MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU1

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013283	CGCTGG	2	12	9333	9344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260424389
2	NC_013283	CGGAGC	2	12	22558	22569	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260424408
3	NC_013283	ATTAAT	2	12	24008	24019	50 %	50 %	0 %	0 %	260424408
4	NC_013283	ACACCG	2	12	29411	29422	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260424417
5	NC_013283	CCGGCG	2	12	29698	29709	0 %	0 %	50 %	50 %	260424417
6	NC_013283	TTACCT	2	12	32242	32253	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	260424419
7	NC_013283	CGATGG	2	12	33631	33642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260424420
8	NC_013283	GGCGCT	2	12	33923	33934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260424420
9	NC_013283	AGGGCG	2	12	38554	38565	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	260424425
10	NC_013283	AACCAG	2	12	39777	39788	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260424425
11	NC_013283	CTGCGC	2	12	44311	44322	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260424430
12	NC_013283	GATCGC	2	12	45370	45381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260424434
13	NC_013283	TGCCGA	2	12	47025	47036	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260424436
14	NC_013283	TGGTTT	2	12	49151	49162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260424438
15	NC_013283	TCAGCT	2	12	50626	50637	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260424439
16	NC_013283	TTCTTT	2	12	51495	51506	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	260424440
17	NC_013283	CAGCCA	2	12	52238	52249	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260424440
18	NC_013283	TGGCGC	2	12	55483	55494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260424444
19	NC_013283	GCACCA	2	12	56511	56522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260424445
20	NC_013283	GGCACA	2	12	58134	58145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260424446
21	NC_013283	CCCCAT	2	12	64078	64089	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	260424449
22	NC_013283	AAAACT	2	12	67521	67532	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	260424454
23	NC_013283	GCGACG	2	12	67654	67665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260424454
24	NC_013283	TACTTT	2	12	72203	72214	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	260424457
25	NC_013283	GCCATC	2	12	72504	72515	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	260424457
26	NC_013283	CGCCAG	2	12	77766	77777	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260424462
27	NC_013283	CAGCGC	2	12	79448	79459	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260424465
28	NC_013283	ATTGTC	2	12	79947	79958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	260424465
29	NC_013283	TGACGC	2	12	85591	85602	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260424471
30	NC_013283	CGCTGG	2	12	87841	87852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260424471
31	NC_013283	TGCCGG	2	12	89163	89174	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260424472
32	NC_013283	CGATGA	2	12	90392	90403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260424473
33	NC_013283	CAGCCC	2	12	92466	92477	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	260424473
34	NC_013283	CGTGCG	2	12	93928	93939	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260424474
35	NC_013283	ATCAGT	2	12	98965	98976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	260424479
36	NC_013283	CAGACC	2	12	99855	99866	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260424479
37	NC_013283	CGCAGG	2	12	100730	100741	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260424480
38	NC_013283	GTGGCA	2	12	102125	102136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260424481
39	NC_013283	TCCGCC	2	12	104597	104608	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260424483
40	NC_013283	CAGCGA	2	12	106324	106335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260424483
41	NC_013283	GATCGA	2	12	109046	109057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260424486
42	NC_013283	TGGACA	2	12	110622	110633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260424488
43	NC_013283	GCACCG	2	12	112676	112687	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260424490
44	NC_013283	TACAGC	2	12	112843	112854	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260424490
45	NC_013283	CGCCAG	2	12	114706	114717	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260424491
46	NC_013283	CGCTGG	2	12	116193	116204	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260424491
47	NC_013283	ACGCTG	2	12	117566	117577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260424491
48	NC_013283	ACCAGA	2	12	118152	118163	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260424491
49	NC_013283	CGCTGA	2	12	118659	118670	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260424491
50	NC_013283	CTGAGC	2	12	121544	121555	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260424491
51	NC_013283	AACACC	2	12	121892	121903	50 %	0 %	0 %	50 %	260424491
52	NC_013283	AAACCA	2	12	122478	122489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260424491
53	NC_013283	CAGAGC	2	12	122810	122821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260424491
54	NC_013283	AAAATC	2	12	123217	123228	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	260424491
55	NC_013283	GCTGAA	2	12	131145	131156	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260424501
56	NC_013283	GATGCT	2	12	135643	135654	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260424508

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.