MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU3

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013285	GAA	2	6	53	58	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013285	TGG	2	6	132	137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013285	AAC	2	6	166	171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013285	GCC	2	6	392	397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013285	GGC	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013285	GGC	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013285	TCA	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013285	AGC	2	6	3370	3375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013285	CCG	2	6	3479	3484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_013285	TAC	2	6	3603	3608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013285	AGC	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013285	AAC	2	6	4052	4057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013285	CTA	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013285	GAC	3	9	4977	4985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013285	ATT	2	6	5042	5047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013285	GGT	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013285	CAA	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013285	GTG	2	6	5540	5545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013285	TTG	2	6	5553	5558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013285	ATT	2	6	6055	6060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013285	TCA	2	6	6107	6112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013285	ACA	2	6	6143	6148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013285	GGC	2	6	6201	6206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013285	TTC	2	6	6224	6229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013285	GCA	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013285	ACT	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013285	AAT	2	6	6329	6334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013285	TAA	3	9	6350	6358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013285	TAG	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013285	TGT	2	6	6455	6460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013285	TTG	2	6	6561	6566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013285	TAT	2	6	6568	6573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013285	ATT	2	6	6631	6636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013285	TGT	2	6	6664	6669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013285	ATG	2	6	6740	6745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013285	TCA	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013285	AAC	2	6	7114	7119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013285	CAT	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013285	TAC	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013285	GAA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013285	GGT	2	6	7792	7797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013285	AAG	2	6	7911	7916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013285	GCA	2	6	8094	8099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013285	ATT	2	6	8217	8222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013285	TGA	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013285	TGC	2	6	8287	8292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013285	AAT	2	6	8329	8334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013285	ACT	2	6	8340	8345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013285	TTA	2	6	8378	8383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013285	GTT	2	6	8487	8492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013285	ATC	2	6	8505	8510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013285	TAT	2	6	8551	8556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013285	GAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013285	CAA	2	6	8744	8749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013285	ATG	2	6	9749	9754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013285	ATC	2	6	9769	9774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013285	CAG	2	6	9961	9966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013285	GCC	2	6	10407	10412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013285	TGC	2	6	11364	11369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013285	GTT	2	6	11429	11434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013285	CGG	2	6	11443	11448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013285	ATG	2	6	11474	11479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013285	CGT	2	6	11528	11533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013285	TGT	2	6	11877	11882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013285	CGC	2	6	11888	11893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013285	ATC	2	6	12151	12156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013285	TTA	2	6	14899	14904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013285	TTA	2	6	14907	14912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013285	TTA	2	6	14915	14920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013285	AAT	2	6	16250	16255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013285	CGC	2	6	16373	16378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013285	TAA	2	6	16392	16397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013285	GTC	2	6	18486	18491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013285	CGT	2	6	18494	18499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013285	CGG	2	6	18834	18839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013285	TCC	2	6	19450	19455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013285	AGG	2	6	25669	25674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013285	CGT	2	6	27976	27981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013285	CGC	2	6	28504	28509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013285	TCA	2	6	29091	29096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013285	CTG	2	6	29391	29396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013285	CAG	2	6	29408	29413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013285	ATC	2	6	30465	30470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013285	ATT	2	6	36978	36983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013285	AAT	2	6	37418	37423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013285	GCA	2	6	37519	37524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013285	ATC	2	6	37599	37604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013285	GAC	2	6	37674	37679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013285	GAT	2	6	40746	40751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013285	GTT	2	6	40772	40777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013285	GCC	2	6	40877	40882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013285	CTG	2	6	40896	40901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013285	TAT	2	6	41386	41391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013285	GTC	2	6	44606	44611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013285	TGA	2	6	45808	45813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013285	CCT	2	6	45848	45853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_013285	GCA	2	6	50168	50173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013285	ATT	2	6	50218	50223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013285	CGG	2	6	50279	50284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013285	TAC	2	6	50311	50316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013285	AAT	2	6	50378	50383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013285	TGT	2	6	50865	50870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013285	TAT	2	6	50944	50949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013285	ATA	2	6	51312	51317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013285	TAT	2	6	51467	51472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013285	ACT	2	6	51596	51601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013285	CTT	2	6	51607	51612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013285	CAT	2	6	51653	51658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013285	CTG	2	6	51659	51664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013285	CTT	2	6	52435	52440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013285	TAA	2	6	52534	52539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013285	TTC	2	6	52549	52554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013285	TGA	2	6	52946	52951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013285	TTG	2	6	52988	52993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013285	TAA	3	9	53003	53011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013285	CAA	2	6	53013	53018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013285	TTA	2	6	53061	53066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013285	GCT	2	6	53193	53198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013285	TGT	2	6	53211	53216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013285	CCG	2	6	53258	53263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013285	GTT	2	6	53301	53306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013285	CAT	2	6	53400	53405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.