MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 10212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013315	ATGC	2	8	457	464	25 %	25 %	25 %	25 %	260681770
2	NC_013315	AATA	2	8	583	590	75 %	25 %	0 %	0 %	260681770
3	NC_013315	AGAA	2	8	642	649	75 %	0 %	25 %	0 %	260681770
4	NC_013315	CAAA	3	12	692	703	75 %	0 %	0 %	25 %	260681770
5	NC_013315	AAAC	2	8	1976	1983	75 %	0 %	0 %	25 %	260681771
6	NC_013315	CAAA	2	8	2006	2013	75 %	0 %	0 %	25 %	260681771
7	NC_013315	TAGA	2	8	2046	2053	50 %	25 %	25 %	0 %	260681771
8	NC_013315	TAAT	2	8	2232	2239	50 %	50 %	0 %	0 %	260681771
9	NC_013315	TACT	2	8	2630	2637	25 %	50 %	0 %	25 %	260681771
10	NC_013315	CTTT	2	8	3164	3171	0 %	75 %	0 %	25 %	260681773
11	NC_013315	AATA	2	8	3313	3320	75 %	25 %	0 %	0 %	260681773
12	NC_013315	GGTT	2	8	3393	3400	0 %	50 %	50 %	0 %	260681773
13	NC_013315	AAAG	2	8	3413	3420	75 %	0 %	25 %	0 %	260681773
14	NC_013315	AAAT	2	8	3699	3706	75 %	25 %	0 %	0 %	260681773
15	NC_013315	GTAT	2	8	4215	4222	25 %	50 %	25 %	0 %	260681774
16	NC_013315	ATGG	2	8	4525	4532	25 %	25 %	50 %	0 %	260681774
17	NC_013315	TTTA	2	8	4542	4549	25 %	75 %	0 %	0 %	260681774
18	NC_013315	CTTT	2	8	4718	4725	0 %	75 %	0 %	25 %	260681774
19	NC_013315	TAAA	2	8	4830	4837	75 %	25 %	0 %	0 %	260681774
20	NC_013315	AAAT	2	8	5041	5048	75 %	25 %	0 %	0 %	260681774
21	NC_013315	TGAG	2	8	6217	6224	25 %	25 %	50 %	0 %	260681775
22	NC_013315	GATA	2	8	6653	6660	50 %	25 %	25 %	0 %	260681775
23	NC_013315	AAAG	2	8	6738	6745	75 %	0 %	25 %	0 %	260681775
24	NC_013315	AGTT	2	8	6895	6902	25 %	50 %	25 %	0 %	260681775
25	NC_013315	TAAA	2	8	7168	7175	75 %	25 %	0 %	0 %	260681775
26	NC_013315	ATAA	2	8	7953	7960	75 %	25 %	0 %	0 %	260681775
27	NC_013315	GTAA	2	8	8196	8203	50 %	25 %	25 %	0 %	260681775
28	NC_013315	AATG	2	8	8856	8863	50 %	25 %	25 %	0 %	260681776
29	NC_013315	ATTT	2	8	8920	8927	25 %	75 %	0 %	0 %	260681777
30	NC_013315	ATAA	2	8	8947	8954	75 %	25 %	0 %	0 %	260681777
31	NC_013315	TAAT	2	8	9062	9069	50 %	50 %	0 %	0 %	260681777
32	NC_013315	AAAT	2	8	9164	9171	75 %	25 %	0 %	0 %	260681778
33	NC_013315	AAAT	2	8	9346	9353	75 %	25 %	0 %	0 %	260681778
34	NC_013315	GATA	2	8	10070	10077	50 %	25 %	25 %	0 %	260681780
35	NC_013315	AGAT	2	8	10501	10508	50 %	25 %	25 %	0 %	260681780
36	NC_013315	AAGA	2	8	16627	16634	75 %	0 %	25 %	0 %	260681782
37	NC_013315	TAAT	2	8	17007	17014	50 %	50 %	0 %	0 %	260681782
38	NC_013315	TGAA	2	8	17097	17104	50 %	25 %	25 %	0 %	260681782
39	NC_013315	AAAT	2	8	17257	17264	75 %	25 %	0 %	0 %	260681782
40	NC_013315	TTCC	2	8	17295	17302	0 %	50 %	0 %	50 %	260681782
41	NC_013315	CAAG	2	8	18888	18895	50 %	0 %	25 %	25 %	260681783
42	NC_013315	AAAT	2	8	19077	19084	75 %	25 %	0 %	0 %	260681783
43	NC_013315	ATGT	2	8	20993	21000	25 %	50 %	25 %	0 %	260681785
44	NC_013315	AGAT	2	8	21016	21023	50 %	25 %	25 %	0 %	260681785
45	NC_013315	AGTG	2	8	21908	21915	25 %	25 %	50 %	0 %	260681785
46	NC_013315	CAAG	2	8	22318	22325	50 %	0 %	25 %	25 %	260681786
47	NC_013315	ATGG	2	8	22729	22736	25 %	25 %	50 %	0 %	260681787
48	NC_013315	TCAT	2	8	23729	23736	25 %	50 %	0 %	25 %	260681788
49	NC_013315	ACAT	2	8	23758	23765	50 %	25 %	0 %	25 %	260681788
50	NC_013315	AGAA	2	8	23959	23966	75 %	0 %	25 %	0 %	260681788
51	NC_013315	CTAT	2	8	24494	24501	25 %	50 %	0 %	25 %	260681788
52	NC_013315	AAGT	2	8	24540	24547	50 %	25 %	25 %	0 %	260681788
53	NC_013315	ATGG	2	8	34948	34955	25 %	25 %	50 %	0 %	260681790
54	NC_013315	CAAA	2	8	35204	35211	75 %	0 %	0 %	25 %	260681790
55	NC_013315	AATA	2	8	35979	35986	75 %	25 %	0 %	0 %	260681790
56	NC_013315	ATTT	2	8	36119	36126	25 %	75 %	0 %	0 %	260681790
57	NC_013315	GAAG	2	8	36268	36275	50 %	0 %	50 %	0 %	260681790
58	NC_013315	ATCA	2	8	36374	36381	50 %	25 %	0 %	25 %	260681790
59	NC_013315	ATTT	2	8	37130	37137	25 %	75 %	0 %	0 %	260681790
60	NC_013315	AAAT	2	8	37413	37420	75 %	25 %	0 %	0 %	260681790
61	NC_013315	TAAA	2	8	37769	37776	75 %	25 %	0 %	0 %	260681790
62	NC_013315	ATGA	2	8	37960	37967	50 %	25 %	25 %	0 %	260681790
63	NC_013315	AGCA	2	8	37983	37990	50 %	0 %	25 %	25 %	260681790
64	NC_013315	TCAA	2	8	38119	38126	50 %	25 %	0 %	25 %	260681790
65	NC_013315	AACT	2	8	38742	38749	50 %	25 %	0 %	25 %	260681791
66	NC_013315	TAAA	2	8	38775	38782	75 %	25 %	0 %	0 %	260681791
67	NC_013315	ATAA	2	8	39302	39309	75 %	25 %	0 %	0 %	260681791
68	NC_013315	AGAT	2	8	39471	39478	50 %	25 %	25 %	0 %	260681791
69	NC_013315	TAAA	2	8	39552	39559	75 %	25 %	0 %	0 %	260681791
70	NC_013315	ATAA	2	8	40133	40140	75 %	25 %	0 %	0 %	260681791
71	NC_013315	AAAT	2	8	40919	40926	75 %	25 %	0 %	0 %	260681792
72	NC_013315	ATAG	2	8	40951	40958	50 %	25 %	25 %	0 %	260681792
73	NC_013315	AGTG	2	8	41362	41369	25 %	25 %	50 %	0 %	260681793
74	NC_013315	TAGA	2	8	41684	41691	50 %	25 %	25 %	0 %	260681793
75	NC_013315	GCTA	2	8	41820	41827	25 %	25 %	25 %	25 %	260681794
76	NC_013315	AAAT	2	8	41853	41860	75 %	25 %	0 %	0 %	260681794
77	NC_013315	GAAC	2	8	42361	42368	50 %	0 %	25 %	25 %	260681794
78	NC_013315	AAAT	2	8	43081	43088	75 %	25 %	0 %	0 %	260681795
79	NC_013315	TTAT	2	8	43637	43644	25 %	75 %	0 %	0 %	260681795
80	NC_013315	AGCC	2	8	43716	43723	25 %	0 %	25 %	50 %	260681795
81	NC_013315	AGAA	2	8	43804	43811	75 %	0 %	25 %	0 %	260681795
82	NC_013315	CAGA	2	8	43962	43969	50 %	0 %	25 %	25 %	260681795
83	NC_013315	TTGA	2	8	43994	44001	25 %	50 %	25 %	0 %	260681795
84	NC_013315	GAAA	2	8	44878	44885	75 %	0 %	25 %	0 %	260681795
85	NC_013315	CACT	2	8	44957	44964	25 %	25 %	0 %	50 %	260681795
86	NC_013315	AATT	2	8	45069	45076	50 %	50 %	0 %	0 %	260681795
87	NC_013315	ATGT	2	8	45446	45453	25 %	50 %	25 %	0 %	260681796
88	NC_013315	CAGT	2	8	45590	45597	25 %	25 %	25 %	25 %	260681796
89	NC_013315	TAGA	2	8	45653	45660	50 %	25 %	25 %	0 %	260681796
90	NC_013315	AATA	2	8	46793	46800	75 %	25 %	0 %	0 %	260681796
91	NC_013315	ATGG	2	8	47013	47020	25 %	25 %	50 %	0 %	260681797
92	NC_013315	AAAC	2	8	47142	47149	75 %	0 %	0 %	25 %	260681797
93	NC_013315	AGTA	2	8	47450	47457	50 %	25 %	25 %	0 %	260681797
94	NC_013315	TAAA	2	8	48146	48153	75 %	25 %	0 %	0 %	260681798
95	NC_013315	TATT	2	8	48256	48263	25 %	75 %	0 %	0 %	260681798
96	NC_013315	ATTT	2	8	48371	48378	25 %	75 %	0 %	0 %	260681798
97	NC_013315	AGAA	2	8	48653	48660	75 %	0 %	25 %	0 %	260681798
98	NC_013315	TAAA	2	8	48779	48786	75 %	25 %	0 %	0 %	260681798
99	NC_013315	TCTT	2	8	49200	49207	0 %	75 %	0 %	25 %	260681799
100	NC_013315	TAAA	2	8	49768	49775	75 %	25 %	0 %	0 %	260681799
101	NC_013315	ATTG	2	8	49820	49827	25 %	50 %	25 %	0 %	260681799
102	NC_013315	GATG	2	8	50255	50262	25 %	25 %	50 %	0 %	260681799
103	NC_013315	TTTA	2	8	50363	50370	25 %	75 %	0 %	0 %	260681799
104	NC_013315	TTAC	2	8	50754	50761	25 %	50 %	0 %	25 %	260681799
105	NC_013315	AGCT	2	8	51094	51101	25 %	25 %	25 %	25 %	260681799
106	NC_013315	GATG	2	8	51191	51198	25 %	25 %	50 %	0 %	260681799
107	NC_013315	TTTA	2	8	51297	51304	25 %	75 %	0 %	0 %	260681799
108	NC_013315	TTAA	2	8	51669	51676	50 %	50 %	0 %	0 %	260681800
109	NC_013315	TAAG	2	8	51719	51726	50 %	25 %	25 %	0 %	260681800
110	NC_013315	TAAT	2	8	51819	51826	50 %	50 %	0 %	0 %	260681800
111	NC_013315	TACA	2	8	52938	52945	50 %	25 %	0 %	25 %	260681801
112	NC_013315	AGAA	2	8	53116	53123	75 %	0 %	25 %	0 %	260681801
113	NC_013315	AATG	2	8	53134	53141	50 %	25 %	25 %	0 %	260681801
114	NC_013315	GATG	2	8	53384	53391	25 %	25 %	50 %	0 %	260681801
115	NC_013315	CTTC	2	8	53987	53994	0 %	50 %	0 %	50 %	260681802
116	NC_013315	ATTT	2	8	54042	54049	25 %	75 %	0 %	0 %	260681802
117	NC_013315	GAAA	2	8	54295	54302	75 %	0 %	25 %	0 %	260681802
118	NC_013315	TAAA	2	8	54948	54955	75 %	25 %	0 %	0 %	260681802
119	NC_013315	GTAG	2	8	55709	55716	25 %	25 %	50 %	0 %	260681803
120	NC_013315	AATT	2	8	55896	55903	50 %	50 %	0 %	0 %	260681803
121	NC_013315	TTAT	2	8	55938	55945	25 %	75 %	0 %	0 %	260681803
122	NC_013315	CAAT	2	8	55950	55957	50 %	25 %	0 %	25 %	260681803
123	NC_013315	TTTA	2	8	56251	56258	25 %	75 %	0 %	0 %	260681803
124	NC_013315	CCTA	2	8	56812	56819	25 %	25 %	0 %	50 %	260681803
125	NC_013315	ATGA	2	8	58031	58038	50 %	25 %	25 %	0 %	260681804
126	NC_013315	GAAT	2	8	58387	58394	50 %	25 %	25 %	0 %	260681805
127	NC_013315	AGTT	2	8	58418	58425	25 %	50 %	25 %	0 %	260681805
128	NC_013315	TAAA	2	8	58579	58586	75 %	25 %	0 %	0 %	260681805
129	NC_013315	ATCT	2	8	59176	59183	25 %	50 %	0 %	25 %	260681805
130	NC_013315	CAAT	2	8	59223	59230	50 %	25 %	0 %	25 %	260681805
131	NC_013315	TGTA	2	8	60086	60093	25 %	50 %	25 %	0 %	260681806
132	NC_013315	GATA	2	8	60326	60333	50 %	25 %	25 %	0 %	260681807
133	NC_013315	CAAA	2	8	61027	61034	75 %	0 %	0 %	25 %	260681807
134	NC_013315	AAAG	2	8	61056	61063	75 %	0 %	25 %	0 %	260681807
135	NC_013315	CATA	2	8	61722	61729	50 %	25 %	0 %	25 %	260681808
136	NC_013315	AAAG	2	8	62595	62602	75 %	0 %	25 %	0 %	260681808
137	NC_013315	TTAA	2	8	63853	63860	50 %	50 %	0 %	0 %	260681809
138	NC_013315	TAAA	2	8	63896	63903	75 %	25 %	0 %	0 %	260681809
139	NC_013315	GTAT	2	8	64208	64215	25 %	50 %	25 %	0 %	260681809
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