MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 plasmid pDRET01

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013224	TC	3	6	2030	2035	0 %	50 %	0 %	50 %	258406622
2	NC_013224	TA	3	6	3342	3347	50 %	50 %	0 %	0 %	258406624
3	NC_013224	GA	3	6	3730	3735	50 %	0 %	50 %	0 %	258406625
4	NC_013224	AT	4	8	4319	4326	50 %	50 %	0 %	0 %	258406625
5	NC_013224	AT	3	6	4901	4906	50 %	50 %	0 %	0 %	258406625
6	NC_013224	AT	3	6	6573	6578	50 %	50 %	0 %	0 %	258406626
7	NC_013224	GA	3	6	9046	9051	50 %	0 %	50 %	0 %	258406629
8	NC_013224	TC	3	6	10724	10729	0 %	50 %	0 %	50 %	258406631
9	NC_013224	TC	3	6	10854	10859	0 %	50 %	0 %	50 %	258406632
10	NC_013224	TA	3	6	11513	11518	50 %	50 %	0 %	0 %	258406633
11	NC_013224	AT	3	6	11582	11587	50 %	50 %	0 %	0 %	258406633
12	NC_013224	TA	3	6	11971	11976	50 %	50 %	0 %	0 %	258406634
13	NC_013224	AG	3	6	12058	12063	50 %	0 %	50 %	0 %	258406634
14	NC_013224	TA	3	6	12164	12169	50 %	50 %	0 %	0 %	258406634
15	NC_013224	AT	3	6	12292	12297	50 %	50 %	0 %	0 %	258406634
16	NC_013224	GT	3	6	13675	13680	0 %	50 %	50 %	0 %	258406637
17	NC_013224	TG	3	6	14310	14315	0 %	50 %	50 %	0 %	258406638
18	NC_013224	AT	3	6	15952	15957	50 %	50 %	0 %	0 %	258406639
19	NC_013224	AG	4	8	16330	16337	50 %	0 %	50 %	0 %	258406639
20	NC_013224	AG	3	6	16738	16743	50 %	0 %	50 %	0 %	258406639
21	NC_013224	TA	3	6	17082	17087	50 %	50 %	0 %	0 %	258406640
22	NC_013224	GA	3	6	17403	17408	50 %	0 %	50 %	0 %	258406640
23	NC_013224	AG	3	6	20507	20512	50 %	0 %	50 %	0 %	258406643
24	NC_013224	AT	4	8	20751	20758	50 %	50 %	0 %	0 %	258406643
25	NC_013224	GT	3	6	21082	21087	0 %	50 %	50 %	0 %	258406644
26	NC_013224	CA	3	6	22996	23001	50 %	0 %	0 %	50 %	258406645
27	NC_013224	TC	3	6	23540	23545	0 %	50 %	0 %	50 %	258406646
28	NC_013224	GA	3	6	23660	23665	50 %	0 %	50 %	0 %	258406646
29	NC_013224	AT	3	6	23736	23741	50 %	50 %	0 %	0 %	258406646
30	NC_013224	CT	3	6	23875	23880	0 %	50 %	0 %	50 %	258406647
31	NC_013224	TA	3	6	24104	24109	50 %	50 %	0 %	0 %	258406647
32	NC_013224	AT	3	6	24215	24220	50 %	50 %	0 %	0 %	258406647
33	NC_013224	AT	3	6	24311	24316	50 %	50 %	0 %	0 %	258406647
34	NC_013224	CT	3	6	27883	27888	0 %	50 %	0 %	50 %	258406649
35	NC_013224	CT	3	6	28007	28012	0 %	50 %	0 %	50 %	258406649
36	NC_013224	AC	3	6	28051	28056	50 %	0 %	0 %	50 %	258406649
37	NC_013224	TC	3	6	28363	28368	0 %	50 %	0 %	50 %	258406650
38	NC_013224	AG	3	6	28783	28788	50 %	0 %	50 %	0 %	258406650
39	NC_013224	GA	3	6	30588	30593	50 %	0 %	50 %	0 %	258406651
40	NC_013224	TA	3	6	31912	31917	50 %	50 %	0 %	0 %	258406652
41	NC_013224	AT	3	6	32883	32888	50 %	50 %	0 %	0 %	258406653
42	NC_013224	TA	4	8	34048	34055	50 %	50 %	0 %	0 %	258406654
43	NC_013224	AT	3	6	34446	34451	50 %	50 %	0 %	0 %	258406654
44	NC_013224	TG	3	6	36733	36738	0 %	50 %	50 %	0 %	258406657
45	NC_013224	AC	4	8	37026	37033	50 %	0 %	0 %	50 %	258406657
46	NC_013224	AT	3	6	38752	38757	50 %	50 %	0 %	0 %	258406657
47	NC_013224	CA	3	6	38772	38777	50 %	0 %	0 %	50 %	258406657
48	NC_013224	AT	3	6	40520	40525	50 %	50 %	0 %	0 %	258406659
49	NC_013224	TA	3	6	40634	40639	50 %	50 %	0 %	0 %	258406659
50	NC_013224	AC	3	6	41020	41025	50 %	0 %	0 %	50 %	258406659
51	NC_013224	AG	3	6	41503	41508	50 %	0 %	50 %	0 %	258406659
52	NC_013224	CA	3	6	43202	43207	50 %	0 %	0 %	50 %	258406662
53	NC_013224	AT	3	6	43918	43923	50 %	50 %	0 %	0 %	258406663
54	NC_013224	AT	3	6	44186	44191	50 %	50 %	0 %	0 %	258406663
55	NC_013224	TG	3	6	45049	45054	0 %	50 %	50 %	0 %	258406665

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.