MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 plasmid pEP36

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013263	GGT	2	6	91	96	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910329
2	NC_013263	CGC	2	6	138	143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259910329
3	NC_013263	GGC	2	6	189	194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259910329
4	NC_013263	GTG	2	6	231	236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910329
5	NC_013263	GCT	2	6	309	314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910329
6	NC_013263	CTT	2	6	340	345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259910329
7	NC_013263	AAT	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259910329
8	NC_013263	CGT	2	6	449	454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910329
9	NC_013263	GGC	2	6	467	472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259910329
10	NC_013263	GAT	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910330
11	NC_013263	CGT	2	6	789	794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910330
12	NC_013263	ACC	2	6	840	845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259910330
13	NC_013263	GCA	2	6	933	938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910330
14	NC_013263	CAG	2	6	991	996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910330
15	NC_013263	CTT	2	6	1073	1078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259910330
16	NC_013263	GAT	2	6	1145	1150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910330
17	NC_013263	AGC	2	6	1176	1181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910330
18	NC_013263	TCA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259910330
19	NC_013263	GCC	2	6	1542	1547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259910331
20	NC_013263	TGA	2	6	1586	1591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910331
21	NC_013263	CAC	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259910331
22	NC_013263	GCA	2	6	1731	1736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910331
23	NC_013263	ATA	2	6	1786	1791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259910331
24	NC_013263	GCA	2	6	1820	1825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910331
25	NC_013263	TCT	2	6	1877	1882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259910331
26	NC_013263	ATT	2	6	1995	2000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259910331
27	NC_013263	TCG	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910331
28	NC_013263	AGC	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910331
29	NC_013263	GCG	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259910331
30	NC_013263	GAA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259910331
31	NC_013263	GCA	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910331
32	NC_013263	CTG	2	6	2484	2489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910331
33	NC_013263	TGG	2	6	2647	2652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910331
34	NC_013263	TGA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910331
35	NC_013263	ATC	2	6	2808	2813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259910331
36	NC_013263	CTG	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910331
37	NC_013263	TCG	3	9	2909	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910331
38	NC_013263	GCT	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910331
39	NC_013263	ATG	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910331
40	NC_013263	CAG	2	6	3161	3166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910331
41	NC_013263	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910331
42	NC_013263	AAC	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259910331
43	NC_013263	TTG	2	6	3357	3362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259910331
44	NC_013263	GCG	3	9	3535	3543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259910331
45	NC_013263	AAC	2	6	3739	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259910331
46	NC_013263	AAT	2	6	3767	3772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259910331
47	NC_013263	AAT	2	6	3965	3970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259910331
48	NC_013263	TGA	3	9	4118	4126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910331
49	NC_013263	GTC	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910331
50	NC_013263	AGT	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910331
51	NC_013263	AGG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	259910331
52	NC_013263	ATT	2	6	4561	4566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259910332
53	NC_013263	GTG	2	6	4574	4579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910332
54	NC_013263	TGT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259910332
55	NC_013263	TGG	2	6	4835	4840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910332
56	NC_013263	AGC	2	6	4892	4897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910332
57	NC_013263	AAC	2	6	4924	4929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259910332
58	NC_013263	ACC	2	6	4978	4983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259910332
59	NC_013263	CTG	2	6	5002	5007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910332
60	NC_013263	GGA	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	259910332
61	NC_013263	GCA	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910332
62	NC_013263	GCA	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910332
63	NC_013263	AAT	2	6	5346	5351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259910332
64	NC_013263	GGT	2	6	5463	5468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910332
65	NC_013263	GTT	2	6	5599	5604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259910333
66	NC_013263	TCA	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259910333
67	NC_013263	TGC	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910333
68	NC_013263	TGC	3	9	5898	5906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910333
69	NC_013263	ATC	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259910333
70	NC_013263	TAT	2	6	6091	6096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259910333
71	NC_013263	TGT	2	6	6112	6117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259910333
72	NC_013263	GAC	2	6	6118	6123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910333
73	NC_013263	TGC	2	6	6178	6183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910334
74	NC_013263	GCA	2	6	6189	6194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910334
75	NC_013263	ACT	2	6	6385	6390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259910334
76	NC_013263	ACA	2	6	6724	6729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259910334
77	NC_013263	GGT	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910334
78	NC_013263	GCG	2	6	6817	6822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259910334
79	NC_013263	AAT	2	6	6825	6830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259910334
80	NC_013263	ATT	2	6	6843	6848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259910334
81	NC_013263	GAA	2	6	6869	6874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259910334
82	NC_013263	TAA	2	6	6965	6970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259910334
83	NC_013263	CAG	2	6	8679	8684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910335
84	NC_013263	GAC	2	6	8707	8712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910335
85	NC_013263	TAT	2	6	8786	8791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259910335
86	NC_013263	CTG	2	6	8792	8797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910335
87	NC_013263	TTC	2	6	8948	8953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259910335
88	NC_013263	ATG	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910335
89	NC_013263	CCG	2	6	8987	8992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259910335
90	NC_013263	CCA	2	6	9237	9242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259910335
91	NC_013263	GTT	2	6	9286	9291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259910335
92	NC_013263	CTG	2	6	9413	9418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910335
93	NC_013263	AAC	2	6	9566	9571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259910335
94	NC_013263	TTC	2	6	9581	9586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259910335
95	NC_013263	TGG	2	6	9593	9598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910335
96	NC_013263	TGT	2	6	9705	9710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259910335
97	NC_013263	ATC	2	6	9746	9751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259910335
98	NC_013263	CTG	2	6	9812	9817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910335
99	NC_013263	CCA	2	6	9855	9860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259910335
100	NC_013263	CTG	2	6	9869	9874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910335
101	NC_013263	AAT	2	6	9944	9949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259910335
102	NC_013263	TCT	2	6	10083	10088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259910335
103	NC_013263	AGA	2	6	10123	10128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259910335
104	NC_013263	CGC	2	6	10158	10163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259910335
105	NC_013263	AGC	2	6	10191	10196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910335
106	NC_013263	GAA	2	6	10274	10279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259910335
107	NC_013263	ACT	2	6	10470	10475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259910335
108	NC_013263	CTG	2	6	10493	10498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910335
109	NC_013263	ATC	2	6	10544	10549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259910335
110	NC_013263	CAA	2	6	11056	11061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	259910336
111	NC_013263	TTA	2	6	11136	11141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259910336
112	NC_013263	ATA	2	6	11318	11323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259910336
113	NC_013263	GCG	2	6	11427	11432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259910336
114	NC_013263	GTA	2	6	11498	11503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910336
115	NC_013263	ATC	2	6	12133	12138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259910337
116	NC_013263	GCC	2	6	12153	12158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259910337
117	NC_013263	AGC	2	6	12212	12217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910337
118	NC_013263	CGG	2	6	12240	12245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259910337
119	NC_013263	GCA	2	6	12458	12463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910337
120	NC_013263	CGC	2	6	12517	12522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259910337
121	NC_013263	TGA	2	6	13165	13170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910338
122	NC_013263	CTG	2	6	13184	13189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910338
123	NC_013263	GGC	2	6	13440	13445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259910338
124	NC_013263	TCG	2	6	13509	13514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910338
125	NC_013263	GTG	2	6	13517	13522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910338
126	NC_013263	TGG	3	9	13561	13569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910338
127	NC_013263	CCG	2	6	13572	13577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259910338
128	NC_013263	GCA	2	6	13727	13732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910338
129	NC_013263	TGA	2	6	13823	13828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259910338
130	NC_013263	TGC	2	6	13861	13866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910338
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133	NC_013263	CAG	2	6	13994	13999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910338
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253	NC_013263	GCC	2	6	26681	26686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259910353
254	NC_013263	GTC	2	6	26757	26762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259910353
255	NC_013263	GTG	2	6	26830	26835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259910353
256	NC_013263	GAA	2	6	26868	26873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259910353
257	NC_013263	GCC	2	6	26968	26973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259910353
258	NC_013263	TCT	2	6	26974	26979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259910353
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260	NC_013263	AAT	2	6	27069	27074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259910353
261	NC_013263	CGA	2	6	27470	27475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910353
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303	NC_013263	GCA	2	6	35418	35423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259910365
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.