MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 plasmid pEP36

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013263	GCTG	2	8	75	82	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013263	CGTC	2	8	942	949	0 %	25 %	25 %	50 %	259910330
3	NC_013263	GTTC	2	8	954	961	0 %	50 %	25 %	25 %	259910330
4	NC_013263	CCCG	2	8	1750	1757	0 %	0 %	25 %	75 %	259910331
5	NC_013263	TTCC	2	8	2676	2683	0 %	50 %	0 %	50 %	259910331
6	NC_013263	CTGG	2	8	2924	2931	0 %	25 %	50 %	25 %	259910331
7	NC_013263	TCCC	2	8	3146	3153	0 %	25 %	0 %	75 %	259910331
8	NC_013263	GCCA	2	8	3522	3529	25 %	0 %	25 %	50 %	259910331
9	NC_013263	CCCG	2	8	4042	4049	0 %	0 %	25 %	75 %	259910331
10	NC_013263	AATT	2	8	4482	4489	50 %	50 %	0 %	0 %	259910331
11	NC_013263	AGAT	2	8	4535	4542	50 %	25 %	25 %	0 %	259910332
12	NC_013263	CAGT	2	8	4748	4755	25 %	25 %	25 %	25 %	259910332
13	NC_013263	CAAA	2	8	5178	5185	75 %	0 %	0 %	25 %	259910332
14	NC_013263	GCCA	2	8	5401	5408	25 %	0 %	25 %	50 %	259910332
15	NC_013263	GCCT	2	8	7125	7132	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013263	TATT	2	8	7846	7853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013263	AGGG	2	8	7938	7945	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013263	CAAT	2	8	8382	8389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013263	TTCG	2	8	9138	9145	0 %	50 %	25 %	25 %	259910335
20	NC_013263	TGAA	2	8	9738	9745	50 %	25 %	25 %	0 %	259910335
21	NC_013263	CTGC	2	8	10328	10335	0 %	25 %	25 %	50 %	259910335
22	NC_013263	TACC	2	8	10441	10448	25 %	25 %	0 %	50 %	259910335
23	NC_013263	TGGT	2	8	10841	10848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013263	GCAA	2	8	11302	11309	50 %	0 %	25 %	25 %	259910336
25	NC_013263	TGCT	2	8	11656	11663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013263	ATTT	2	8	11703	11710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013263	CAGC	2	8	12330	12337	25 %	0 %	25 %	50 %	259910337
28	NC_013263	ATCA	2	8	12424	12431	50 %	25 %	0 %	25 %	259910337
29	NC_013263	CGTA	2	8	12609	12616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013263	ACTT	2	8	12657	12664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013263	CGGG	2	8	13376	13383	0 %	0 %	75 %	25 %	259910338
32	NC_013263	CGAT	2	8	14268	14275	25 %	25 %	25 %	25 %	259910339
33	NC_013263	GCGG	2	8	15308	15315	0 %	0 %	75 %	25 %	259910341
34	NC_013263	CGAT	2	8	15567	15574	25 %	25 %	25 %	25 %	259910341
35	NC_013263	ATAA	2	8	18660	18667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013263	GCTT	2	8	18788	18795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013263	TCGG	2	8	19026	19033	0 %	25 %	50 %	25 %	259910347
38	NC_013263	GTAT	2	8	19222	19229	25 %	50 %	25 %	0 %	259910347
39	NC_013263	CAGC	2	8	19729	19736	25 %	0 %	25 %	50 %	259910347
40	NC_013263	GCCA	2	8	19832	19839	25 %	0 %	25 %	50 %	259910347
41	NC_013263	ATTA	2	8	20113	20120	50 %	50 %	0 %	0 %	259910347
42	NC_013263	CTGT	2	8	20149	20156	0 %	50 %	25 %	25 %	259910347
43	NC_013263	ATCA	2	8	20201	20208	50 %	25 %	0 %	25 %	259910347
44	NC_013263	CAGC	2	8	21375	21382	25 %	0 %	25 %	50 %	259910348
45	NC_013263	CGGG	2	8	22982	22989	0 %	0 %	75 %	25 %	259910349
46	NC_013263	CTGG	2	8	23039	23046	0 %	25 %	50 %	25 %	259910349
47	NC_013263	ACGC	2	8	23485	23492	25 %	0 %	25 %	50 %	259910350
48	NC_013263	TTCC	2	8	23564	23571	0 %	50 %	0 %	50 %	259910350
49	NC_013263	GGTA	2	8	23843	23850	25 %	25 %	50 %	0 %	259910350
50	NC_013263	AGAA	2	8	25197	25204	75 %	0 %	25 %	0 %	259910351
51	NC_013263	ATAA	2	8	25817	25824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013263	TGTC	2	8	26176	26183	0 %	50 %	25 %	25 %	259910352
53	NC_013263	GAAA	2	8	26351	26358	75 %	0 %	25 %	0 %	259910352
54	NC_013263	TGAT	2	8	26529	26536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013263	CTGC	2	8	26540	26547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013263	GTCC	2	8	27134	27141	0 %	25 %	25 %	50 %	259910353
57	NC_013263	GCCA	2	8	27226	27233	25 %	0 %	25 %	50 %	259910353
58	NC_013263	TTCA	2	8	28727	28734	25 %	50 %	0 %	25 %	259910355
59	NC_013263	GCAA	2	8	29734	29741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013263	CAGC	2	8	29796	29803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013263	CGAT	2	8	29859	29866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013263	GTTA	2	8	30018	30025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013263	TTAA	2	8	30028	30035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013263	GACT	2	8	30126	30133	25 %	25 %	25 %	25 %	259910356
65	NC_013263	CATT	2	8	30196	30203	25 %	50 %	0 %	25 %	259910356
66	NC_013263	AAGT	2	8	30477	30484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013263	AACA	2	8	30818	30825	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013263	CGAA	2	8	30887	30894	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013263	TCGA	2	8	31292	31299	25 %	25 %	25 %	25 %	259910358
70	NC_013263	TACG	2	8	31545	31552	25 %	25 %	25 %	25 %	259910358
71	NC_013263	GATG	2	8	31696	31703	25 %	25 %	50 %	0 %	259910358
72	NC_013263	ATGA	2	8	31874	31881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013263	TTTC	2	8	31929	31936	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013263	GTGG	2	8	32861	32868	0 %	25 %	75 %	0 %	259910360
75	NC_013263	GTTA	2	8	33401	33408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013263	CTGT	2	8	33597	33604	0 %	50 %	25 %	25 %	259910361
77	NC_013263	TTCT	2	8	33863	33870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013263	TTAA	2	8	33971	33978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013263	ATAA	2	8	34163	34170	75 %	25 %	0 %	0 %	259910362
80	NC_013263	TGCT	2	8	34215	34222	0 %	50 %	25 %	25 %	259910363
81	NC_013263	AGTG	2	8	34270	34277	25 %	25 %	50 %	0 %	259910363
82	NC_013263	ATGC	2	8	35155	35162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013263	CAAG	2	8	35253	35260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.