MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 1642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013223	GGTCC	2	10	2997	3006	0 %	20 %	40 %	40 %	258404142
2	NC_013223	ATGGC	2	10	4485	4494	20 %	20 %	40 %	20 %	258404143
3	NC_013223	TGGCC	2	10	4729	4738	0 %	20 %	40 %	40 %	258404143
4	NC_013223	GGATC	2	10	5621	5630	20 %	20 %	40 %	20 %	258404144
5	NC_013223	AAGCG	2	10	7793	7802	40 %	0 %	40 %	20 %	258404145
6	NC_013223	GCGAT	2	10	10025	10034	20 %	20 %	40 %	20 %	258404147
7	NC_013223	CGCGG	2	10	10186	10195	0 %	0 %	60 %	40 %	258404147
8	NC_013223	AGTCC	2	10	10359	10368	20 %	20 %	20 %	40 %	258404147
9	NC_013223	TCTGG	2	10	16558	16567	0 %	40 %	40 %	20 %	258404152
10	NC_013223	CTGTC	2	10	19610	19619	0 %	40 %	20 %	40 %	258404156
11	NC_013223	CTTCG	2	10	20150	20159	0 %	40 %	20 %	40 %	258404156
12	NC_013223	AAGGC	2	10	22778	22787	40 %	0 %	40 %	20 %	258404159
13	NC_013223	GAGTT	2	10	24104	24113	20 %	40 %	40 %	0 %	258404159
14	NC_013223	GTCGC	2	10	24875	24884	0 %	20 %	40 %	40 %	258404160
15	NC_013223	ATCGA	2	10	26025	26034	40 %	20 %	20 %	20 %	258404162
16	NC_013223	GCGGA	2	10	26475	26484	20 %	0 %	60 %	20 %	258404162
17	NC_013223	GACCT	2	10	29596	29605	20 %	20 %	20 %	40 %	258404165
18	NC_013223	AATAA	2	10	35205	35214	80 %	20 %	0 %	0 %	258404170
19	NC_013223	GGCGG	2	10	36042	36051	0 %	0 %	80 %	20 %	258404171
20	NC_013223	GAAAT	2	10	36592	36601	60 %	20 %	20 %	0 %	258404171
21	NC_013223	GCTGG	2	10	36664	36673	0 %	20 %	60 %	20 %	258404171
22	NC_013223	GGTTC	2	10	41186	41195	0 %	40 %	40 %	20 %	258404173
23	NC_013223	GAGCA	2	10	41593	41602	40 %	0 %	40 %	20 %	258404173
24	NC_013223	TGGCC	2	10	41781	41790	0 %	20 %	40 %	40 %	258404173
25	NC_013223	CGGGC	2	10	48650	48659	0 %	0 %	60 %	40 %	258404176
26	NC_013223	GGACC	2	10	50120	50129	20 %	0 %	40 %	40 %	258404177
27	NC_013223	CGTTG	2	10	52467	52476	0 %	40 %	40 %	20 %	258404178
28	NC_013223	CAGGC	2	10	52763	52772	20 %	0 %	40 %	40 %	258404179
29	NC_013223	TGCTG	2	10	53021	53030	0 %	40 %	40 %	20 %	258404179
30	NC_013223	CGGAA	2	10	55941	55950	40 %	0 %	40 %	20 %	258404180
31	NC_013223	GACAA	2	10	56204	56213	60 %	0 %	20 %	20 %	258404180
32	NC_013223	GGCAG	2	10	60774	60783	20 %	0 %	60 %	20 %	258404185
33	NC_013223	TCCAG	2	10	69278	69287	20 %	20 %	20 %	40 %	258404192
34	NC_013223	CGCGG	2	10	69554	69563	0 %	0 %	60 %	40 %	258404192
35	NC_013223	CGAAC	2	10	78384	78393	40 %	0 %	20 %	40 %	258404197
36	NC_013223	ATCGG	2	10	79437	79446	20 %	20 %	40 %	20 %	258404197
37	NC_013223	GCCAG	2	10	87174	87183	20 %	0 %	40 %	40 %	258404205
38	NC_013223	TTCCA	2	10	89924	89933	20 %	40 %	0 %	40 %	258404207
39	NC_013223	GCAGG	2	10	90203	90212	20 %	0 %	60 %	20 %	258404207
40	NC_013223	GTCCA	2	10	90242	90251	20 %	20 %	20 %	40 %	258404207
41	NC_013223	CCAAG	2	10	94446	94455	40 %	0 %	20 %	40 %	258404211
42	NC_013223	CGTCC	2	10	95956	95965	0 %	20 %	20 %	60 %	258404212
43	NC_013223	CTGAC	2	10	100746	100755	20 %	20 %	20 %	40 %	258404214
44	NC_013223	ATATT	2	10	102221	102230	40 %	60 %	0 %	0 %	258404215
45	NC_013223	GGCAG	2	10	103943	103952	20 %	0 %	60 %	20 %	258404216
46	NC_013223	CGGCC	2	10	104464	104473	0 %	0 %	40 %	60 %	258404216
47	NC_013223	TCCGC	2	10	104493	104502	0 %	20 %	20 %	60 %	258404216
48	NC_013223	CAGGA	2	10	104972	104981	40 %	0 %	40 %	20 %	258404216
49	NC_013223	AACGG	2	10	106392	106401	40 %	0 %	40 %	20 %	258404217
50	NC_013223	GCCTG	2	10	107082	107091	0 %	20 %	40 %	40 %	258404218
51	NC_013223	CGGCC	2	10	107828	107837	0 %	0 %	40 %	60 %	258404219
52	NC_013223	GCCCT	2	10	108105	108114	0 %	20 %	20 %	60 %	258404219
53	NC_013223	CGGTT	2	10	108252	108261	0 %	40 %	40 %	20 %	258404219
54	NC_013223	CTTGC	2	10	108525	108534	0 %	40 %	20 %	40 %	258404219
55	NC_013223	GGGCC	2	10	109046	109055	0 %	0 %	60 %	40 %	258404219
56	NC_013223	AGGTG	2	10	110528	110537	20 %	20 %	60 %	0 %	258404220
57	NC_013223	GGACG	2	10	110649	110658	20 %	0 %	60 %	20 %	258404220
58	NC_013223	CGAGG	2	10	113367	113376	20 %	0 %	60 %	20 %	258404221
59	NC_013223	CCGGG	2	10	113397	113406	0 %	0 %	60 %	40 %	258404221
60	NC_013223	ATCAG	2	10	114767	114776	40 %	20 %	20 %	20 %	258404222
61	NC_013223	TGGTG	2	10	115932	115941	0 %	40 %	60 %	0 %	258404223
62	NC_013223	CCGGT	2	10	117506	117515	0 %	20 %	40 %	40 %	258404224
63	NC_013223	CGGCA	2	10	129719	129728	20 %	0 %	40 %	40 %	258404235
64	NC_013223	AGCGC	2	10	130801	130810	20 %	0 %	40 %	40 %	258404235
65	NC_013223	TGATC	2	10	132894	132903	20 %	40 %	20 %	20 %	258404236
66	NC_013223	TCCGG	2	10	134657	134666	0 %	20 %	40 %	40 %	258404237
67	NC_013223	TTCCG	2	10	135532	135541	0 %	40 %	20 %	40 %	258404238
68	NC_013223	TCTTT	2	10	136784	136793	0 %	80 %	0 %	20 %	258404239
69	NC_013223	TCAGT	2	10	136868	136877	20 %	40 %	20 %	20 %	258404239
70	NC_013223	GGGCA	2	10	137526	137535	20 %	0 %	60 %	20 %	258404240
71	NC_013223	TCCAG	2	10	137639	137648	20 %	20 %	20 %	40 %	258404240
72	NC_013223	ATCCA	2	10	139599	139608	40 %	20 %	0 %	40 %	258404242
73	NC_013223	TGTAA	2	10	139615	139624	40 %	40 %	20 %	0 %	258404242
74	NC_013223	ACCGC	2	10	140525	140534	20 %	0 %	20 %	60 %	258404243
75	NC_013223	GCCGG	2	10	147221	147230	0 %	0 %	60 %	40 %	258404247
76	NC_013223	AAACC	2	10	151763	151772	60 %	0 %	0 %	40 %	258404251
77	NC_013223	GGACC	2	10	156197	156206	20 %	0 %	40 %	40 %	258404255
78	NC_013223	CTGCC	2	10	156483	156492	0 %	20 %	20 %	60 %	258404255
79	NC_013223	GCGTG	2	10	157513	157522	0 %	20 %	60 %	20 %	258404256
80	NC_013223	GCTGC	2	10	162177	162186	0 %	20 %	40 %	40 %	258404260
81	NC_013223	CTGGA	2	10	164637	164646	20 %	20 %	40 %	20 %	258404263
82	NC_013223	GGCCG	2	10	164807	164816	0 %	0 %	60 %	40 %	258404263
83	NC_013223	GCCCA	2	10	168324	168333	20 %	0 %	20 %	60 %	258404266
84	NC_013223	TGGAT	2	10	168448	168457	20 %	40 %	40 %	0 %	258404266
85	NC_013223	GCTTG	2	10	170010	170019	0 %	40 %	40 %	20 %	258404267
86	NC_013223	GGCGA	2	10	170155	170164	20 %	0 %	60 %	20 %	258404267
87	NC_013223	AGAGC	2	10	177976	177985	40 %	0 %	40 %	20 %	258404274
88	NC_013223	CGGCC	2	10	178165	178174	0 %	0 %	40 %	60 %	258404274
89	NC_013223	GGCTC	2	10	178896	178905	0 %	20 %	40 %	40 %	258404275
90	NC_013223	CTGGC	2	10	181423	181432	0 %	20 %	40 %	40 %	258404278
91	NC_013223	GTGGG	2	10	182287	182296	0 %	20 %	80 %	0 %	258404279
92	NC_013223	TGGAT	2	10	189072	189081	20 %	40 %	40 %	0 %	258404283
93	NC_013223	CCGGC	2	10	190037	190046	0 %	0 %	40 %	60 %	258404284
94	NC_013223	GACTG	2	10	190289	190298	20 %	20 %	40 %	20 %	258404284
95	NC_013223	TGGTC	2	10	193500	193509	0 %	40 %	40 %	20 %	258404286
96	NC_013223	GCCCT	2	10	194030	194039	0 %	20 %	20 %	60 %	258404287
97	NC_013223	GGCCC	2	10	194077	194086	0 %	0 %	40 %	60 %	258404287
98	NC_013223	CGAAA	2	10	196187	196196	60 %	0 %	20 %	20 %	258404290
99	NC_013223	TGTGG	2	10	197847	197856	0 %	40 %	60 %	0 %	258404291
100	NC_013223	TGGGC	2	10	198196	198205	0 %	20 %	60 %	20 %	258404291
101	NC_013223	CCTTC	2	10	198337	198346	0 %	40 %	0 %	60 %	258404292
102	NC_013223	CGCGG	2	10	199853	199862	0 %	0 %	60 %	40 %	258404294
103	NC_013223	TCCAA	2	10	200567	200576	40 %	20 %	0 %	40 %	258404295
104	NC_013223	TGCTG	2	10	202210	202219	0 %	40 %	40 %	20 %	258404296
105	NC_013223	TGGGA	2	10	205963	205972	20 %	20 %	60 %	0 %	258404301
106	NC_013223	GGCGA	2	10	206135	206144	20 %	0 %	60 %	20 %	258404301
107	NC_013223	TCCGC	2	10	206217	206226	0 %	20 %	20 %	60 %	258404301
108	NC_013223	GGTCA	2	10	206306	206315	20 %	20 %	40 %	20 %	258404301
109	NC_013223	TTCAA	2	10	210153	210162	40 %	40 %	0 %	20 %	258404305
110	NC_013223	GCCAC	2	10	211306	211315	20 %	0 %	20 %	60 %	258404305
111	NC_013223	AAGCG	2	10	212200	212209	40 %	0 %	40 %	20 %	258404306
112	NC_013223	TGGTC	2	10	212701	212710	0 %	40 %	40 %	20 %	258404306
113	NC_013223	ATCGG	2	10	213368	213377	20 %	20 %	40 %	20 %	258404307
114	NC_013223	TCCGG	2	10	214085	214094	0 %	20 %	40 %	40 %	258404308
115	NC_013223	GTCTG	2	10	214614	214623	0 %	40 %	40 %	20 %	258404308
116	NC_013223	GATCA	2	10	214627	214636	40 %	20 %	20 %	20 %	258404308
117	NC_013223	GCGAG	2	10	215228	215237	20 %	0 %	60 %	20 %	258404309
118	NC_013223	CAGGC	2	10	216520	216529	20 %	0 %	40 %	40 %	258404309
119	NC_013223	CGTTT	2	10	219026	219035	0 %	60 %	20 %	20 %	258404310
120	NC_013223	GTGTG	2	10	220425	220434	0 %	40 %	60 %	0 %	258404312
121	NC_013223	CGCCC	2	10	224332	224341	0 %	0 %	20 %	80 %	258404314
122	NC_013223	AGGTC	2	10	227408	227417	20 %	20 %	40 %	20 %	258404317
123	NC_013223	ATTGG	2	10	228914	228923	20 %	40 %	40 %	0 %	258404318
124	NC_013223	TGCGG	2	10	229252	229261	0 %	20 %	60 %	20 %	258404318
125	NC_013223	TGGAC	2	10	230113	230122	20 %	20 %	40 %	20 %	258404318
126	NC_013223	TGGCC	2	10	231400	231409	0 %	20 %	40 %	40 %	258404319
127	NC_013223	GTGGG	2	10	231487	231496	0 %	20 %	80 %	0 %	258404319
128	NC_013223	TTGCT	2	10	231682	231691	0 %	60 %	20 %	20 %	258404319
129	NC_013223	CCTGG	2	10	233371	233380	0 %	20 %	40 %	40 %	258404321
130	NC_013223	GCATG	2	10	233689	233698	20 %	20 %	40 %	20 %	258404321
131	NC_013223	CTGGA	2	10	234495	234504	20 %	20 %	40 %	20 %	258404322
132	NC_013223	ATGAA	2	10	234859	234868	60 %	20 %	20 %	0 %	258404322
133	NC_013223	TCTGG	2	10	237417	237426	0 %	40 %	40 %	20 %	258404324
134	NC_013223	GCGGA	2	10	237799	237808	20 %	0 %	60 %	20 %	258404324
135	NC_013223	TTGAG	2	10	240874	240883	20 %	40 %	40 %	0 %	258404326
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141	NC_013223	CGCGG	2	10	250813	250822	0 %	0 %	60 %	40 %	258404337
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167	NC_013223	GCCGG	2	10	301431	301440	0 %	0 %	60 %	40 %	258404377
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247	NC_013223	CTTTT	2	10	469111	469120	0 %	80 %	0 %	20 %	258404519
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249	NC_013223	CGTTA	2	10	473910	473919	20 %	40 %	20 %	20 %	258404522
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251	NC_013223	AAAAT	2	10	474603	474612	80 %	20 %	0 %	0 %	258404522
252	NC_013223	CAGTT	2	10	477158	477167	20 %	40 %	20 %	20 %	258404524
253	NC_013223	CCAGG	2	10	479387	479396	20 %	0 %	40 %	40 %	258404527
254	NC_013223	GTGCA	2	10	480730	480739	20 %	20 %	40 %	20 %	258404528
255	NC_013223	AGGCC	2	10	482075	482084	20 %	0 %	40 %	40 %	258404529
256	NC_013223	GCCCC	2	10	490260	490269	0 %	0 %	20 %	80 %	258404535
257	NC_013223	GGGCC	2	10	494025	494034	0 %	0 %	60 %	40 %	258404538
258	NC_013223	CAGTA	2	10	496373	496382	40 %	20 %	20 %	20 %	258404539
259	NC_013223	GCGCT	2	10	497053	497062	0 %	20 %	40 %	40 %	258404540
260	NC_013223	GCGGG	2	10	497532	497541	0 %	0 %	80 %	20 %	258404541
261	NC_013223	ATCCC	2	10	500156	500165	20 %	20 %	0 %	60 %	258404542
262	NC_013223	CGGAC	2	10	500751	500760	20 %	0 %	40 %	40 %	258404542
263	NC_013223	CTGCG	2	10	501585	501594	0 %	20 %	40 %	40 %	258404542
264	NC_013223	GGGCA	2	10	501673	501682	20 %	0 %	60 %	20 %	258404542
265	NC_013223	CGGAC	2	10	504354	504363	20 %	0 %	40 %	40 %	258404545
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270	NC_013223	GCCCA	2	10	514114	514123	20 %	0 %	20 %	60 %	258404552
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380	NC_013223	CCAAC	2	10	709318	709327	40 %	0 %	0 %	60 %	258404720
381	NC_013223	CGTGG	2	10	713121	713130	0 %	20 %	60 %	20 %	258404723
382	NC_013223	CGGGG	2	10	713409	713418	0 %	0 %	80 %	20 %	258404723
383	NC_013223	GTCTT	2	10	714650	714659	0 %	60 %	20 %	20 %	258404725
384	NC_013223	CCGGT	2	10	715600	715609	0 %	20 %	40 %	40 %	258404726
385	NC_013223	TTACC	2	10	716314	716323	20 %	40 %	0 %	40 %	258404727
386	NC_013223	GTGGC	2	10	717656	717665	0 %	20 %	60 %	20 %	258404728
387	NC_013223	GTTGG	2	10	719901	719910	0 %	40 %	60 %	0 %	258404731
388	NC_013223	CGAAT	2	10	722912	722921	40 %	20 %	20 %	20 %	258404735
389	NC_013223	AGGAC	2	10	726574	726583	40 %	0 %	40 %	20 %	258404739
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