MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 plasmid pEP05

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013265	AGA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
2	NC_013265	AAG	2	6	858	863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
3	NC_013265	CAT	2	6	997	1002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647812
4	NC_013265	TTA	2	6	1031	1036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259647812
5	NC_013265	ACA	2	6	1077	1082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259647812
6	NC_013265	ACG	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647812
7	NC_013265	GCG	2	6	1447	1452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647812
8	NC_013265	GAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647812
9	NC_013265	AGC	2	6	1493	1498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647812
10	NC_013265	GCG	2	6	1534	1539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647812
11	NC_013265	GCT	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647813
12	NC_013265	ATG	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647813
13	NC_013265	GGT	2	6	1839	1844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259647813
14	NC_013265	ACT	2	6	1928	1933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647813
15	NC_013265	ATC	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647813
16	NC_013265	AGA	2	6	2015	2020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647813
17	NC_013265	GAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647813
18	NC_013265	CAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259647814
19	NC_013265	ATA	2	6	2393	2398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259647814
20	NC_013265	TAT	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259647814
21	NC_013265	CTT	4	12	2452	2463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
22	NC_013265	CTT	2	6	2506	2511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
23	NC_013265	AGA	2	6	2528	2533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259647814
24	NC_013265	CTT	2	6	2585	2590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647814
25	NC_013265	CCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647814
26	NC_013265	CAT	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647815
27	NC_013265	CTG	3	9	3081	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
28	NC_013265	CTG	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
29	NC_013265	GCT	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
30	NC_013265	AGT	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647815
31	NC_013265	CTG	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
32	NC_013265	GCT	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
33	NC_013265	TGC	2	6	3343	3348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
34	NC_013265	TTC	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259647815
35	NC_013265	GCA	2	6	3427	3432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
36	NC_013265	CTG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
37	NC_013265	CCA	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647815
38	NC_013265	GAT	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259647815
39	NC_013265	GGC	2	6	3695	3700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259647815
40	NC_013265	CTG	3	9	3788	3796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
41	NC_013265	GTG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259647815
42	NC_013265	CAC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259647815
43	NC_013265	CTG	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259647815
44	NC_013265	CCG	2	6	4071	4076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
45	NC_013265	CAG	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
46	NC_013265	GCC	2	6	4229	4234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
47	NC_013265	TCC	2	6	4420	4425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	259647815
48	NC_013265	GCA	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
49	NC_013265	CAG	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647815
50	NC_013265	GCC	3	9	4497	4505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259647815
51	NC_013265	ATC	2	6	4531	4536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259647815
52	NC_013265	GTT	2	6	4672	4677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259647816
53	NC_013265	AGC	2	6	4700	4705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647816
54	NC_013265	CAG	2	6	4804	4809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259647816

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.