MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 plasmid pEP36

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013263	GCG	2	6	21	26	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013263	TGC	2	6	545	550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013263	TAA	2	6	636	641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013263	TTC	2	6	687	692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013263	CAT	2	6	704	709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013263	ATA	2	6	1433	1438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013263	TCT	2	6	4491	4496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013263	GAC	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013263	TTC	2	6	7052	7057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013263	TTA	2	6	7070	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013263	TGA	2	6	7220	7225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013263	TAA	2	6	7307	7312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013263	CTT	2	6	7379	7384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013263	AAT	2	6	7424	7429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013263	GGA	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013263	CAT	2	6	7541	7546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013263	TAA	2	6	7564	7569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013263	GCA	2	6	7999	8004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013263	GGC	2	6	8079	8084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013263	GCG	2	6	8151	8156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013263	GGC	2	6	8161	8166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013263	CTG	2	6	8261	8266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013263	ACG	2	6	8344	8349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013263	AGG	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013263	ACT	2	6	8480	8485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013263	GCG	2	6	8524	8529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013263	TCT	2	6	8583	8588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013263	TAA	2	6	10700	10705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013263	CGT	2	6	10776	10781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013263	TGT	2	6	10905	10910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013263	GAA	2	6	11560	11565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013263	TAT	2	6	11569	11574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013263	GTT	2	6	11597	11602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013263	TTC	2	6	11692	11697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013263	ATT	2	6	11768	11773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013263	TTA	2	6	11831	11836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013263	ACA	2	6	11856	11861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013263	GCA	2	6	11890	11895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013263	TGG	2	6	11898	11903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013263	CAT	2	6	12729	12734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013263	GTC	2	6	12759	12764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013263	AGC	2	6	12961	12966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013263	CAA	2	6	12985	12990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013263	ACG	2	6	16209	16214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013263	TGA	2	6	16218	16223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013263	GAA	2	6	16384	16389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013263	CGC	2	6	17035	17040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013263	ACC	2	6	17079	17084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013263	ACG	2	6	17449	17454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013263	ATG	2	6	17533	17538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013263	AGC	2	6	17547	17552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013263	TGA	2	6	17623	17628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013263	TTC	2	6	18424	18429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013263	TTC	2	6	18494	18499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013263	GCT	2	6	18545	18550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013263	CTT	2	6	18554	18559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013263	TAT	2	6	18688	18693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013263	AGA	2	6	20428	20433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013263	GGA	2	6	20453	20458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013263	CCG	2	6	20509	20514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013263	ATC	2	6	20569	20574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013263	CAG	2	6	20583	20588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013263	CAG	2	6	20618	20623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013263	GGA	2	6	20697	20702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013263	ATT	2	6	22199	22204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013263	AAT	2	6	22216	22221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013263	AGA	2	6	22224	22229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013263	TCC	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013263	GCG	2	6	24258	24263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013263	ATA	2	6	24269	24274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013263	AAT	2	6	24331	24336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013263	TGT	2	6	24465	24470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013263	ATC	2	6	24586	24591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013263	CGG	2	6	24621	24626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013263	CGT	2	6	24673	24678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013263	AGT	2	6	24772	24777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013263	GGC	2	6	25447	25452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013263	TAA	2	6	25731	25736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013263	CGA	2	6	26489	26494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013263	GTT	2	6	27849	27854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013263	GTG	2	6	28018	28023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013263	CAA	2	6	28479	28484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013263	GTT	2	6	28498	28503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013263	ACT	2	6	28510	28515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013263	TAC	2	6	28518	28523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013263	GCC	2	6	28568	28573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_013263	AAT	2	6	28584	28589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013263	ATT	2	6	29713	29718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013263	CAT	2	6	29763	29768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013263	GAG	2	6	29834	29839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013263	CAT	2	6	29910	29915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013263	TGA	2	6	29966	29971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013263	ATT	2	6	30342	30347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013263	ATG	2	6	30368	30373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013263	TTC	2	6	30385	30390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013263	ATG	2	6	30432	30437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013263	GAA	2	6	30512	30517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013263	AGA	2	6	30568	30573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013263	AGC	2	6	30872	30877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013263	TTA	2	6	31892	31897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013263	TTG	2	6	32069	32074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013263	TGA	2	6	33123	33128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013263	CTG	2	6	33236	33241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013263	CGT	2	6	33253	33258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013263	TGA	2	6	33297	33302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013263	TGA	2	6	33326	33331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013263	GTT	2	6	33377	33382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013263	CTG	2	6	33515	33520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013263	CGG	2	6	33727	33732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013263	TGC	2	6	33779	33784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013263	TAA	2	6	34172	34177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013263	TTG	2	6	34178	34183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013263	TTC	2	6	35118	35123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013263	TCA	2	6	35173	35178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013263	CAG	2	6	35692	35697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013263	ACA	2	6	35792	35797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013263	GCC	2	6	35809	35814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.