10	64967	64976	60 %	20 %	20 %	0 %	260842294
32	NC_013353	AGTCG	2	10	65936	65945	20 %	20 %	40 %	20 %	260842295
33	NC_013353	GGTGA	2	10	67215	67224	20 %	20 %	60 %	0 %	260842295
34	NC_013353	TCGCG	2	10	69853	69862	0 %	20 %	40 %	40 %	260842297
35	NC_013353	GATGG	2	10	78219	78228	20 %	20 %	60 %	0 %	260842304
36	NC_013353	CTGGA	2	10	80119	80128	20 %	20 %	40 %	20 %	260842306
37	NC_013353	CCTGG	2	10	81693	81702	0 %	20 %	40 %	40 %	260842308
38	NC_013353	CTGGT	2	10	83412	83421	0 %	40 %	40 %	20 %	260842309
39	NC_013353	GACCG	2	10	83960	83969	20 %	0 %	40 %	40 %	260842310
40	NC_013353	ATGTT	2	10	86509	86518	20 %	60 %	20 %	0 %	260842312
41	NC_013353	TGCAT	2	10	87451	87460	20 %	40 %	20 %	20 %	260842313
42	NC_013353	ATTCC	2	10	87621	87630	20 %	40 %	0 %	40 %	260842313
43	NC_013353	AGTTC	2	10	92714	92723	20 %	40 %	20 %	20 %	260842318
44	NC_013353	CGTGG	2	10	94087	94096	0 %	20 %	60 %	20 %	260842320
45	NC_013353	TATCG	2	10	94594	94603	20 %	40 %	20 %	20 %	260842320
46	NC_013353	GCCTG	2	10	98926	98935	0 %	20 %	40 %	40 %	260842324
47	NC_013353	GTTTG	2	10	99370	99379	0 %	60 %	40 %	0 %	260842324
48	NC_013353	ACCGT	2	10	100839	100848	20 %	20 %	20 %	40 %	260842325
49	NC_013353	ATCAG	2	10	102612	102621	40 %	20 %	20 %	20 %	260842327
50	NC_013353	AGCCG	2	10	104380	104389	20 %	0 %	40 %	40 %	260842328
51	NC_013353	GCGCA	2	10	106708	106717	20 %	0 %	40 %	40 %	260842330
52	NC_013353	TGGCG	2	10	107702	107711	0 %	20 %	60 %	20 %	260842331
53	NC_013353	CCGGC	2	10	110672	110681	0 %	0 %	40 %	60 %	260842334
54	NC_013353	CGCGG	2	10	113881	113890	0 %	0 %	60 %	40 %	260842337
55	NC_013353	ATCCC	2	10	116125	116134	20 %	20 %	0 %	60 %	260842340
56	NC_013353	CATCG	2	10	116138	116147	20 %	20 %	20 %	40 %	260842340
57	NC_013353	TAACG	2	10	116832	116841	40 %	20 %	20 %	20 %	260842340
58	NC_013353	ATGCC	2	10	117291	117300	20 %	20 %	20 %	40 %	260842340
59	NC_013353	AATGC	2	10	118574	118583	40 %	20 %	20 %	20 %	260842341
60	NC_013353	TCTGT	2	10	119520	119529	0 %	60 %	20 %	20 %	260842343
61	NC_013353	GCATG	2	10	120613	120622	20 %	20 %	40 %	20 %	260842344
62	NC_013353	AGCAG	2	10	121951	121960	40 %	0 %	40 %	20 %	260842346
63	NC_013353	TCAGC	2	10	122819	122828	20 %	20 %	20 %	40 %	260842346
64	NC_013353	CGAAG	2	10	123866	123875	40 %	0 %	40 %	20 %	260842347
65	NC_013353	ACACG	2	10	123999	124008	40 %	0 %	20 %	40 %	260842347
66	NC_013353	TCGCG	2	10	124260	124269	0 %	20 %	40 %	40 %	260842347
67	NC_013353	GCATC	2	10	124350	124359	20 %	20 %	20 %	40 %	260842347
68	NC_013353	GACTG	2	10	125668	125677	20 %	20 %	40 %	20 %	260842348
69	NC_013353	AGAGC	2	10	126078	126087	40 %	0 %	40 %	20 %	260842348
70	NC_013353	GGTTG	2	10	132007	132016	0 %	40 %	60 %	0 %	260842351
71	NC_013353	TCTGG	2	10	134653	134662	0 %	40 %	40 %	20 %	260842352
72	NC_013353	GGGCA	2	10	136065	136074	20 %	0 %	60 %	20 %	260842353
73	NC_013353	CAGCG	2	10	136344	136353	20 %	0 %	40 %	40 %	260842354
74	NC_013353	GGCTG	2	10	139055	139064	0 %	20 %	60 %	20 %	260842357
75	NC_013353	CCGTC	2	10	143174	143183	0 %	20 %	20 %	60 %	260842359
76	NC_013353	GTGAA	2	10	143184	143193	40 %	20 %	40 %	0 %	260842359
77	NC_013353	GTTCA	2	10	143571	143580	20 %	40 %	20 %	20 %	260842360
78	NC_013353	ATCCA	2	10	143897	143906	40 %	20 %	0 %	40 %	260842360
79	NC_013353	CTTTA	2	10	145160	145169	20 %	60 %	0 %	20 %	260842362
80	NC_013353	TGGCG	2	10	145387	145396	0 %	20 %	60 %	20 %	260842362
81	NC_013353	CGGGC	2	10	146575	146584	0 %	0 %	60 %	40 %	260842364
82	NC_013353	TTTCA	2	10	147700	147709	20 %	60 %	0 %	20 %	260842365
83	NC_013353	GGGAG	2	10	149025	149034	20 %	0 %	80 %	0 %	260842366
84	NC_013353	TGAAG	2	10	150923	150932	40 %	20 %	40 %	0 %	260842368
85	NC_013353	TTTGC	2	10	158013	158022	0 %	60 %	20 %	20 %	260842375
86	NC_013353	GCGAG	2	10	159821	159830	20 %	0 %	60 %	20 %	260842377
87	NC_013353	GGCGT	2	10	160259	160268	0 %	20 %	60 %	20 %	260842377
88	NC_013353	ATCAG	2	10	160897	160906	40 %	20 %	20 %	20 %	260842378
89	NC_013353	ACCAC	2	10	163162	163171	40 %	0 %	0 %	60 %	260842381
90	NC_013353	GGCGT	2	10	164865	164874	0 %	20 %	60 %	20 %	260842382
91	NC_013353	CGACG	2	10	165904	165913	20 %	0 %	40 %	40 %	260842382
92	NC_013353	AAAAC	2	10	169891	169900	80 %	0 %	0 %	20 %	260842384
93	NC_013353	TGGTT	2	10	170148	170157	0 %	60 %	40 %	0 %	260842384
94	NC_013353	AACCT	2	10	172229	172238	40 %	20 %	0 %	40 %	260842386
95	NC_013353	TGGTC	2	10	172271	172280	0 %	40 %	40 %	20 %	260842386
96	NC_013353	TGGCG	2	10	173516	173525	0 %	20 %	60 %	20 %	260842387
97	NC_013353	CGGCG	2	10	174146	174155	0 %	0 %	60 %	40 %	260842387
98	NC_013353	TGGTG	2	10	174158	174167	0 %	40 %	60 %	0 %	260842387
99	NC_013353	TTCCA	2	10	174757	174766	20 %	40 %	0 %	40 %	260842387
100	NC_013353	GGTCC	2	10	179080	179089	0 %	20 %	40 %	40 %	260842392
101	NC_013353	ACGGG	2	10	180997	181006	20 %	0 %	60 %	20 %	260842394
102	NC_013353	GTGAT	2	10	183156	183165	20 %	40 %	40 %	0 %	260842395
103	NC_013353	GTGAT	2	10	183447	183456	20 %	40 %	40 %	0 %	260842395
104	NC_013353	GCCAG	2	10	187163	187172	20 %	0 %	40 %	40 %	260842399
105	NC_013353	GTTCT	2	10	188604	188613	0 %	60 %	20 %	20 %	260842399
106	NC_013353	CTGAA	2	10	190596	190605	40 %	20 %	20 %	20 %	260842401
107	NC_013353	AAGCG	2	10	190660	190669	40 %	0 %	40 %	20 %	260842401
108	NC_013353	TGGTG	2	10	192566	192575	0 %	40 %	60 %	0 %	260842403
109	NC_013353	TGCAC	2	10	192692	192701	20 %	20 %	20 %	40 %	260842403
110	NC_013353	TGCGC	2	10	193085	193094	0 %	20 %	40 %	40 %	260842403
111	NC_013353	CATGG	2	10	194928	194937	20 %	20 %	40 %	20 %	260842405
112	NC_013353	CAGAT	2	10	195967	195976	40 %	20 %	20 %	20 %	260842406
113	NC_013353	ACTTT	2	10	196100	196109	20 %	60 %	0 %	20 %	260842406
114	NC_013353	GACGT	2	10	200020	200029	20 %	20 %	40 %	20 %	260842409
115	NC_013353	CGACG	2	10	201847	201856	20 %	0 %	40 %	40 %	260842411
116	NC_013353	ATGCC	2	10	204415	204424	20 %	20 %	20 %	40 %	260842414
117	NC_013353	GGATG	2	10	204677	204686	20 %	20 %	60 %	0 %	260842414
118	NC_013353	TGGCC	2	10	205741	205750	0 %	20 %	40 %	40 %	260842416
119	NC_013353	GTAAC	2	10	206484	206493	40 %	20 %	20 %	20 %	260842416
120	NC_013353	AGCCG	2	10	207112	207121	20 %	0 %	40 %	40 %	260842416
121	NC_013353	GGTGG	2	10	207221	207230	0 %	20 %	80 %	0 %	260842416
122	NC_013353	TTAAC	2	10	215364	215373	40 %	40 %	0 %	20 %	260842423
123	NC_013353	ACGGT	2	10	218231	218240	20 %	20 %	40 %	20 %	260842426
124	NC_013353	TGATT	2	10	221073	221082	20 %	60 %	20 %	0 %	260842429
125	NC_013353	TAATT	2	10	233088	233097	40 %	60 %	0 %	0 %	260842436
126	NC_013353	ACTTA	2	10	235058	235067	40 %	40 %	0 %	20 %	260842438
127	NC_013353	ACTGG	2	10	236026	236035	20 %	20 %	40 %	20 %	260842439
128	NC_013353	CGCGG	2	10	237071	237080	0 %	0 %	60 %	40 %	260842441
129	NC_013353	TTTAA	2	10	239452	239461	40 %	60 %	0 %	0 %	260842443
130	NC_013353	TGATC	2	10	240807	240816	20 %	40 %	20 %	20 %	260842445
131	NC_013353	CCAGA	2	10	242581	242590	40 %	0 %	20 %	40 %	260842447
132	NC_013353	CGCTG	2	10	246842	246851	0 %	20 %	40 %	40 %	260842448
133	NC_013353	GCGCA	2	10	249283	249292	20 %	0 %	40 %	40 %	260842450
134	NC_013353	GGGCA	2	10	252029	252038	20 %	0 %	60 %	20 %	260842452
135	NC_013353	ATTTC	2	10	252539	252548	20 %	60 %	0 %	20 %	260842452
136	NC_013353	CCAGC	2	10	254771	254780	20 %	0 %	20 %	60 %	260842455
137	NC_013353	CCAGG	2	10	255428	255437	20 %	0 %	40 %	40 %	260842455
138	NC_013353	AAGGC	2	10	255555	255564	40 %	0 %	40 %	20 %	260842455
139	NC_013353	GCCGT	2	10	256035	256044	0 %	20 %	40 %	40 %	260842456
140	NC_013353	ACCGG	2	10	257878	257887	20 %	0 %	40 %	40 %	260842457
141	NC_013353	AAGGC	2	10	263691	263700	40 %	0 %	40 %	20 %	260842462
142	NC_013353	GCCCG	2	10	264164	264173	0 %	0 %	40 %	60 %	260842463
143	NC_013353	TGACC	2	10	266030	266039	20 %	20 %	20 %	40 %	260842463
144	NC_013353	AGCGC	2	10	267218	267227	20 %	0 %	40 %	40 %	260842463
145	NC_013353	GGTGT	2	10	267276	267285	0 %	40 %	60 %	0 %	260842463
146	NC_013353	AGCAA	2	10	268169	268178	60 %	0 %	20 %	20 %	260842463
147	NC_013353	AAACG	2	10	277771	277780	60 %	0 %	20 %	20 %	260842470
148	NC_013353	TTGCT	2	10	278776	278785	0 %	60 %	20 %	20 %	260842473
149	NC_013353	TCAAC	2	10	280269	280278	40 %	20 %	0 %	40 %	260842476
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151	NC_013353	CGATG	2	10	282420	282429	20 %	20 %	40 %	20 %	260842477
152	NC_013353	GATGC	2	10	289243	289252	20 %	20 %	40 %	20 %	260842484
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154	NC_013353	GTGAT	2	10	292446	292455	20 %	40 %	40 %	0 %	260842487
155	NC_013353	TCGCT	2	10	293219	293228	0 %	40 %	20 %	40 %	260842488
156	NC_013353	GTCGG	2	10	296780	296789	0 %	20 %	60 %	20 %	260842491
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165	NC_013353	AGATC	2	10	312882	312891	40 %	20 %	20 %	20 %	260842504
166	NC_013353	GCGCC	2	10	314687	314696	0 %	0 %	40 %	60 %	260842504
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168	NC_013353	GCGTG	2	10	317220	317229	0 %	20 %	60 %	20 %	260842506
169	NC_013353	ATGTT	2	10	324087	324096	20 %	60 %	20 %	0 %	260842513
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177	NC_013353	GGGCA	2	10	342430	342439	20 %	0 %	60 %	20 %	260842525
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198	NC_013353	GCGAA	2	10	379185	379194	40 %	0 %	40 %	20 %	260842554
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247	NC_013353	CAACA	2	10	484083	484092	60 %	0 %	0 %	40 %	260842654
248	NC_013353	TGCTG	2	10	484162	484171	0 %	40 %	40 %	20 %	260842654
249	NC_013353	TCCGG	2	10	484665	484674	0 %	20 %	40 %	40 %	260842655
250	NC_013353	TTAAG	2	10	493010	493019	40 %	40 %	20 %	0 %	260842663
251	NC_013353	TCAAC	2	10	496396	496405	40 %	20 %	0 %	40 %	260842665
252	NC_013353	GCCTG	2	10	496619	496628	0 %	20 %	40 %	40 %	260842665
253	NC_013353	CGCTG	2	10	502012	502021	0 %	20 %	40 %	40 %	260842670
254	NC_013353	ATCGT	2	10	506116	506125	20 %	40 %	20 %	20 %	260842674
255	NC_013353	TTGAT	2	10	508099	508108	20 %	60 %	20 %	0 %	260842676
256	NC_013353	AAATA	2	10	508294	508303	80 %	20 %	0 %	0 %	260842676
257	NC_013353	CCAGC	2	10	511492	511501	20 %	0 %	20 %	60 %	260842678
258	NC_013353	GGCGT	2	10	513521	513530	0 %	20 %	60 %	20 %	260842680
259	NC_013353	GAAGC	2	10	514085	514094	40 %	0 %	40 %	20 %	260842680
260	NC_013353	AGGTG	2	10	515134	515143	20 %	20 %	60 %	0 %	260842680
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