MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cronobacter turicensis z3032 plasmid pCTU1

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013283	TCTGG	2	10	1608	1617	0 %	40 %	40 %	20 %	260424378
2	NC_013283	CTGGT	2	10	2803	2812	0 %	40 %	40 %	20 %	260424379
3	NC_013283	AACAG	2	10	4051	4060	60 %	0 %	20 %	20 %	260424382
4	NC_013283	TCGCT	2	10	5363	5372	0 %	40 %	20 %	40 %	260424383
5	NC_013283	TTTAC	2	10	6407	6416	20 %	60 %	0 %	20 %	260424384
6	NC_013283	CGGGC	2	10	8777	8786	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013283	TGCGC	2	10	10477	10486	0 %	20 %	40 %	40 %	260424391
8	NC_013283	AAAAT	2	10	10844	10853	80 %	20 %	0 %	0 %	260424392
9	NC_013283	GTGGG	2	10	12327	12336	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013283	GCGGG	2	10	16144	16153	0 %	0 %	80 %	20 %	260424397
11	NC_013283	GGCAG	2	10	16825	16834	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013283	CTTCC	2	10	20588	20597	0 %	40 %	0 %	60 %	260424406
13	NC_013283	GCGTT	2	10	20905	20914	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013283	GCGTT	2	10	22896	22905	0 %	40 %	40 %	20 %	260424408
15	NC_013283	ACGCC	2	10	25488	25497	20 %	0 %	20 %	60 %	260424411
16	NC_013283	GGCGC	2	10	27675	27684	0 %	0 %	60 %	40 %	260424415
17	NC_013283	GCGTC	2	10	27688	27697	0 %	20 %	40 %	40 %	260424415
18	NC_013283	CTGAA	2	10	28533	28542	40 %	20 %	20 %	20 %	260424416
19	NC_013283	AACAA	2	10	30120	30129	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013283	TGGCG	2	10	31280	31289	0 %	20 %	60 %	20 %	260424418
21	NC_013283	GAATG	2	10	31780	31789	40 %	20 %	40 %	0 %	260424419
22	NC_013283	CAGGC	2	10	32866	32875	20 %	0 %	40 %	40 %	260424420
23	NC_013283	GCGCA	2	10	34921	34930	20 %	0 %	40 %	40 %	260424421
24	NC_013283	GTTCT	2	10	36794	36803	0 %	60 %	20 %	20 %	260424423
25	NC_013283	CAACT	2	10	36971	36980	40 %	20 %	0 %	40 %	260424423
26	NC_013283	GCCCG	2	10	37069	37078	0 %	0 %	40 %	60 %	260424423
27	NC_013283	GCGCT	2	10	37637	37646	0 %	20 %	40 %	40 %	260424423
28	NC_013283	CGGTA	2	10	37849	37858	20 %	20 %	40 %	20 %	260424423
29	NC_013283	CGAGG	2	10	39264	39273	20 %	0 %	60 %	20 %	260424425
30	NC_013283	GCGCC	2	10	39722	39731	0 %	0 %	40 %	60 %	260424425
31	NC_013283	GAACA	2	10	40603	40612	60 %	0 %	20 %	20 %	260424427
32	NC_013283	GCGCC	2	10	41603	41612	0 %	0 %	40 %	60 %	260424428
33	NC_013283	GGACG	2	10	42106	42115	20 %	0 %	60 %	20 %	260424428
34	NC_013283	CGGGG	2	10	42398	42407	0 %	0 %	80 %	20 %	260424429
35	NC_013283	ACGGC	2	10	43223	43232	20 %	0 %	40 %	40 %	260424429
36	NC_013283	GGCCT	2	10	50147	50156	0 %	20 %	40 %	40 %	260424439
37	NC_013283	AAGAA	2	10	50881	50890	80 %	0 %	20 %	0 %	260424439
38	NC_013283	CGCCA	2	10	52605	52614	20 %	0 %	20 %	60 %	260424440
39	NC_013283	GCGCT	2	10	53769	53778	0 %	20 %	40 %	40 %	260424441
40	NC_013283	CGCTG	2	10	54292	54301	0 %	20 %	40 %	40 %	260424441
41	NC_013283	ACGCG	2	10	56176	56185	20 %	0 %	40 %	40 %	260424444
42	NC_013283	GCTAC	2	10	56533	56542	20 %	20 %	20 %	40 %	260424445
43	NC_013283	GGTAT	2	10	57634	57643	20 %	40 %	40 %	0 %	260424446
44	NC_013283	CAGCG	2	10	59623	59632	20 %	0 %	40 %	40 %	260424447
45	NC_013283	CGCCA	2	10	60289	60298	20 %	0 %	20 %	60 %	260424447
46	NC_013283	GCGCG	2	10	61678	61687	0 %	0 %	60 %	40 %	260424447
47	NC_013283	GGCGC	2	10	64800	64809	0 %	0 %	60 %	40 %	260424450
48	NC_013283	CACCG	2	10	65214	65223	20 %	0 %	20 %	60 %	260424450
49	NC_013283	CGCGC	2	10	69151	69160	0 %	0 %	40 %	60 %	260424455
50	NC_013283	ATTCC	2	10	74706	74715	20 %	40 %	0 %	40 %	260424459
51	NC_013283	ATCAC	2	10	76190	76199	40 %	20 %	0 %	40 %	260424460
52	NC_013283	CGGCG	2	10	76393	76402	0 %	0 %	60 %	40 %	260424460
53	NC_013283	ATTTT	2	10	78129	78138	20 %	80 %	0 %	0 %	260424462
54	NC_013283	ACTTC	2	10	79225	79234	20 %	40 %	0 %	40 %	260424465
55	NC_013283	GCGCG	2	10	80358	80367	0 %	0 %	60 %	40 %	260424467
56	NC_013283	CGCGG	2	10	81376	81385	0 %	0 %	60 %	40 %	260424467
57	NC_013283	CCTGC	2	10	82560	82569	0 %	20 %	20 %	60 %	260424467
58	NC_013283	AAAGA	2	10	83314	83323	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013283	TTATT	2	10	83334	83343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013283	GCACA	2	10	83589	83598	40 %	0 %	20 %	40 %	260424469
61	NC_013283	CGTGC	2	10	88546	88555	0 %	20 %	40 %	40 %	260424472
62	NC_013283	GCTTC	2	10	90887	90896	0 %	40 %	20 %	40 %	260424473
63	NC_013283	CCGGC	2	10	91898	91907	0 %	0 %	40 %	60 %	260424473
64	NC_013283	GCAGC	2	10	92147	92156	20 %	0 %	40 %	40 %	260424473
65	NC_013283	CCCTC	2	10	93004	93013	0 %	20 %	0 %	80 %	260424474
66	NC_013283	GCCCG	2	10	95295	95304	0 %	0 %	40 %	60 %	260424475
67	NC_013283	CCTGC	2	10	96000	96009	0 %	20 %	20 %	60 %	260424475
68	NC_013283	CGGCG	3	15	97443	97457	0 %	0 %	60 %	40 %	260424477
69	NC_013283	CGAAC	2	10	98457	98466	40 %	0 %	20 %	40 %	260424478
70	NC_013283	TGCGC	2	10	98933	98942	0 %	20 %	40 %	40 %	260424479
71	NC_013283	GCTGC	2	10	99168	99177	0 %	20 %	40 %	40 %	260424479
72	NC_013283	CGCTG	2	10	99316	99325	0 %	20 %	40 %	40 %	260424479
73	NC_013283	CGCGC	2	10	100998	101007	0 %	0 %	40 %	60 %	260424480
74	NC_013283	GGCCG	2	10	101028	101037	0 %	0 %	60 %	40 %	260424480
75	NC_013283	GGCGC	2	10	101228	101237	0 %	0 %	60 %	40 %	260424480
76	NC_013283	CTCGC	2	10	102348	102357	0 %	20 %	20 %	60 %	260424481
77	NC_013283	TTACC	2	10	103145	103154	20 %	40 %	0 %	40 %	260424481
78	NC_013283	GTTCT	2	10	106730	106739	0 %	60 %	20 %	20 %	260424483
79	NC_013283	GAAAG	2	10	107227	107236	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013283	GTGGA	2	10	108652	108661	20 %	20 %	60 %	0 %	260424486
81	NC_013283	CAGGA	2	10	110334	110343	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013283	CCCCG	2	10	111037	111046	0 %	0 %	20 %	80 %	260424488
83	NC_013283	AAAAC	2	10	112445	112454	80 %	0 %	0 %	20 %	260424490
84	NC_013283	CGCAT	2	10	113626	113635	20 %	20 %	20 %	40 %	260424490
85	NC_013283	GACGC	2	10	115412	115421	20 %	0 %	40 %	40 %	260424491
86	NC_013283	GCGCG	2	10	115747	115756	0 %	0 %	60 %	40 %	260424491
87	NC_013283	CGGCA	2	10	118477	118486	20 %	0 %	40 %	40 %	260424491
88	NC_013283	GGGCG	2	10	119107	119116	0 %	0 %	80 %	20 %	260424491
89	NC_013283	GCGCC	2	10	120993	121002	0 %	0 %	40 %	60 %	260424491
90	NC_013283	TGGCG	2	10	121258	121267	0 %	20 %	60 %	20 %	260424491
91	NC_013283	TCAGC	2	10	121578	121587	20 %	20 %	20 %	40 %	260424491
92	NC_013283	CAAAG	2	10	123072	123081	60 %	0 %	20 %	20 %	260424491
93	NC_013283	CGGCG	2	10	123409	123418	0 %	0 %	60 %	40 %	260424491
94	NC_013283	ATAAA	2	10	125019	125028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013283	AAATC	2	10	126369	126378	60 %	20 %	0 %	20 %	260424494
96	NC_013283	CAATG	2	10	127909	127918	40 %	20 %	20 %	20 %	260424497
97	NC_013283	CGCAG	2	10	128851	128860	20 %	0 %	40 %	40 %	260424498
98	NC_013283	CATAA	2	10	129254	129263	60 %	20 %	0 %	20 %	260424498
99	NC_013283	TTGCC	2	10	130933	130942	0 %	40 %	20 %	40 %	260424501
100	NC_013283	CTGAA	2	10	132368	132377	40 %	20 %	20 %	20 %	260424503
101	NC_013283	CTCTT	2	10	133451	133460	0 %	60 %	0 %	40 %	260424505
102	NC_013283	AAATG	2	10	134827	134836	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013283	GGTAA	2	10	135523	135532	40 %	20 %	40 %	0 %	260424507

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.