MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile CD196 chromosome

Total Repeats: 4001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013315	AC	3	6	10937	10942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013315	AG	3	6	11923	11928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013315	AC	3	6	11997	12002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013315	AC	3	6	12166	12171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013315	TA	3	6	12363	12368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013315	AT	4	8	12593	12600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013315	AT	3	6	12626	12631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013315	TG	3	6	13279	13284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013315	GA	3	6	13579	13584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013315	GA	3	6	14141	14146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013315	TG	3	6	14188	14193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013315	GA	3	6	14375	14380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013315	TC	3	6	14990	14995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013315	AG	3	6	15034	15039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013315	AT	4	8	15618	15625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013315	AG	3	6	15723	15728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013315	CT	3	6	15765	15770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013315	TA	3	6	15907	15912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013315	AT	4	8	17441	17448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013315	AT	3	6	19126	19131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013315	TA	4	8	19306	19313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013315	GA	3	6	19859	19864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013315	CT	3	6	19938	19943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013315	TG	3	6	20174	20179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013315	AT	3	6	20258	20263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013315	AG	3	6	20314	20319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013315	TA	4	8	23388	23395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013315	AT	3	6	24676	24681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013315	AT	4	8	24860	24867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013315	AC	3	6	25257	25262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013315	AG	3	6	26243	26248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013315	AC	3	6	26317	26322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013315	AC	3	6	26486	26491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013315	AT	4	8	26815	26822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013315	AT	3	6	26848	26853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013315	TG	3	6	27501	27506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013315	GA	3	6	27801	27806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013315	GA	3	6	28363	28368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013315	TG	3	6	28410	28415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013315	GA	3	6	28597	28602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013315	TC	3	6	29212	29217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013315	AG	3	6	29256	29261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013315	AT	3	6	29840	29845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013315	TA	3	6	29900	29905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013315	AT	3	6	30997	31002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013315	GT	3	6	31052	31057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013315	AT	3	6	31088	31093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013315	GT	3	6	32977	32982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013315	AT	4	8	33013	33020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013315	AT	4	8	40379	40386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013315	TA	3	6	40479	40484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013315	GT	3	6	40788	40793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013315	AT	3	6	56981	56986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013315	AT	3	6	57159	57164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013315	TA	3	6	61458	61463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013315	AT	3	6	61517	61522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013315	AT	3	6	63643	63648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013315	TA	3	6	63663	63668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013315	TA	3	6	70369	70374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013315	AT	4	8	71479	71486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013315	AT	3	6	71495	71500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013315	AT	3	6	71552	71557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013315	TA	3	6	72874	72879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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65	NC_013315	AG	3	6	73072	73077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013315	TA	3	6	76667	76672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013315	AT	3	6	78500	78505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013315	TA	3	6	78872	78877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013315	AT	3	6	80785	80790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013315	AT	3	6	80935	80940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013315	GA	3	6	82572	82577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013315	AT	3	6	84106	84111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013315	AT	3	6	88968	88973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013315	AT	4	8	88979	88986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013315	TA	3	6	89979	89984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013315	TA	3	6	92462	92467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013315	AT	3	6	92490	92495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013315	TA	3	6	92562	92567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013315	TA	3	6	92571	92576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013315	TA	3	6	93695	93700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013315	GA	3	6	97754	97759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013315	GT	3	6	101308	101313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013315	AT	6	12	101997	102008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013315	AT	3	6	102556	102561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013315	AT	3	6	104719	104724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013315	AT	3	6	106043	106048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013315	GA	3	6	106183	106188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013315	AT	4	8	123135	123142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_013315	AT	3	6	125562	125567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013315	AT	3	6	126596	126601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013315	TA	3	6	126734	126739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013315	TA	3	6	126744	126749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013315	AT	3	6	126922	126927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013315	TA	3	6	127861	127866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013315	AC	3	6	128124	128129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013315	AG	3	6	129111	129116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013315	AC	3	6	129185	129190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013315	AC	3	6	129354	129359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013315	AT	4	8	129683	129690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013315	AT	3	6	129716	129721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_013315	GA	3	6	131232	131237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_013315	AT	3	6	132709	132714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_013315	AT	4	8	133612	133619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013315	AC	3	6	134852	134857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013315	AG	3	6	135838	135843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013315	AC	3	6	135912	135917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013315	AC	3	6	136081	136086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013315	TA	3	6	136177	136182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013315	AT	5	10	136427	136436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013315	AT	3	6	136462	136467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013315	TG	3	6	137115	137120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013315	GA	3	6	137415	137420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013315	GA	3	6	137977	137982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013315	TG	3	6	138024	138029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013315	GA	3	6	138211	138216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013315	TC	3	6	138826	138831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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126	NC_013315	AT	3	6	139456	139461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013315	AG	3	6	139572	139577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013315	CT	3	6	139614	139619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013315	TA	3	6	139708	139713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013315	AT	3	6	139812	139817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013315	TA	3	6	139834	139839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013315	AT	3	6	141144	141149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013315	AT	4	8	141156	141163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013315	AT	3	6	141417	141422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013315	AT	3	6	144378	144383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013315	AT	3	6	144386	144391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013315	TG	4	8	144659	144666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013315	AC	3	6	145260	145265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013315	AG	3	6	146246	146251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013315	AC	3	6	146320	146325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013315	AC	3	6	146489	146494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013315	TA	3	6	146686	146691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_013315	AT	3	6	147073	147078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013315	TG	3	6	147726	147731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013315	GA	3	6	148026	148031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013315	GA	3	6	148588	148593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013315	TG	3	6	148635	148640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013315	GA	3	6	148822	148827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013315	TC	3	6	149437	149442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013315	AG	3	6	149481	149486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013315	AT	3	6	150067	150072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_013315	CT	3	6	150225	150230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_013315	GT	3	6	151018	151023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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