MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 plasmid pDRET01

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013224	CTGCC	2	10	1303	1312	0 %	20 %	20 %	60 %	258406620
2	NC_013224	GACCG	2	10	1984	1993	20 %	0 %	40 %	40 %	258406622
3	NC_013224	TCTAC	2	10	3055	3064	20 %	40 %	0 %	40 %	258406624
4	NC_013224	AAACA	2	10	3545	3554	80 %	0 %	0 %	20 %	258406624
5	NC_013224	CAAGA	2	10	3822	3831	60 %	0 %	20 %	20 %	258406625
6	NC_013224	AGCTG	2	10	4922	4931	20 %	20 %	40 %	20 %	258406625
7	NC_013224	GGTGG	2	10	5378	5387	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013224	GCCAT	2	10	5409	5418	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013224	CTTTT	2	10	5488	5497	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013224	GCTTG	2	10	5894	5903	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013224	GTGTT	2	10	6315	6324	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013224	TATTT	2	10	8225	8234	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013224	CAATT	2	10	9211	9220	40 %	40 %	0 %	20 %	258406629
14	NC_013224	TTGCT	2	10	9552	9561	0 %	60 %	20 %	20 %	258406630
15	NC_013224	GCAAT	2	10	14087	14096	40 %	20 %	20 %	20 %	258406637
16	NC_013224	AAGCC	2	10	14636	14645	40 %	0 %	20 %	40 %	258406638
17	NC_013224	AGAAA	2	10	15810	15819	80 %	0 %	20 %	0 %	258406639
18	NC_013224	TACAA	2	10	16618	16627	60 %	20 %	0 %	20 %	258406639
19	NC_013224	TCGCT	2	10	19233	19242	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013224	TAAAA	2	10	24670	24679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013224	TGCTG	2	10	25328	25337	0 %	40 %	40 %	20 %	258406648
22	NC_013224	ATTTT	2	10	25516	25525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013224	AGAAA	2	10	32353	32362	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013224	AAGGG	2	10	32616	32625	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013224	ACCAA	2	10	33130	33139	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_013224	AGGGC	2	10	34166	34175	20 %	0 %	60 %	20 %	258406654
27	NC_013224	CATTT	2	10	34772	34781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013224	CATGG	2	10	35127	35136	20 %	20 %	40 %	20 %	258406655
29	NC_013224	ATTAA	2	10	35561	35570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013224	ACACC	2	10	36101	36110	40 %	0 %	0 %	60 %	258406657
31	NC_013224	ACCAA	2	10	37879	37888	60 %	0 %	0 %	40 %	258406657
32	NC_013224	TTAAT	2	10	40186	40195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013224	AAACA	2	10	41241	41250	80 %	0 %	0 %	20 %	258406659
34	NC_013224	AAAAT	2	10	41279	41288	80 %	20 %	0 %	0 %	258406659
35	NC_013224	TAAAA	2	10	42065	42074	80 %	20 %	0 %	0 %	258406660
36	NC_013224	TAAGA	2	10	42089	42098	60 %	20 %	20 %	0 %	258406660
37	NC_013224	GTGTT	2	10	44452	44461	0 %	60 %	40 %	0 %	258406664
38	NC_013224	CCTGG	2	10	44903	44912	0 %	20 %	40 %	40 %	258406665

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.