MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 plasmid pDRET01

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013224	TC	3	6	2030	2035	0 %	50 %	0 %	50 %	258406622
2	NC_013224	TA	3	6	3342	3347	50 %	50 %	0 %	0 %	258406624
3	NC_013224	GA	3	6	3730	3735	50 %	0 %	50 %	0 %	258406625
4	NC_013224	AT	4	8	4319	4326	50 %	50 %	0 %	0 %	258406625
5	NC_013224	AT	3	6	4901	4906	50 %	50 %	0 %	0 %	258406625
6	NC_013224	GA	3	6	5995	6000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013224	AT	3	6	6573	6578	50 %	50 %	0 %	0 %	258406626
8	NC_013224	TA	3	6	6844	6849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013224	CG	3	6	6898	6903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013224	TA	3	6	7926	7931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013224	CA	3	6	8414	8419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013224	GT	3	6	8558	8563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013224	TA	3	6	8613	8618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013224	TA	3	6	8730	8735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013224	GA	3	6	9046	9051	50 %	0 %	50 %	0 %	258406629
16	NC_013224	AT	4	8	9493	9500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013224	TA	3	6	9509	9514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013224	TC	3	6	10724	10729	0 %	50 %	0 %	50 %	258406631
19	NC_013224	TC	3	6	10854	10859	0 %	50 %	0 %	50 %	258406632
20	NC_013224	TA	3	6	11513	11518	50 %	50 %	0 %	0 %	258406633
21	NC_013224	AT	3	6	11582	11587	50 %	50 %	0 %	0 %	258406633
22	NC_013224	TA	3	6	11971	11976	50 %	50 %	0 %	0 %	258406634
23	NC_013224	AG	3	6	12058	12063	50 %	0 %	50 %	0 %	258406634
24	NC_013224	TA	3	6	12164	12169	50 %	50 %	0 %	0 %	258406634
25	NC_013224	AT	3	6	12292	12297	50 %	50 %	0 %	0 %	258406634
26	NC_013224	GT	3	6	13675	13680	0 %	50 %	50 %	0 %	258406637
27	NC_013224	TG	3	6	14310	14315	0 %	50 %	50 %	0 %	258406638
28	NC_013224	AT	3	6	15952	15957	50 %	50 %	0 %	0 %	258406639
29	NC_013224	AG	4	8	16330	16337	50 %	0 %	50 %	0 %	258406639
30	NC_013224	AG	3	6	16738	16743	50 %	0 %	50 %	0 %	258406639
31	NC_013224	TA	3	6	17082	17087	50 %	50 %	0 %	0 %	258406640
32	NC_013224	GA	3	6	17403	17408	50 %	0 %	50 %	0 %	258406640
33	NC_013224	CG	3	6	18161	18166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013224	TC	3	6	19555	19560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013224	CG	3	6	19590	19595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013224	GC	3	6	19796	19801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013224	AG	3	6	20507	20512	50 %	0 %	50 %	0 %	258406643
38	NC_013224	AT	4	8	20751	20758	50 %	50 %	0 %	0 %	258406643
39	NC_013224	GT	3	6	21082	21087	0 %	50 %	50 %	0 %	258406644
40	NC_013224	CA	3	6	22488	22493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013224	CT	3	6	22573	22578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013224	CA	3	6	22996	23001	50 %	0 %	0 %	50 %	258406645
43	NC_013224	TC	3	6	23540	23545	0 %	50 %	0 %	50 %	258406646
44	NC_013224	GA	3	6	23660	23665	50 %	0 %	50 %	0 %	258406646
45	NC_013224	AT	3	6	23736	23741	50 %	50 %	0 %	0 %	258406646
46	NC_013224	TA	3	6	23753	23758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013224	CT	3	6	23875	23880	0 %	50 %	0 %	50 %	258406647
48	NC_013224	TA	3	6	24104	24109	50 %	50 %	0 %	0 %	258406647
49	NC_013224	AT	3	6	24215	24220	50 %	50 %	0 %	0 %	258406647
50	NC_013224	AT	3	6	24311	24316	50 %	50 %	0 %	0 %	258406647
51	NC_013224	AT	3	6	25492	25497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013224	TA	3	6	25836	25841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013224	TA	3	6	25862	25867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013224	GA	3	6	26441	26446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013224	CT	3	6	27883	27888	0 %	50 %	0 %	50 %	258406649
56	NC_013224	CT	3	6	28007	28012	0 %	50 %	0 %	50 %	258406649
57	NC_013224	AC	3	6	28051	28056	50 %	0 %	0 %	50 %	258406649
58	NC_013224	TC	3	6	28363	28368	0 %	50 %	0 %	50 %	258406650
59	NC_013224	AG	3	6	28783	28788	50 %	0 %	50 %	0 %	258406650
60	NC_013224	AT	3	6	29979	29984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013224	GA	3	6	30588	30593	50 %	0 %	50 %	0 %	258406651
62	NC_013224	AT	4	8	30857	30864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013224	TA	3	6	31912	31917	50 %	50 %	0 %	0 %	258406652
64	NC_013224	TA	3	6	32311	32316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013224	AT	3	6	32883	32888	50 %	50 %	0 %	0 %	258406653
66	NC_013224	TG	3	6	33506	33511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013224	TA	4	8	34048	34055	50 %	50 %	0 %	0 %	258406654
68	NC_013224	AT	3	6	34446	34451	50 %	50 %	0 %	0 %	258406654
69	NC_013224	TA	3	6	34690	34695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013224	TG	3	6	34722	34727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013224	AC	3	6	35058	35063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013224	TG	3	6	35068	35073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013224	TG	3	6	36733	36738	0 %	50 %	50 %	0 %	258406657
74	NC_013224	AC	4	8	37026	37033	50 %	0 %	0 %	50 %	258406657
75	NC_013224	AT	3	6	38752	38757	50 %	50 %	0 %	0 %	258406657
76	NC_013224	CA	3	6	38772	38777	50 %	0 %	0 %	50 %	258406657
77	NC_013224	AT	3	6	40520	40525	50 %	50 %	0 %	0 %	258406659
78	NC_013224	TA	3	6	40634	40639	50 %	50 %	0 %	0 %	258406659
79	NC_013224	AC	3	6	41020	41025	50 %	0 %	0 %	50 %	258406659
80	NC_013224	AG	3	6	41503	41508	50 %	0 %	50 %	0 %	258406659
81	NC_013224	CA	3	6	43202	43207	50 %	0 %	0 %	50 %	258406662
82	NC_013224	AT	3	6	43918	43923	50 %	50 %	0 %	0 %	258406663
83	NC_013224	AT	3	6	44186	44191	50 %	50 %	0 %	0 %	258406663
84	NC_013224	TG	3	6	45049	45054	0 %	50 %	50 %	0 %	258406665

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.