MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU3

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013285	TAAT	2	8	87	94	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013285	TGAT	2	8	474	481	25 %	50 %	25 %	0 %	260600008
3	NC_013285	TGGC	2	8	694	701	0 %	25 %	50 %	25 %	260600008
4	NC_013285	GAAC	2	8	1006	1013	50 %	0 %	25 %	25 %	260600008
5	NC_013285	GCAG	2	8	1259	1266	25 %	0 %	50 %	25 %	260600008
6	NC_013285	CCGG	2	8	1656	1663	0 %	0 %	50 %	50 %	260600009
7	NC_013285	CAGC	2	8	1709	1716	25 %	0 %	25 %	50 %	260600009
8	NC_013285	ACCG	2	8	1806	1813	25 %	0 %	25 %	50 %	260600009
9	NC_013285	GGCA	2	8	2677	2684	25 %	0 %	50 %	25 %	260600012
10	NC_013285	CTTT	2	8	3299	3306	0 %	75 %	0 %	25 %	260600012
11	NC_013285	TATT	2	8	3492	3499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013285	AAGA	2	8	3776	3783	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013285	TCAT	2	8	3846	3853	25 %	50 %	0 %	25 %	260600013
14	NC_013285	AATT	2	8	4110	4117	50 %	50 %	0 %	0 %	260600014
15	NC_013285	AACC	2	8	5186	5193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013285	CAGC	2	8	5235	5242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013285	AGAA	2	8	5565	5572	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013285	GCAG	2	8	5978	5985	25 %	0 %	50 %	25 %	260600016
19	NC_013285	GTAA	2	8	6345	6352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013285	TTTC	2	8	6359	6366	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013285	TTTC	2	8	6718	6725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013285	ATAA	2	8	6764	6771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013285	CAAA	2	8	7035	7042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013285	GTAG	2	8	7324	7331	25 %	25 %	50 %	0 %	260600017
25	NC_013285	AGAA	2	8	7555	7562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013285	AATT	2	8	7741	7748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013285	GTTT	2	8	7760	7767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013285	ATAA	2	8	7768	7775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013285	ATTC	2	8	8201	8208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013285	GGTA	2	8	8792	8799	25 %	25 %	50 %	0 %	260600018
31	NC_013285	AGAA	2	8	8927	8934	75 %	0 %	25 %	0 %	260600018
32	NC_013285	CGTT	2	8	10188	10195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013285	GCAT	2	8	10381	10388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013285	CTTA	2	8	11565	11572	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013285	CCAC	2	8	11813	11820	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_013285	CGCC	2	8	11831	11838	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_013285	CGTC	2	8	11941	11948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013285	AGTC	2	8	12389	12396	25 %	25 %	25 %	25 %	260600024
39	NC_013285	AAAT	2	8	13033	13040	75 %	25 %	0 %	0 %	260600024
40	NC_013285	GCTG	2	8	13434	13441	0 %	25 %	50 %	25 %	260600026
41	NC_013285	ATGC	2	8	13495	13502	25 %	25 %	25 %	25 %	260600026
42	NC_013285	TTTC	2	8	13867	13874	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013285	TTGT	3	12	13882	13893	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013285	TAAT	2	8	14023	14030	50 %	50 %	0 %	0 %	260600028
45	NC_013285	ACCT	2	8	14145	14152	25 %	25 %	0 %	50 %	260600028
46	NC_013285	CTGG	2	8	14288	14295	0 %	25 %	50 %	25 %	260600028
47	NC_013285	CAGC	2	8	15525	15532	25 %	0 %	25 %	50 %	260600030
48	NC_013285	ATTT	2	8	16128	16135	25 %	75 %	0 %	0 %	260600031
49	NC_013285	TTGC	2	8	16579	16586	0 %	50 %	25 %	25 %	260600032
50	NC_013285	TCAC	2	8	17290	17297	25 %	25 %	0 %	50 %	260600033
51	NC_013285	GCCG	2	8	17856	17863	0 %	0 %	50 %	50 %	260600034
52	NC_013285	TTTG	2	8	18463	18470	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013285	TCAC	2	8	19086	19093	25 %	25 %	0 %	50 %	260600037
54	NC_013285	TCAT	2	8	19485	19492	25 %	50 %	0 %	25 %	260600038
55	NC_013285	GAGT	2	8	20027	20034	25 %	25 %	50 %	0 %	260600038
56	NC_013285	TTTC	2	8	20067	20074	0 %	75 %	0 %	25 %	260600038
57	NC_013285	CCGT	2	8	20927	20934	0 %	25 %	25 %	50 %	260600038
58	NC_013285	GAAC	2	8	21024	21031	50 %	0 %	25 %	25 %	260600038
59	NC_013285	GGGC	2	8	21055	21062	0 %	0 %	75 %	25 %	260600038
60	NC_013285	GTCT	2	8	21174	21181	0 %	50 %	25 %	25 %	260600039
61	NC_013285	TCTG	2	8	21458	21465	0 %	50 %	25 %	25 %	260600039
62	NC_013285	CGGC	2	8	21719	21726	0 %	0 %	50 %	50 %	260600040
63	NC_013285	CAGG	2	8	22473	22480	25 %	0 %	50 %	25 %	260600040
64	NC_013285	GCTT	2	8	22804	22811	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013285	TATT	2	8	22815	22822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013285	TTCC	2	8	23323	23330	0 %	50 %	0 %	50 %	260600042
67	NC_013285	TCCT	2	8	23685	23692	0 %	50 %	0 %	50 %	260600043
68	NC_013285	CCAG	2	8	24709	24716	25 %	0 %	25 %	50 %	260600044
69	NC_013285	TGGT	2	8	24723	24730	0 %	50 %	50 %	0 %	260600044
70	NC_013285	TCGC	2	8	24843	24850	0 %	25 %	25 %	50 %	260600044
71	NC_013285	ACCG	2	8	27064	27071	25 %	0 %	25 %	50 %	260600047
72	NC_013285	CCAG	2	8	27513	27520	25 %	0 %	25 %	50 %	260600048
73	NC_013285	TGAC	2	8	27888	27895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013285	CAGC	2	8	28004	28011	25 %	0 %	25 %	50 %	260600049
75	NC_013285	CAGG	2	8	28519	28526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013285	AGGA	2	8	28639	28646	50 %	0 %	50 %	0 %	260600050
77	NC_013285	GCAT	2	8	28790	28797	25 %	25 %	25 %	25 %	260600050
78	NC_013285	GCAG	2	8	28854	28861	25 %	0 %	50 %	25 %	260600050
79	NC_013285	CAGA	2	8	29541	29548	50 %	0 %	25 %	25 %	260600052
80	NC_013285	CATG	2	8	29610	29617	25 %	25 %	25 %	25 %	260600053
81	NC_013285	CATG	2	8	30306	30313	25 %	25 %	25 %	25 %	260600055
82	NC_013285	CAAT	2	8	30418	30425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013285	ATGA	2	8	30678	30685	50 %	25 %	25 %	0 %	260600056
84	NC_013285	CAAA	2	8	30764	30771	75 %	0 %	0 %	25 %	260600056
85	NC_013285	ATTC	2	8	31013	31020	25 %	50 %	0 %	25 %	260600056
86	NC_013285	ACTG	2	8	31212	31219	25 %	25 %	25 %	25 %	260600056
87	NC_013285	CAGC	2	8	31434	31441	25 %	0 %	25 %	50 %	260600056
88	NC_013285	ATCA	2	8	32105	32112	50 %	25 %	0 %	25 %	260600057
89	NC_013285	AGCA	2	8	32753	32760	50 %	0 %	25 %	25 %	260600058
90	NC_013285	AACA	2	8	32927	32934	75 %	0 %	0 %	25 %	260600058
91	NC_013285	GCAA	2	8	32946	32953	50 %	0 %	25 %	25 %	260600058
92	NC_013285	GCAG	2	8	33295	33302	25 %	0 %	50 %	25 %	260600058
93	NC_013285	ATGG	2	8	33419	33426	25 %	25 %	50 %	0 %	260600058
94	NC_013285	TTTA	2	8	34032	34039	25 %	75 %	0 %	0 %	260600059
95	NC_013285	TTTA	2	8	34050	34057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013285	GTCA	2	8	34254	34261	25 %	25 %	25 %	25 %	260600060
97	NC_013285	CCTG	2	8	34490	34497	0 %	25 %	25 %	50 %	260600060
98	NC_013285	TAAT	2	8	34705	34712	50 %	50 %	0 %	0 %	260600060
99	NC_013285	AAAC	2	8	34932	34939	75 %	0 %	0 %	25 %	260600060
100	NC_013285	CGTC	2	8	35346	35353	0 %	25 %	25 %	50 %	260600061
101	NC_013285	GGTT	2	8	36187	36194	0 %	50 %	50 %	0 %	260600062
102	NC_013285	CCAT	2	8	36467	36474	25 %	25 %	0 %	50 %	260600062
103	NC_013285	ATTG	2	8	36595	36602	25 %	50 %	25 %	0 %	260600062
104	NC_013285	GTCA	2	8	37150	37157	25 %	25 %	25 %	25 %	260600063
105	NC_013285	ATGA	2	8	37228	37235	50 %	25 %	25 %	0 %	260600063
106	NC_013285	TCAT	2	8	37257	37264	25 %	50 %	0 %	25 %	260600063
107	NC_013285	ACGA	2	8	38073	38080	50 %	0 %	25 %	25 %	260600064
108	NC_013285	CAGA	2	8	39502	39509	50 %	0 %	25 %	25 %	260600066
109	NC_013285	CAGG	2	8	39845	39852	25 %	0 %	50 %	25 %	260600066
110	NC_013285	CCAT	2	8	40039	40046	25 %	25 %	0 %	50 %	260600066
111	NC_013285	GCCA	2	8	40190	40197	25 %	0 %	25 %	50 %	260600066
112	NC_013285	CCAG	2	8	40331	40338	25 %	0 %	25 %	50 %	260600066
113	NC_013285	CAGG	2	8	40682	40689	25 %	0 %	50 %	25 %	260600066
114	NC_013285	TTTC	2	8	41180	41187	0 %	75 %	0 %	25 %	260600067
115	NC_013285	TCAT	2	8	41206	41213	25 %	50 %	0 %	25 %	260600067
116	NC_013285	GCAG	2	8	41323	41330	25 %	0 %	50 %	25 %	260600067
117	NC_013285	GCTG	2	8	42139	42146	0 %	25 %	50 %	25 %	260600068
118	NC_013285	TGGT	2	8	42171	42178	0 %	50 %	50 %	0 %	260600068
119	NC_013285	CACC	2	8	42333	42340	25 %	0 %	0 %	75 %	260600068
120	NC_013285	GCCC	2	8	42441	42448	0 %	0 %	25 %	75 %	260600068
121	NC_013285	GACA	2	8	42466	42473	50 %	0 %	25 %	25 %	260600068
122	NC_013285	TCCC	2	8	43419	43426	0 %	25 %	0 %	75 %	260600068
123	NC_013285	ACGT	2	8	43522	43529	25 %	25 %	25 %	25 %	260600068
124	NC_013285	GCAG	2	8	44237	44244	25 %	0 %	50 %	25 %	260600068
125	NC_013285	CACG	2	8	44355	44362	25 %	0 %	25 %	50 %	260600068
126	NC_013285	TTCA	2	8	44765	44772	25 %	50 %	0 %	25 %	260600069
127	NC_013285	ATTC	2	8	45200	45207	25 %	50 %	0 %	25 %	260600069
128	NC_013285	TCAT	2	8	45952	45959	25 %	50 %	0 %	25 %	260600070
129	NC_013285	AATG	2	8	45975	45982	50 %	25 %	25 %	0 %	260600070
130	NC_013285	ATTA	2	8	46387	46394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013285	CTGA	2	8	46668	46675	25 %	25 %	25 %	25 %	260600072
132	NC_013285	CAGC	2	8	46719	46726	25 %	0 %	25 %	50 %	260600072
133	NC_013285	AGAT	2	8	46966	46973	50 %	25 %	25 %	0 %	260600072
134	NC_013285	GCTG	2	8	47256	47263	0 %	25 %	50 %	25 %	260600072
135	NC_013285	AGTC	2	8	48399	48406	25 %	25 %	25 %	25 %	260600073
136	NC_013285	CGAT	2	8	48545	48552	25 %	25 %	25 %	25 %	260600073
137	NC_013285	CCTG	2	8	49750	49757	0 %	25 %	25 %	50 %	260600075
138	NC_013285	ACGT	2	8	50056	50063	25 %	25 %	25 %	25 %	260600075
139	NC_013285	ATGA	2	8	50694	50701	50 %	25 %	25 %	0 %	260600076
140	NC_013285	TTAA	2	8	51367	51374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013285	TGCT	2	8	51459	51466	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013285	TTAA	2	8	51493	51500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013285	ACTT	2	8	51711	51718	25 %	50 %	0 %	25 %	260600078
144	NC_013285	TTTA	2	8	51769	51776	25 %	75 %	0 %	0 %	260600078
145	NC_013285	TTTC	2	8	51801	51808	0 %	75 %	0 %	25 %	260600078
146	NC_013285	ATCA	2	8	52588	52595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013285	CATT	2	8	52617	52624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013285	CTTT	2	8	52712	52719	0 %	75 %	0 %	25 %	260600079
149	NC_013285	TTGG	2	8	53408	53415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013285	GACG	2	8	53432	53439	25 %	0 %	50 %	25 %	260600080
151	NC_013285	TAAT	2	8	53820	53827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.