MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 plasmid pEP05

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013265	TGG	2	6	108	113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013265	CCT	2	6	169	174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013265	GCG	2	6	209	214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013265	GGC	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013265	ATC	2	6	384	389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013265	GCA	2	6	630	635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013265	AAG	2	6	658	663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013265	GTG	2	6	684	689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013265	GAA	2	6	710	715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013265	AGA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
11	NC_013265	AAG	2	6	858	863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
12	NC_013265	CAT	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647812
13	NC_013265	TTA	2	6	1031	1036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259647812
14	NC_013265	ACA	2	6	1077	1082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259647812
15	NC_013265	ACG	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647812
16	NC_013265	GCG	2	6	1447	1452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647812
17	NC_013265	GAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
18	NC_013265	AGC	2	6	1493	1498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647812
19	NC_013265	GCG	2	6	1534	1539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647812
20	NC_013265	GCT	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647813
21	NC_013265	ATG	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647813
22	NC_013265	GGT	2	6	1839	1844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259647813
23	NC_013265	ACT	2	6	1928	1933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647813
24	NC_013265	ATC	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647813
25	NC_013265	AGA	2	6	2015	2020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647813
26	NC_013265	GAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647813
27	NC_013265	ATA	2	6	2193	2198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013265	CAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259647814
29	NC_013265	ATA	2	6	2393	2398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259647814
30	NC_013265	TAT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259647814
31	NC_013265	CTT	4	12	2452	2463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
32	NC_013265	CTT	2	6	2506	2511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
33	NC_013265	AGA	2	6	2528	2533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647814
34	NC_013265	CTT	2	6	2585	2590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
35	NC_013265	CCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647814
36	NC_013265	CTC	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013265	GCA	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013265	GCA	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013265	CAT	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647815
40	NC_013265	CTG	3	9	3081	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
41	NC_013265	CTG	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
42	NC_013265	GCT	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
43	NC_013265	AGT	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647815
44	NC_013265	CTG	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
45	NC_013265	GCT	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
46	NC_013265	TGC	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
47	NC_013265	TTC	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647815
48	NC_013265	GCA	2	6	3427	3432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
49	NC_013265	CTG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
50	NC_013265	CCA	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647815
51	NC_013265	GAT	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647815
52	NC_013265	GGC	2	6	3695	3700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647815
53	NC_013265	CTG	3	9	3788	3796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
54	NC_013265	GTG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259647815
55	NC_013265	CAC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647815
56	NC_013265	CTG	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
57	NC_013265	CCG	2	6	4071	4076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
58	NC_013265	CAG	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
59	NC_013265	GCC	2	6	4229	4234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
60	NC_013265	TCC	2	6	4420	4425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	259647815
61	NC_013265	GCA	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
62	NC_013265	CAG	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
63	NC_013265	GCC	3	9	4497	4505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
64	NC_013265	ATC	2	6	4531	4536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647815
65	NC_013265	GTT	2	6	4672	4677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259647816
66	NC_013265	AGC	2	6	4700	4705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647816
67	NC_013265	CAG	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647816
68	NC_013265	TGC	2	6	4851	4856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013265	CCT	2	6	4875	4880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.