MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 plasmid pDRET01

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013224	CAGGCT	2	12	5519	5530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013224	TTTAAA	2	12	8761	8772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013224	TAAAGA	2	12	9335	9346	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	258406629
4	NC_013224	GATGGG	2	12	11416	11427	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	258406632
5	NC_013224	AACTGT	2	12	16907	16918	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258406640
6	NC_013224	GTTTTG	2	12	17200	17211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406640
7	NC_013224	TTACAA	2	12	23126	23137	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	258406645
8	NC_013224	CTTTAT	2	12	27350	27361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013224	TCCTGG	2	12	29819	29830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013224	TTTTTA	2	12	31311	31322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	258406652
11	NC_013224	TTATAT	2	12	32243	32254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013224	ATTTTT	2	12	35543	35554	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013224	CGTGAT	2	12	38480	38491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258406657
14	NC_013224	GAGCTT	2	12	38850	38861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258406657
15	NC_013224	TAAAAA	2	12	39770	39781	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.