MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 plasmid pDRET01

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013224	A	7	7	887	893	100 %	0 %	0 %	0 %	258406619
2	NC_013224	T	6	6	1755	1760	0 %	100 %	0 %	0 %	258406621
3	NC_013224	T	7	7	1783	1789	0 %	100 %	0 %	0 %	258406621
4	NC_013224	T	6	6	2075	2080	0 %	100 %	0 %	0 %	258406622
5	NC_013224	C	6	6	2799	2804	0 %	0 %	0 %	100 %	258406623
6	NC_013224	A	7	7	3666	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	258406625
7	NC_013224	A	6	6	3807	3812	100 %	0 %	0 %	0 %	258406625
8	NC_013224	A	7	7	4264	4270	100 %	0 %	0 %	0 %	258406625
9	NC_013224	G	6	6	4571	4576	0 %	0 %	100 %	0 %	258406625
10	NC_013224	G	6	6	4580	4585	0 %	0 %	100 %	0 %	258406625
11	NC_013224	A	6	6	4746	4751	100 %	0 %	0 %	0 %	258406625
12	NC_013224	A	6	6	7656	7661	100 %	0 %	0 %	0 %	258406628
13	NC_013224	T	8	8	8996	9003	0 %	100 %	0 %	0 %	258406629
14	NC_013224	T	6	6	9007	9012	0 %	100 %	0 %	0 %	258406629
15	NC_013224	T	6	6	9018	9023	0 %	100 %	0 %	0 %	258406629
16	NC_013224	A	7	7	9104	9110	100 %	0 %	0 %	0 %	258406629
17	NC_013224	A	7	7	9246	9252	100 %	0 %	0 %	0 %	258406629
18	NC_013224	A	6	6	9366	9371	100 %	0 %	0 %	0 %	258406629
19	NC_013224	T	6	6	9543	9548	0 %	100 %	0 %	0 %	258406630
20	NC_013224	T	6	6	10003	10008	0 %	100 %	0 %	0 %	258406630
21	NC_013224	A	7	7	10010	10016	100 %	0 %	0 %	0 %	258406630
22	NC_013224	T	6	6	10871	10876	0 %	100 %	0 %	0 %	258406632
23	NC_013224	C	6	6	11262	11267	0 %	0 %	0 %	100 %	258406632
24	NC_013224	A	6	6	11612	11617	100 %	0 %	0 %	0 %	258406633
25	NC_013224	A	6	6	11621	11626	100 %	0 %	0 %	0 %	258406633
26	NC_013224	T	7	7	11703	11709	0 %	100 %	0 %	0 %	258406634
27	NC_013224	T	6	6	11713	11718	0 %	100 %	0 %	0 %	258406634
28	NC_013224	A	7	7	11886	11892	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
29	NC_013224	A	7	7	11915	11921	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
30	NC_013224	A	7	7	12044	12050	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
31	NC_013224	A	7	7	12103	12109	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
32	NC_013224	A	6	6	12134	12139	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
33	NC_013224	A	7	7	12198	12204	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
34	NC_013224	A	8	8	12273	12280	100 %	0 %	0 %	0 %	258406634
35	NC_013224	A	7	7	13088	13094	100 %	0 %	0 %	0 %	258406636
36	NC_013224	A	6	6	13255	13260	100 %	0 %	0 %	0 %	258406636
37	NC_013224	A	6	6	14435	14440	100 %	0 %	0 %	0 %	258406638
38	NC_013224	A	6	6	15353	15358	100 %	0 %	0 %	0 %	258406638
39	NC_013224	T	6	6	17026	17031	0 %	100 %	0 %	0 %	258406640
40	NC_013224	A	6	6	17214	17219	100 %	0 %	0 %	0 %	258406640
41	NC_013224	A	8	8	17262	17269	100 %	0 %	0 %	0 %	258406640
42	NC_013224	T	7	7	17451	17457	0 %	100 %	0 %	0 %	258406640
43	NC_013224	T	6	6	17644	17649	0 %	100 %	0 %	0 %	258406640
44	NC_013224	A	6	6	20693	20698	100 %	0 %	0 %	0 %	258406643
45	NC_013224	A	6	6	23001	23006	100 %	0 %	0 %	0 %	258406645
46	NC_013224	A	6	6	23107	23112	100 %	0 %	0 %	0 %	258406645
47	NC_013224	A	7	7	23136	23142	100 %	0 %	0 %	0 %	258406645
48	NC_013224	A	6	6	23383	23388	100 %	0 %	0 %	0 %	258406646
49	NC_013224	A	6	6	23432	23437	100 %	0 %	0 %	0 %	258406646
50	NC_013224	A	6	6	23720	23725	100 %	0 %	0 %	0 %	258406646
51	NC_013224	A	9	9	24071	24079	100 %	0 %	0 %	0 %	258406647
52	NC_013224	T	6	6	24093	24098	0 %	100 %	0 %	0 %	258406647
53	NC_013224	A	6	6	24123	24128	100 %	0 %	0 %	0 %	258406647
54	NC_013224	A	6	6	24133	24138	100 %	0 %	0 %	0 %	258406647
55	NC_013224	A	7	7	24174	24180	100 %	0 %	0 %	0 %	258406647
56	NC_013224	A	7	7	24284	24290	100 %	0 %	0 %	0 %	258406647
57	NC_013224	T	7	7	24537	24543	0 %	100 %	0 %	0 %	258406647
58	NC_013224	A	9	9	25445	25453	100 %	0 %	0 %	0 %	258406648
59	NC_013224	A	6	6	27910	27915	100 %	0 %	0 %	0 %	258406649
60	NC_013224	A	6	6	28133	28138	100 %	0 %	0 %	0 %	258406649
61	NC_013224	A	9	9	28214	28222	100 %	0 %	0 %	0 %	258406649
62	NC_013224	G	6	6	28236	28241	0 %	0 %	100 %	0 %	258406649
63	NC_013224	A	6	6	28327	28332	100 %	0 %	0 %	0 %	258406650
64	NC_013224	A	7	7	30506	30512	100 %	0 %	0 %	0 %	258406651
65	NC_013224	A	7	7	30554	30560	100 %	0 %	0 %	0 %	258406651
66	NC_013224	A	9	9	30593	30601	100 %	0 %	0 %	0 %	258406651
67	NC_013224	T	7	7	31605	31611	0 %	100 %	0 %	0 %	258406652
68	NC_013224	A	6	6	31904	31909	100 %	0 %	0 %	0 %	258406652
69	NC_013224	T	6	6	32902	32907	0 %	100 %	0 %	0 %	258406653
70	NC_013224	A	8	8	32924	32931	100 %	0 %	0 %	0 %	258406653
71	NC_013224	A	7	7	34384	34390	100 %	0 %	0 %	0 %	258406654
72	NC_013224	A	8	8	35925	35932	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
73	NC_013224	A	6	6	36552	36557	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
74	NC_013224	A	6	6	36849	36854	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
75	NC_013224	A	7	7	37315	37321	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
76	NC_013224	A	6	6	37404	37409	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
77	NC_013224	A	7	7	38100	38106	100 %	0 %	0 %	0 %	258406657
78	NC_013224	T	6	6	39005	39010	0 %	100 %	0 %	0 %	258406657
79	NC_013224	T	6	6	40237	40242	0 %	100 %	0 %	0 %	258406658
80	NC_013224	A	6	6	40337	40342	100 %	0 %	0 %	0 %	258406658
81	NC_013224	A	8	8	40356	40363	100 %	0 %	0 %	0 %	258406658
82	NC_013224	A	6	6	40544	40549	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
83	NC_013224	A	7	7	40647	40653	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
84	NC_013224	T	6	6	40782	40787	0 %	100 %	0 %	0 %	258406659
85	NC_013224	A	8	8	40927	40934	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
86	NC_013224	A	6	6	41221	41226	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
87	NC_013224	A	6	6	41667	41672	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
88	NC_013224	A	6	6	41765	41770	100 %	0 %	0 %	0 %	258406659
89	NC_013224	A	7	7	42245	42251	100 %	0 %	0 %	0 %	258406660
90	NC_013224	A	6	6	42279	42284	100 %	0 %	0 %	0 %	258406660
91	NC_013224	T	7	7	42474	42480	0 %	100 %	0 %	0 %	258406661
92	NC_013224	A	7	7	42589	42595	100 %	0 %	0 %	0 %	258406661
93	NC_013224	T	9	9	42705	42713	0 %	100 %	0 %	0 %	258406661
94	NC_013224	A	8	8	43144	43151	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
95	NC_013224	A	6	6	43503	43508	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
96	NC_013224	T	7	7	43579	43585	0 %	100 %	0 %	0 %	258406662
97	NC_013224	A	7	7	43705	43711	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
98	NC_013224	T	7	7	43720	43726	0 %	100 %	0 %	0 %	258406662
99	NC_013224	A	6	6	43878	43883	100 %	0 %	0 %	0 %	258406662
100	NC_013224	A	6	6	43941	43946	100 %	0 %	0 %	0 %	258406663
101	NC_013224	T	7	7	43990	43996	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
102	NC_013224	T	7	7	44028	44034	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
103	NC_013224	T	7	7	44174	44180	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
104	NC_013224	T	6	6	44268	44273	0 %	100 %	0 %	0 %	258406663
105	NC_013224	T	7	7	44283	44289	0 %	100 %	0 %	0 %	258406664

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.