Tetra-nucleotide Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 plasmid pEP36
Total Repeats: 53
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_013263 | CGTC | 2 | 8 | 942 | 949 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 259910330 |
2 | NC_013263 | GTTC | 2 | 8 | 954 | 961 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 259910330 |
3 | NC_013263 | CCCG | 2 | 8 | 1750 | 1757 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 259910331 |
4 | NC_013263 | TTCC | 2 | 8 | 2676 | 2683 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 259910331 |
5 | NC_013263 | CTGG | 2 | 8 | 2924 | 2931 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 259910331 |
6 | NC_013263 | TCCC | 2 | 8 | 3146 | 3153 | 0 % | 25 % | 0 % | 75 % | 259910331 |
7 | NC_013263 | GCCA | 2 | 8 | 3522 | 3529 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 259910331 |
8 | NC_013263 | CCCG | 2 | 8 | 4042 | 4049 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 259910331 |
9 | NC_013263 | AATT | 2 | 8 | 4482 | 4489 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 259910331 |
10 | NC_013263 | AGAT | 2 | 8 | 4535 | 4542 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 259910332 |
11 | NC_013263 | CAGT | 2 | 8 | 4748 | 4755 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 259910332 |
12 | NC_013263 | CAAA | 2 | 8 | 5178 | 5185 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 259910332 |
13 | NC_013263 | GCCA | 2 | 8 | 5401 | 5408 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 259910332 |
14 | NC_013263 | TTCG | 2 | 8 | 9138 | 9145 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 259910335 |
15 | NC_013263 | TGAA | 2 | 8 | 9738 | 9745 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 259910335 |
16 | NC_013263 | CTGC | 2 | 8 | 10328 | 10335 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 259910335 |
17 | NC_013263 | TACC | 2 | 8 | 10441 | 10448 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 259910335 |
18 | NC_013263 | GCAA | 2 | 8 | 11302 | 11309 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 259910336 |
19 | NC_013263 | CAGC | 2 | 8 | 12330 | 12337 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 259910337 |
20 | NC_013263 | ATCA | 2 | 8 | 12424 | 12431 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 259910337 |
21 | NC_013263 | CGGG | 2 | 8 | 13376 | 13383 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 259910338 |
22 | NC_013263 | CGAT | 2 | 8 | 14268 | 14275 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 259910339 |
23 | NC_013263 | GCGG | 2 | 8 | 15308 | 15315 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 259910341 |
24 | NC_013263 | CGAT | 2 | 8 | 15567 | 15574 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 259910341 |
25 | NC_013263 | TCGG | 2 | 8 | 19026 | 19033 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 259910347 |
26 | NC_013263 | GTAT | 2 | 8 | 19222 | 19229 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 259910347 |
27 | NC_013263 | CAGC | 2 | 8 | 19729 | 19736 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 259910347 |
28 | NC_013263 | GCCA | 2 | 8 | 19832 | 19839 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 259910347 |
29 | NC_013263 | ATTA | 2 | 8 | 20113 | 20120 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 259910347 |
30 | NC_013263 | CTGT | 2 | 8 | 20149 | 20156 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 259910347 |
31 | NC_013263 | ATCA | 2 | 8 | 20201 | 20208 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 259910347 |
32 | NC_013263 | CAGC | 2 | 8 | 21375 | 21382 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 259910348 |
33 | NC_013263 | CGGG | 2 | 8 | 22982 | 22989 | 0 % | 0 % | 75 % | 25 % | 259910349 |
34 | NC_013263 | CTGG | 2 | 8 | 23039 | 23046 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 259910349 |
35 | NC_013263 | ACGC | 2 | 8 | 23485 | 23492 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 259910350 |
36 | NC_013263 | TTCC | 2 | 8 | 23564 | 23571 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 259910350 |
37 | NC_013263 | GGTA | 2 | 8 | 23843 | 23850 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 259910350 |
38 | NC_013263 | AGAA | 2 | 8 | 25197 | 25204 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 259910351 |
39 | NC_013263 | TGTC | 2 | 8 | 26176 | 26183 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 259910352 |
40 | NC_013263 | GAAA | 2 | 8 | 26351 | 26358 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 259910352 |
41 | NC_013263 | GTCC | 2 | 8 | 27134 | 27141 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 259910353 |
42 | NC_013263 | GCCA | 2 | 8 | 27226 | 27233 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 259910353 |
43 | NC_013263 | TTCA | 2 | 8 | 28727 | 28734 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 259910355 |
44 | NC_013263 | GACT | 2 | 8 | 30126 | 30133 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 259910356 |
45 | NC_013263 | CATT | 2 | 8 | 30196 | 30203 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 259910356 |
46 | NC_013263 | TCGA | 2 | 8 | 31292 | 31299 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 259910358 |
47 | NC_013263 | TACG | 2 | 8 | 31545 | 31552 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 259910358 |
48 | NC_013263 | GATG | 2 | 8 | 31696 | 31703 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 259910358 |
49 | NC_013263 | GTGG | 2 | 8 | 32861 | 32868 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | 259910360 |
50 | NC_013263 | CTGT | 2 | 8 | 33597 | 33604 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 259910361 |
51 | NC_013263 | ATAA | 2 | 8 | 34163 | 34170 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 259910362 |
52 | NC_013263 | TGCT | 2 | 8 | 34215 | 34222 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 259910363 |
53 | NC_013263 | AGTG | 2 | 8 | 34270 | 34277 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 259910363 |