MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 plasmid pDRET01

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013224	A	7	7	887	893	100 %	0 %	0 %	0 %	258406619
2	NC_013224	A	7	7	1444	1450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013224	T	6	6	1755	1760	0 %	100 %	0 %	0 %	258406621
4	NC_013224	T	7	7	1783	1789	0 %	100 %	0 %	0 %	258406621
5	NC_013224	T	6	6	2075	2080	0 %	100 %	0 %	0 %	258406622
6	NC_013224	T	7	7	2117	2123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013224	C	6	6	2799	2804	0 %	0 %	0 %	100 %	258406623
8	NC_013224	A	7	7	3666	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	258406625
9	NC_013224	A	6	6	3807	3812	100 %	0 %	0 %	0 %	258406625
10	NC_013224	A	7	7	4264	4270	100 %	0 %	0 %	0 %	258406625
11	NC_013224	G	6	6	4571	4576	0 %	0 %	100 %	0 %	258406625
12	NC_013224	G	6	6	4580	4585	0 %	0 %	100 %	0 %	258406625
13	NC_013224	A	6	6	4746	4751	100 %	0 %	0 %	0 %	258406625
14	NC_013224	T	7	7	5124	5130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013224	G	6	6	5241	5246	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013224	A	6	6	6856	6861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013224	A	8	8	6907	6914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013224	A	6	6	7656	7661	100 %	0 %	0 %	0 %	258406628
19	NC_013224	A	6	6	8256	8261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013224	A	6	6	8326	8331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013224	T	7	7	8334	8340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013224	A	6	6	8343	8348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013224	A	7	7	8361	8367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013224	T	8	8	8487	8494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013224	A	8	8	8495	8502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013224	A	8	8	8534	8541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013224	A	6	6	8547	8552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013224	T	8	8	8628	8635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013224	T	8	8	8996	9003	0 %	100 %	0 %	0 %	258406629
30	NC_013224	T	6	6	9007	9012	0 %	100 %	0 %	0 %	258406629
31	NC_013224	T	6	6	9018	9023	0 %	100 %	0 %	0 %	258406629
32	NC_013224	A	7	7	9104	9110	100 %	0 %	0 %	0 %	258406629
33	NC_013224	A	7	7	9246	9252	100 %	0 %	0 %	0 %	258406629
34	NC_013224	A	6	6	9366	9371	100 %	0 %	0 %	0 %	258406629
35	NC_013224	T	9	9	9430	9438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013224	A	7	7	9439	9445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013224	T	6	6	9543	9548	0 %	100 %	0 %	0 %	258406630
38	NC_013224	T	6	6	10003	10008	0 %	100 %	0 %	0 %	258406630
39	NC_013224	A	7	7	10010	10016	100 %	0 %	0 %	0 %	258406630
40	NC_013224	T	6	6	10871	10876	0 %	100 %	0 %	0 %	258406632
41	NC_013224	C	6	6	11262	11267	0 %	0 %	0 %	100 %	258406632
42	NC_013224	A	6	6	11612	11617	100 %	0 %	0 %	0 %	258406633
43	NC_013224	A	6	6	11621	11626	100 %	0 %	0 %	0 %	258406633
44	NC_013224	T	7	7	11650	11656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013224	A	6	6	11670	11675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013224	T	7	7	11703	11709	0 %	100 %	0 %	0 %	258406634
47	NC_013224	T	6	6	11713	11718	0 %	100 %	0 %	0 %	258406634
48	NC_013224	A	7	7	11886	11892	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
49	NC_013224	A	7	7	11915	11921	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
50	NC_013224	A	7	7	12044	12050	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
51	NC_013224	A	7	7	12103	12109	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
52	NC_013224	A	6	6	12134	12139	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
53	NC_013224	A	7	7	12198	12204	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
54	NC_013224	A	8	8	12273	12280	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
55	NC_013224	A	7	7	13088	13094	100 %	0 %	0 %	0 %	258406636
56	NC_013224	A	6	6	13255	13260	100 %	0 %	0 %	0 %	258406636
57	NC_013224	A	6	6	14435	14440	100 %	0 %	0 %	0 %	258406638
58	NC_013224	A	6	6	15353	15358	100 %	0 %	0 %	0 %	258406638
59	NC_013224	T	6	6	17026	17031	0 %	100 %	0 %	0 %	258406640
60	NC_013224	A	6	6	17214	17219	100 %	0 %	0 %	0 %	258406640
61	NC_013224	A	8	8	17262	17269	100 %	0 %	0 %	0 %	258406640
62	NC_013224	T	7	7	17451	17457	0 %	100 %	0 %	0 %	258406640
63	NC_013224	T	6	6	17644	17649	0 %	100 %	0 %	0 %	258406640
64	NC_013224	T	6	6	18384	18389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013224	A	6	6	18498	18503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013224	G	6	6	19158	19163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013224	A	6	6	20693	20698	100 %	0 %	0 %	0 %	258406643
68	NC_013224	T	6	6	21682	21687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013224	G	6	6	22027	22032	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013224	T	6	6	22391	22396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013224	A	6	6	22631	22636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013224	A	6	6	22713	22718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013224	A	6	6	23001	23006	100 %	0 %	0 %	0 %	258406645
74	NC_013224	A	6	6	23107	23112	100 %	0 %	0 %	0 %	258406645
75	NC_013224	A	7	7	23136	23142	100 %	0 %	0 %	0 %	258406645
76	NC_013224	A	6	6	23298	23303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013224	A	6	6	23383	23388	100 %	0 %	0 %	0 %	258406646
78	NC_013224	A	6	6	23432	23437	100 %	0 %	0 %	0 %	258406646
79	NC_013224	A	6	6	23720	23725	100 %	0 %	0 %	0 %	258406646
80	NC_013224	A	9	9	24071	24079	100 %	0 %	0 %	0 %	258406647
81	NC_013224	T	6	6	24093	24098	0 %	100 %	0 %	0 %	258406647
82	NC_013224	A	6	6	24123	24128	100 %	0 %	0 %	0 %	258406647
83	NC_013224	A	6	6	24133	24138	100 %	0 %	0 %	0 %	258406647
84	NC_013224	A	7	7	24174	24180	100 %	0 %	0 %	0 %	258406647
85	NC_013224	A	7	7	24284	24290	100 %	0 %	0 %	0 %	258406647
86	NC_013224	T	7	7	24537	24543	0 %	100 %	0 %	0 %	258406647
87	NC_013224	T	6	6	24959	24964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013224	A	7	7	24974	24980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013224	T	7	7	25132	25138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013224	A	9	9	25445	25453	100 %	0 %	0 %	0 %	258406648
91	NC_013224	A	6	6	25628	25633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013224	T	7	7	26722	26728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013224	A	6	6	27426	27431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013224	A	6	6	27746	27751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013224	A	6	6	27910	27915	100 %	0 %	0 %	0 %	258406649
96	NC_013224	A	6	6	28133	28138	100 %	0 %	0 %	0 %	258406649
97	NC_013224	A	9	9	28214	28222	100 %	0 %	0 %	0 %	258406649
98	NC_013224	G	6	6	28236	28241	0 %	0 %	100 %	0 %	258406649
99	NC_013224	A	6	6	28327	28332	100 %	0 %	0 %	0 %	258406650
100	NC_013224	T	6	6	29607	29612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013224	A	7	7	30014	30020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013224	A	7	7	30506	30512	100 %	0 %	0 %	0 %	258406651
103	NC_013224	A	7	7	30554	30560	100 %	0 %	0 %	0 %	258406651
104	NC_013224	A	9	9	30593	30601	100 %	0 %	0 %	0 %	258406651
105	NC_013224	T	7	7	31605	31611	0 %	100 %	0 %	0 %	258406652
106	NC_013224	A	6	6	31904	31909	100 %	0 %	0 %	0 %	258406652
107	NC_013224	T	7	7	32195	32201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013224	T	6	6	32267	32272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013224	A	6	6	32515	32520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013224	T	6	6	32902	32907	0 %	100 %	0 %	0 %	258406653
111	NC_013224	A	8	8	32924	32931	100 %	0 %	0 %	0 %	258406653
112	NC_013224	T	7	7	33115	33121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013224	T	6	6	33285	33290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013224	A	6	6	33515	33520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013224	A	6	6	33557	33562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013224	A	8	8	33931	33938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013224	T	7	7	33980	33986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013224	A	7	7	34384	34390	100 %	0 %	0 %	0 %	258406654
119	NC_013224	T	6	6	34486	34491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013224	T	7	7	34930	34936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013224	T	6	6	35001	35006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013224	A	7	7	35310	35316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013224	G	6	6	35325	35330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013224	A	9	9	35373	35381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013224	A	6	6	35384	35389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013224	A	6	6	35396	35401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013224	T	6	6	35453	35458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013224	A	7	7	35465	35471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013224	T	8	8	35535	35542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013224	T	8	8	35550	35557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013224	A	6	6	35627	35632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013224	A	8	8	35925	35932	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
133	NC_013224	A	6	6	36552	36557	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
134	NC_013224	A	6	6	36849	36854	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
135	NC_013224	A	7	7	37315	37321	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
136	NC_013224	A	6	6	37404	37409	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
137	NC_013224	A	7	7	38100	38106	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
138	NC_013224	T	6	6	39005	39010	0 %	100 %	0 %	0 %	258406657
139	NC_013224	A	11	11	39246	39256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013224	C	7	7	39408	39414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_013224	A	6	6	39741	39746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013224	T	7	7	39751	39757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013224	A	7	7	39777	39783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013224	A	7	7	39888	39894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013224	T	6	6	39906	39911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013224	T	6	6	39917	39922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013224	A	6	6	39941	39946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013224	A	7	7	40020	40026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013224	T	6	6	40053	40058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013224	T	6	6	40237	40242	0 %	100 %	0 %	0 %	258406658
151	NC_013224	A	6	6	40337	40342	100 %	0 %	0 %	0 %	258406658
152	NC_013224	A	8	8	40356	40363	100 %	0 %	0 %	0 %	258406658
153	NC_013224	A	6	6	40544	40549	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
154	NC_013224	A	7	7	40647	40653	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
155	NC_013224	T	6	6	40782	40787	0 %	100 %	0 %	0 %	258406659
156	NC_013224	A	8	8	40927	40934	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
157	NC_013224	A	6	6	41221	41226	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
158	NC_013224	A	6	6	41667	41672	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
159	NC_013224	A	6	6	41765	41770	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
160	NC_013224	A	7	7	42245	42251	100 %	0 %	0 %	0 %	258406660
161	NC_013224	A	6	6	42279	42284	100 %	0 %	0 %	0 %	258406660
162	NC_013224	T	6	6	42305	42310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013224	A	6	6	42337	42342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013224	T	7	7	42474	42480	0 %	100 %	0 %	0 %	258406661
165	NC_013224	A	7	7	42589	42595	100 %	0 %	0 %	0 %	258406661
166	NC_013224	T	9	9	42705	42713	0 %	100 %	0 %	0 %	258406661
167	NC_013224	A	7	7	43123	43129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_013224	A	8	8	43144	43151	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
169	NC_013224	A	6	6	43503	43508	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
170	NC_013224	T	7	7	43579	43585	0 %	100 %	0 %	0 %	258406662
171	NC_013224	A	7	7	43705	43711	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
172	NC_013224	T	7	7	43720	43726	0 %	100 %	0 %	0 %	258406662
173	NC_013224	A	6	6	43878	43883	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
174	NC_013224	A	6	6	43941	43946	100 %	0 %	0 %	0 %	258406663
175	NC_013224	T	7	7	43990	43996	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
176	NC_013224	T	7	7	44028	44034	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
177	NC_013224	T	7	7	44174	44180	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
178	NC_013224	T	6	6	44268	44273	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
179	NC_013224	T	7	7	44283	44289	0 %	100 %	0 %	0 %	258406664

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.