MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter turicensis z3032 chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013282	TTACTT	2	12	61491	61502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013282	TCCCTT	2	12	133053	133064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013282	GTGATC	2	12	135231	135242	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013282	GTTGCA	2	12	302988	302999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013282	AGCGAA	2	12	311999	312010	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013282	TAACGC	2	12	405665	405676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013282	TATAAA	2	12	412895	412906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013282	AAGCTA	2	12	459399	459410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013282	TTTCGC	2	12	484448	484459	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013282	GCGCCT	2	12	493408	493419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013282	AGATTC	2	12	498540	498551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013282	ATCATT	2	12	521981	521992	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013282	TTCGAT	2	12	525156	525167	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013282	TTTATA	2	12	567324	567335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013282	TGAAAT	3	18	580581	580598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013282	GAGGTT	2	12	623110	623121	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013282	AATGAT	2	12	627640	627651	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013282	AGTTTC	2	12	687353	687364	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013282	CGCTTT	2	12	802960	802971	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013282	ACTGGA	2	12	827372	827383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013282	GCACCG	2	12	830955	830966	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013282	GTAAGC	2	12	849351	849362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013282	GCCGGA	2	12	865112	865123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013282	AACCAC	2	12	883041	883052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013282	GTTTTT	2	12	924164	924175	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013282	AATCAT	2	12	932894	932905	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013282	AAAATA	2	12	935434	935445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013282	GTTTCA	2	12	953910	953921	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013282	ATTTTC	2	12	967598	967609	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013282	AAAATT	2	12	975239	975250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013282	ACAGCA	2	12	1026688	1026699	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013282	CGTAAC	2	12	1029715	1029726	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013282	AACAGA	2	12	1034246	1034257	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013282	GCCTGA	2	12	1055625	1055636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013282	AGCGGA	2	12	1073081	1073092	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013282	GCCGTT	2	12	1122072	1122083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013282	TTAGGG	2	12	1140163	1140174	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013282	CTTTTT	2	12	1145835	1145846	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013282	ACCCAA	2	12	1221382	1221393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013282	GATATC	2	12	1274728	1274739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013282	CGCTGC	2	12	1292497	1292508	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013282	TGCAAA	2	12	1297835	1297846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013282	GTAAGC	2	12	1303421	1303432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013282	CATAAG	2	12	1314487	1314498	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013282	CAGCGG	2	12	1322797	1322808	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013282	ATATTT	2	12	1372906	1372917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013282	CTTTGT	2	12	1428903	1428914	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013282	CGCCAG	2	12	1448048	1448059	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013282	CAGGCG	2	12	1498009	1498020	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013282	CAGCGC	2	12	1498123	1498134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013282	GCCGCT	2	12	1498704	1498715	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013282	AAATTG	2	12	1556499	1556510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013282	GTGGGG	2	12	1561403	1561414	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013282	GGAACT	2	12	1578477	1578488	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013282	AGATAA	2	12	1595582	1595593	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013282	CGGCAG	2	12	1620840	1620851	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013282	GCGAGA	2	12	1731114	1731125	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013282	CAGCAC	2	12	1802578	1802589	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013282	CGGCAG	2	12	1805570	1805581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013282	TCCAAC	2	12	1848798	1848809	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013282	CTTTTT	2	12	1866586	1866597	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013282	ATGAAA	2	12	1920064	1920075	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013282	TCTGGC	2	12	1929310	1929321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013282	CTGATA	2	12	1964236	1964247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013282	GCGTTC	2	12	1965710	1965721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013282	GGGAAA	2	12	1995261	1995272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013282	ATGCTT	2	12	2007394	2007405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013282	CGTCAA	2	12	2019468	2019479	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013282	GCGACA	2	12	2047932	2047943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013282	ACTGGC	2	12	2078109	2078120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013282	CAGAAA	2	12	2153693	2153704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013282	GACATT	2	12	2163607	2163618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013282	TTACCA	2	12	2178503	2178514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013282	ATATTC	2	12	2239239	2239250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013282	CGGTGC	2	12	2258068	2258079	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013282	CGCTGG	2	12	2399595	2399606	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013282	AAATTA	2	12	2447908	2447919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013282	CGCTGG	2	12	2477044	2477055	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013282	TAACGT	2	12	2495421	2495432	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013282	GATAAA	2	12	2538617	2538628	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013282	TAATGA	2	12	2539129	2539140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013282	GCAGGC	2	12	2720911	2720922	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013282	AAATCA	2	12	2738640	2738651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013282	GCTTAC	2	12	2757917	2757928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013282	GTTGAG	2	12	2780483	2780494	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013282	CTGCGC	2	12	2804256	2804267	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013282	CTTTTA	2	12	2808436	2808447	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013282	TTTTAT	2	12	2843908	2843919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013282	GTACTC	2	12	2868089	2868100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013282	GCGGGT	2	12	2895344	2895355	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013282	GGGAAA	2	12	2920629	2920640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013282	TCTTGC	2	12	2935150	2935161	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013282	AATTTT	2	12	2948034	2948045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013282	TTATTT	2	12	2994095	2994106	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013282	GCGCTG	2	12	2999945	2999956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013282	GCAACG	2	12	3005421	3005432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013282	ATGAAA	2	12	3020257	3020268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013282	AGAAAA	2	12	3073772	3073783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013282	GCCCGC	2	12	3094096	3094107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013282	AATAAA	2	12	3100775	3100786	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013282	ATTGTG	2	12	3114047	3114058	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013282	TCGGAG	2	12	3131139	3131150	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013282	AAAAAC	2	12	3136780	3136791	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013282	TCCGGT	2	12	3140371	3140382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013282	GCAAGT	2	12	3144171	3144182	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013282	CTGCGC	2	12	3246012	3246023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013282	GAACTT	2	12	3310094	3310105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013282	GGGTAC	2	12	3337606	3337617	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013282	TTCTCT	2	12	3348118	3348129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013282	TCAATA	2	12	3355874	3355885	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013282	CTTTGG	2	12	3373907	3373918	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013282	TGTTCA	2	12	3413664	3413675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013282	GCGCCC	2	12	3425882	3425893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013282	CGCTGG	2	12	3426192	3426203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013282	ATAAGC	2	12	3480540	3480551	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013282	AGACTG	2	12	3480693	3480704	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013282	ATTAAA	2	12	3536549	3536560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013282	TCAAAA	2	12	3561537	3561548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_013282	CGTTAT	2	12	3590476	3590487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_013282	CTGCGC	2	12	3691311	3691322	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013282	GCATTC	2	12	3697159	3697170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013282	GCTACA	2	12	3724540	3724551	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013282	CCTTAA	2	12	3731163	3731174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013282	TCACTT	2	12	3817632	3817643	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013282	TGGGGT	2	12	3864278	3864289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013282	GCATCG	2	12	3866757	3866768	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013282	AGAGGA	2	12	3898773	3898784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013282	TGGTTA	2	12	3943224	3943235	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013282	CAAAAA	2	12	3967257	3967268	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_013282	GGTTTT	2	12	4057885	4057896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013282	TTTTAA	2	12	4065509	4065520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013282	ACCCCA	2	12	4138483	4138494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013282	CGCCTC	2	12	4186065	4186076	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_013282	GGTTTT	2	12	4224638	4224649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013282	GCGCTG	2	12	4318182	4318193	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.