MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU3

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013285	CGAAA	2	10	2893	2902	60 %	0 %	20 %	20 %	260600012
2	NC_013285	TTCTT	2	10	4509	4518	0 %	80 %	0 %	20 %	260600014
3	NC_013285	ATTGC	2	10	5882	5891	20 %	40 %	20 %	20 %	260600016
4	NC_013285	TTACC	2	10	7230	7239	20 %	40 %	0 %	40 %	260600017
5	NC_013285	CTGCG	2	10	11642	11651	0 %	20 %	40 %	40 %	260600022
6	NC_013285	ATGAA	2	10	13594	13603	60 %	20 %	20 %	0 %	260600027
7	NC_013285	TTTTC	2	10	13724	13733	0 %	80 %	0 %	20 %	260600027
8	NC_013285	GCCAG	2	10	15645	15654	20 %	0 %	40 %	40 %	260600030
9	NC_013285	GTTGT	2	10	15657	15666	0 %	60 %	40 %	0 %	260600030
10	NC_013285	CGCTG	2	10	16692	16701	0 %	20 %	40 %	40 %	260600032
11	NC_013285	CATGG	2	10	16836	16845	20 %	20 %	40 %	20 %	260600032
12	NC_013285	GGACG	2	10	18241	18250	20 %	0 %	60 %	20 %	260600035
13	NC_013285	AACCG	2	10	20558	20567	40 %	0 %	20 %	40 %	260600038
14	NC_013285	ATTTT	2	10	21117	21126	20 %	80 %	0 %	0 %	260600038
15	NC_013285	GCCAT	2	10	26475	26484	20 %	20 %	20 %	40 %	260600046
16	NC_013285	CCCGG	2	10	28188	28197	0 %	0 %	40 %	60 %	260600049
17	NC_013285	TGGAA	2	10	28693	28702	40 %	20 %	40 %	0 %	260600050
18	NC_013285	AGCGG	2	10	29195	29204	20 %	0 %	60 %	20 %	260600051
19	NC_013285	AGACC	2	10	31460	31469	40 %	0 %	20 %	40 %	260600056
20	NC_013285	CATCG	2	10	31767	31776	20 %	20 %	20 %	40 %	260600056
21	NC_013285	TTCCC	2	10	32853	32862	0 %	40 %	0 %	60 %	260600058
22	NC_013285	AGTTA	2	10	32984	32993	40 %	40 %	20 %	0 %	260600058
23	NC_013285	GGTCA	2	10	36652	36661	20 %	20 %	40 %	20 %	260600062
24	NC_013285	ACGCA	2	10	38391	38400	40 %	0 %	20 %	40 %	260600066
25	NC_013285	GACAG	2	10	40419	40428	40 %	0 %	40 %	20 %	260600066
26	NC_013285	TTATC	2	10	40520	40529	20 %	60 %	0 %	20 %	260600066
27	NC_013285	ATTCG	2	10	40934	40943	20 %	40 %	20 %	20 %	260600067
28	NC_013285	CGTCG	2	10	42517	42526	0 %	20 %	40 %	40 %	260600068
29	NC_013285	CTGTC	2	10	42648	42657	0 %	40 %	20 %	40 %	260600068
30	NC_013285	AGCTC	2	10	48948	48957	20 %	20 %	20 %	40 %	260600075
31	NC_013285	TATCC	2	10	50075	50084	20 %	40 %	0 %	40 %	260600075
32	NC_013285	GATAT	2	10	51866	51875	40 %	40 %	20 %	0 %	260600078
33	NC_013285	TTTGG	2	10	52091	52100	0 %	60 %	40 %	0 %	260600078
34	NC_013285	CAGGC	2	10	53610	53619	20 %	0 %	40 %	40 %	260600080

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.