MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 13835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013315	AT	3	6	882	887	50 %	50 %	0 %	0 %	260681770
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4	NC_013315	TA	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	260681771
5	NC_013315	AG	4	8	2356	2363	50 %	0 %	50 %	0 %	260681771
6	NC_013315	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	260681771
7	NC_013315	AT	3	6	2831	2836	50 %	50 %	0 %	0 %	260681772
8	NC_013315	AT	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	260681773
9	NC_013315	TA	3	6	3735	3740	50 %	50 %	0 %	0 %	260681773
10	NC_013315	AT	3	6	3828	3833	50 %	50 %	0 %	0 %	260681773
11	NC_013315	AT	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	260681774
12	NC_013315	AT	3	6	4559	4564	50 %	50 %	0 %	0 %	260681774
13	NC_013315	AT	3	6	4816	4821	50 %	50 %	0 %	0 %	260681774
14	NC_013315	TA	3	6	4868	4873	50 %	50 %	0 %	0 %	260681774
15	NC_013315	AT	3	6	4940	4945	50 %	50 %	0 %	0 %	260681774
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17	NC_013315	AT	3	6	5689	5694	50 %	50 %	0 %	0 %	260681774
18	NC_013315	TA	3	6	5742	5747	50 %	50 %	0 %	0 %	260681774
19	NC_013315	GA	3	6	5859	5864	50 %	0 %	50 %	0 %	260681774
20	NC_013315	AT	3	6	6039	6044	50 %	50 %	0 %	0 %	260681774
21	NC_013315	AG	4	8	6045	6052	50 %	0 %	50 %	0 %	260681774
22	NC_013315	GA	3	6	6467	6472	50 %	0 %	50 %	0 %	260681775
23	NC_013315	GA	3	6	7503	7508	50 %	0 %	50 %	0 %	260681775
24	NC_013315	GA	3	6	7547	7552	50 %	0 %	50 %	0 %	260681775
25	NC_013315	AT	3	6	7598	7603	50 %	50 %	0 %	0 %	260681775
26	NC_013315	AG	3	6	7933	7938	50 %	0 %	50 %	0 %	260681775
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36	NC_013315	TA	3	6	10277	10282	50 %	50 %	0 %	0 %	260681780
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39	NC_013315	AC	3	6	11997	12002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013315	AC	3	6	12166	12171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013315	TA	3	6	12363	12368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013315	AT	4	8	12593	12600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013315	AT	3	6	12626	12631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013315	TG	3	6	13279	13284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013315	GA	3	6	13579	13584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013315	GA	3	6	14141	14146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013315	TG	3	6	14188	14193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013315	GA	3	6	14375	14380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013315	TC	3	6	14990	14995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013315	AG	3	6	15034	15039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013315	AT	4	8	15618	15625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_013315	TA	3	6	49900	49905	50 %	50 %	0 %	0 %	260681799
148	NC_013315	AT	3	6	50377	50382	50 %	50 %	0 %	0 %	260681799
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