MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU3

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013285	CGAAA	2	10	2893	2902	60 %	0 %	20 %	20 %	260600012
2	NC_013285	TGATC	2	10	3561	3570	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013285	CAAAC	2	10	3715	3724	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013285	TTCTT	2	10	4509	4518	0 %	80 %	0 %	20 %	260600014
5	NC_013285	CACGA	2	10	5223	5232	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013285	ATTGC	2	10	5882	5891	20 %	40 %	20 %	20 %	260600016
7	NC_013285	GTTAT	2	10	6575	6584	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013285	AGAAA	2	10	7125	7134	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013285	TTACC	2	10	7230	7239	20 %	40 %	0 %	40 %	260600017
10	NC_013285	TGGTG	2	10	10105	10114	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013285	AACAC	2	10	10394	10403	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_013285	CGCAG	2	10	11464	11473	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013285	CTGCG	2	10	11642	11651	0 %	20 %	40 %	40 %	260600022
14	NC_013285	ATGAA	2	10	13594	13603	60 %	20 %	20 %	0 %	260600027
15	NC_013285	TTTTC	2	10	13724	13733	0 %	80 %	0 %	20 %	260600027
16	NC_013285	GCCAG	2	10	15645	15654	20 %	0 %	40 %	40 %	260600030
17	NC_013285	GTTGT	2	10	15657	15666	0 %	60 %	40 %	0 %	260600030
18	NC_013285	TTTAC	2	10	16292	16301	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013285	CGCTG	2	10	16692	16701	0 %	20 %	40 %	40 %	260600032
20	NC_013285	CATGG	2	10	16836	16845	20 %	20 %	40 %	20 %	260600032
21	NC_013285	GGACG	2	10	18241	18250	20 %	0 %	60 %	20 %	260600035
22	NC_013285	AACCG	2	10	20558	20567	40 %	0 %	20 %	40 %	260600038
23	NC_013285	ATTTT	2	10	21117	21126	20 %	80 %	0 %	0 %	260600038
24	NC_013285	GCCAT	2	10	26475	26484	20 %	20 %	20 %	40 %	260600046
25	NC_013285	CCCGG	2	10	28188	28197	0 %	0 %	40 %	60 %	260600049
26	NC_013285	AAATG	2	10	28460	28469	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013285	TGGAA	2	10	28693	28702	40 %	20 %	40 %	0 %	260600050
28	NC_013285	AGCGG	2	10	29195	29204	20 %	0 %	60 %	20 %	260600051
29	NC_013285	GGCGA	2	10	29415	29424	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013285	AGACC	2	10	31460	31469	40 %	0 %	20 %	40 %	260600056
31	NC_013285	CATCG	2	10	31767	31776	20 %	20 %	20 %	40 %	260600056
32	NC_013285	TTCCC	2	10	32853	32862	0 %	40 %	0 %	60 %	260600058
33	NC_013285	AGTTA	2	10	32984	32993	40 %	40 %	20 %	0 %	260600058
34	NC_013285	GGTCA	2	10	36652	36661	20 %	20 %	40 %	20 %	260600062
35	NC_013285	TAAAT	2	10	36853	36862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013285	TGAAT	2	10	36884	36893	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013285	ACGCA	2	10	38391	38400	40 %	0 %	20 %	40 %	260600066
38	NC_013285	GACAG	2	10	40419	40428	40 %	0 %	40 %	20 %	260600066
39	NC_013285	TTATC	2	10	40520	40529	20 %	60 %	0 %	20 %	260600066
40	NC_013285	ATTCG	2	10	40934	40943	20 %	40 %	20 %	20 %	260600067
41	NC_013285	CGTCG	2	10	42517	42526	0 %	20 %	40 %	40 %	260600068
42	NC_013285	CTGTC	2	10	42648	42657	0 %	40 %	20 %	40 %	260600068
43	NC_013285	AGCTC	2	10	48948	48957	20 %	20 %	20 %	40 %	260600075
44	NC_013285	TATCC	2	10	50075	50084	20 %	40 %	0 %	40 %	260600075
45	NC_013285	TGCAC	2	10	51423	51432	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_013285	GATAT	2	10	51866	51875	40 %	40 %	20 %	0 %	260600078
47	NC_013285	TTTGG	2	10	52091	52100	0 %	60 %	40 %	0 %	260600078
48	NC_013285	CACCG	2	10	53141	53150	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_013285	CAGGC	2	10	53610	53619	20 %	0 %	40 %	40 %	260600080

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.