MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Methylomirabilis oxyfera

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013260	TTAGTG	2	12	10508	10519	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013260	TGCGGG	2	12	29916	29927	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013260	TGACTG	2	12	132818	132829	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013260	GATCCT	2	12	151466	151477	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013260	AGGGGG	2	12	218220	218231	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013260	GATCGA	2	12	258538	258549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013260	ATCTTT	2	12	274541	274552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013260	GAGAAG	2	12	312846	312857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013260	TGAAGA	2	12	330441	330452	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013260	CGATGC	2	12	334732	334743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013260	GATGGG	2	12	342076	342087	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013260	TTCTCT	2	12	355183	355194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013260	GTGACG	2	12	360110	360121	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013260	GGCGCT	2	12	554083	554094	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013260	ACGACC	2	12	555043	555054	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013260	AAGACA	2	12	558016	558027	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013260	TAGAGA	2	12	561718	561729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013260	ATCAGG	2	12	611713	611724	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013260	GAAAAG	2	12	620089	620100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013260	ACGAGA	2	12	654271	654282	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013260	GCATGG	2	12	790977	790988	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013260	GCTTCG	2	12	811720	811731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013260	AGAGGG	2	12	840189	840200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013260	AAAAGC	2	12	858434	858445	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013260	GGGATA	2	12	885923	885934	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013260	TGACCA	2	12	902356	902367	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013260	CGAAGC	2	12	906980	906991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013260	GAAGAG	2	12	907843	907854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013260	GGCAGG	2	12	936207	936218	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013260	TGCGGT	2	12	948648	948659	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013260	GACAGA	2	12	1000002	1000013	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013260	GATTCC	2	12	1035665	1035676	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013260	AACCGG	2	12	1062828	1062839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013260	GGTGAG	2	12	1086749	1086760	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013260	AGAGGG	2	12	1107797	1107808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013260	CAGAAG	2	12	1109250	1109261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013260	GTAAAA	2	12	1148435	1148446	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013260	CGAAGC	2	12	1189257	1189268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013260	TCGCCG	2	12	1209674	1209685	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013260	TTATCC	2	12	1222141	1222152	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013260	AATTAC	2	12	1267743	1267754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013260	ATTACG	2	12	1278090	1278101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013260	CTGACC	2	12	1314873	1314884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013260	GCTTCG	2	12	1367137	1367148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013260	AGCCAA	2	12	1376290	1376301	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013260	CAACAG	2	12	1441874	1441885	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013260	GGCGAC	2	12	1444567	1444578	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013260	GATCAC	2	12	1479449	1479460	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013260	CCATGC	2	12	1549774	1549785	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013260	CGAAGC	2	12	1642698	1642709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013260	CGTCTG	2	12	1654034	1654045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013260	ACGTCT	2	12	1722949	1722960	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013260	CTGCCG	2	12	1745043	1745054	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013260	GCTCTT	2	12	1746012	1746023	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013260	ACCGTC	2	12	1870575	1870586	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013260	CGGCAT	2	12	1875906	1875917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013260	GGTCGA	2	12	1891487	1891498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013260	GCGGCC	2	12	1903580	1903591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013260	CCCCTT	2	12	1939727	1939738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013260	ACCTCC	2	12	1961500	1961511	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013260	GGTCCC	2	12	1961525	1961536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013260	AAATGC	2	12	1975130	1975141	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013260	GTGGTT	2	12	2046334	2046345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013260	ATACCA	2	12	2059459	2059470	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013260	GGCTCT	2	12	2072985	2072996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013260	CTTATT	2	12	2094685	2094696	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013260	TCCACC	2	12	2104856	2104867	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013260	CTTATT	2	12	2111490	2111501	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013260	CTTTCA	2	12	2112237	2112248	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013260	GAAACT	2	12	2167922	2167933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013260	AAGCGA	2	12	2217450	2217461	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013260	GCCCTT	2	12	2300499	2300510	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013260	CTTTCG	2	12	2360087	2360098	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013260	AACATG	2	12	2394691	2394702	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013260	ATCCTC	2	12	2397250	2397261	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013260	CCTTCC	2	12	2397320	2397331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013260	GCACAC	2	12	2424668	2424679	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013260	GAGGCG	2	12	2479550	2479561	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013260	CCGCCT	2	12	2479572	2479583	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013260	TAGATA	2	12	2545946	2545957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013260	TTTCCG	2	12	2567555	2567566	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013260	CCGGTT	2	12	2575427	2575438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013260	CCGGCG	2	12	2575446	2575457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013260	CTACAG	2	12	2608660	2608671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013260	AGCGTG	2	12	2619407	2619418	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013260	CCGCGA	2	12	2680713	2680724	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013260	GACAAG	2	12	2729417	2729428	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013260	GACAAG	2	12	2739854	2739865	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013260	GCGCCG	2	12	2741594	2741605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.