MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 30450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013223	GAG	3	9	169	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404139
2	NC_013223	TCC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404139
3	NC_013223	TGG	2	6	266	271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404139
4	NC_013223	GAT	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404140
5	NC_013223	ATT	2	6	724	729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404140
6	NC_013223	GGC	2	6	783	788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404140
7	NC_013223	GCC	2	6	796	801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404140
8	NC_013223	TCT	2	6	905	910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404140
9	NC_013223	TTG	2	6	986	991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404140
10	NC_013223	CTT	2	6	1144	1149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404140
11	NC_013223	TAC	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404140
12	NC_013223	CGC	2	6	1276	1281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404140
13	NC_013223	ACC	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404140
14	NC_013223	CGG	2	6	1465	1470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404140
15	NC_013223	GCC	2	6	1806	1811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404141
16	NC_013223	TCG	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404141
17	NC_013223	GGC	2	6	2086	2091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404141
18	NC_013223	CGT	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404141
19	NC_013223	GCT	2	6	2712	2717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404142
20	NC_013223	CAG	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404142
21	NC_013223	ACC	2	6	2770	2775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404142
22	NC_013223	CAA	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404142
23	NC_013223	GAA	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404142
24	NC_013223	CGG	2	6	2947	2952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404142
25	NC_013223	GAA	2	6	3076	3081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404142
26	NC_013223	GCC	2	6	3274	3279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404142
27	NC_013223	CGG	2	6	3387	3392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404142
28	NC_013223	GCA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404142
29	NC_013223	GCA	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404142
30	NC_013223	GGA	2	6	3496	3501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404142
31	NC_013223	CTG	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404142
32	NC_013223	CAG	2	6	3839	3844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404143
33	NC_013223	GAG	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404143
34	NC_013223	CGG	2	6	3916	3921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404143
35	NC_013223	GCG	2	6	3957	3962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404143
36	NC_013223	GTT	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404143
37	NC_013223	CAG	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404143
38	NC_013223	TGG	2	6	4179	4184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404143
39	NC_013223	GTC	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404143
40	NC_013223	CCG	2	6	4267	4272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404143
41	NC_013223	CAC	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404143
42	NC_013223	TTA	2	6	4350	4355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404143
43	NC_013223	GGA	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404143
44	NC_013223	CTG	2	6	4436	4441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404143
45	NC_013223	GGT	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404143
46	NC_013223	GCG	2	6	5039	5044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404144
47	NC_013223	TGA	2	6	5095	5100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404144
48	NC_013223	GGC	2	6	5126	5131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404144
49	NC_013223	GAA	2	6	5163	5168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404144
50	NC_013223	GGT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404144
51	NC_013223	GGC	2	6	5343	5348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404144
52	NC_013223	AAC	2	6	5439	5444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404144
53	NC_013223	CGC	2	6	5518	5523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404144
54	NC_013223	GGC	2	6	5542	5547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404144
55	NC_013223	TGC	2	6	5698	5703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404144
56	NC_013223	AGG	2	6	5998	6003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404144
57	NC_013223	GTT	2	6	6173	6178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404144
58	NC_013223	GAT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404144
59	NC_013223	GAA	2	6	6570	6575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404144
60	NC_013223	GGC	2	6	6709	6714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404144
61	NC_013223	GGC	2	6	6781	6786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404144
62	NC_013223	GGT	2	6	6827	6832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404144
63	NC_013223	CGG	2	6	6851	6856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404144
64	NC_013223	CCA	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404144
65	NC_013223	GAC	2	6	7241	7246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404145
66	NC_013223	CTG	2	6	7248	7253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404145
67	NC_013223	TGC	2	6	7258	7263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404145
68	NC_013223	GCG	2	6	7349	7354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404145
69	NC_013223	GTC	2	6	7365	7370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404145
70	NC_013223	CGG	2	6	7395	7400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404145
71	NC_013223	GCG	2	6	7522	7527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404145
72	NC_013223	AAC	3	9	7543	7551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404145
73	NC_013223	GGT	2	6	7571	7576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404145
74	NC_013223	CTG	2	6	7644	7649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404145
75	NC_013223	ACC	2	6	7680	7685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404145
76	NC_013223	TGG	2	6	7826	7831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404146
77	NC_013223	TGG	2	6	7924	7929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404146
78	NC_013223	TCC	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404146
79	NC_013223	GCA	2	6	8032	8037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404146
80	NC_013223	GGT	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404146
81	NC_013223	GTT	2	6	8182	8187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404146
82	NC_013223	GCA	2	6	8215	8220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404146
83	NC_013223	GCA	2	6	8227	8232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404146
84	NC_013223	CCG	2	6	8301	8306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404146
85	NC_013223	CGG	2	6	8414	8419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404146
86	NC_013223	TGC	2	6	8433	8438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404146
87	NC_013223	GGT	2	6	8457	8462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404146
88	NC_013223	TCG	2	6	8481	8486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404146
89	NC_013223	GCG	2	6	8487	8492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404146
90	NC_013223	GCT	2	6	8530	8535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404146
91	NC_013223	AGT	2	6	8660	8665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404146
92	NC_013223	AGG	2	6	8679	8684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404146
93	NC_013223	GCA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404147
94	NC_013223	GAA	2	6	8848	8853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404147
95	NC_013223	GGT	2	6	8874	8879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404147
96	NC_013223	CGC	2	6	8883	8888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404147
97	NC_013223	GCG	2	6	8960	8965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404147
98	NC_013223	ATC	2	6	9055	9060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404147
99	NC_013223	TGC	2	6	9158	9163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404147
100	NC_013223	GAA	2	6	9292	9297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404147
101	NC_013223	CGA	2	6	9300	9305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404147
102	NC_013223	CAG	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404147
103	NC_013223	GCC	2	6	9430	9435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404147
104	NC_013223	GCA	2	6	9465	9470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404147
105	NC_013223	CAC	2	6	9500	9505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404147
106	NC_013223	CAG	2	6	9648	9653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404147
107	NC_013223	CGG	2	6	9720	9725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404147
108	NC_013223	CGG	2	6	9731	9736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404147
109	NC_013223	AGG	2	6	9842	9847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404147
110	NC_013223	ATG	2	6	9958	9963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404147
111	NC_013223	GGC	2	6	10078	10083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404147
112	NC_013223	GAA	2	6	10249	10254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404147
113	NC_013223	CGG	2	6	10285	10290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404147
114	NC_013223	CGA	3	9	10428	10436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404147
115	NC_013223	CTT	2	6	10661	10666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404148
116	NC_013223	AGA	2	6	10784	10789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404148
117	NC_013223	GGT	2	6	10901	10906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404148
118	NC_013223	AGG	2	6	11035	11040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404148
119	NC_013223	AAC	2	6	11100	11105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404148
120	NC_013223	ACA	2	6	11237	11242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404148
121	NC_013223	TTC	2	6	11428	11433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404149
122	NC_013223	TCC	2	6	11469	11474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404149
123	NC_013223	GTC	2	6	11834	11839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404149
124	NC_013223	GTG	2	6	11932	11937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404149
125	NC_013223	GGC	2	6	11939	11944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404149
126	NC_013223	TCA	2	6	11958	11963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404149
127	NC_013223	GCC	2	6	12024	12029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404149
128	NC_013223	ATG	2	6	12186	12191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404149
129	NC_013223	CGA	2	6	12403	12408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404149
130	NC_013223	TGC	2	6	12531	12536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404149
131	NC_013223	GCC	2	6	12615	12620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404150
132	NC_013223	GAT	2	6	12621	12626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404150
133	NC_013223	GGC	2	6	12702	12707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404150
134	NC_013223	CAG	2	6	12874	12879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404150
135	NC_013223	CTG	2	6	13027	13032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404150
136	NC_013223	GGC	3	9	13143	13151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404150
137	NC_013223	CCA	2	6	13226	13231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404150
138	NC_013223	CAG	2	6	13238	13243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404150
139	NC_013223	TCC	2	6	13820	13825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404151
140	NC_013223	TAC	2	6	13887	13892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404151
141	NC_013223	TTG	2	6	13908	13913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404151
142	NC_013223	TGA	2	6	13946	13951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404151
143	NC_013223	CCA	2	6	14153	14158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404151
144	NC_013223	TGT	2	6	14218	14223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404151
145	NC_013223	GCC	2	6	14293	14298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404151
146	NC_013223	CGA	2	6	14345	14350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404151
147	NC_013223	CGA	2	6	14357	14362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404151
148	NC_013223	ACC	2	6	14379	14384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404151
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150	NC_013223	ACC	2	6	14458	14463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404151
151	NC_013223	CGG	2	6	14627	14632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404151
152	NC_013223	ATG	2	6	14641	14646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404151
153	NC_013223	CGG	2	6	14663	14668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404151
154	NC_013223	CTG	2	6	14718	14723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404151
155	NC_013223	CGA	3	9	14777	14785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404151
156	NC_013223	CAA	2	6	14891	14896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404151
157	NC_013223	AGC	2	6	14903	14908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404151
158	NC_013223	GAG	2	6	15000	15005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404151
159	NC_013223	CAG	2	6	15024	15029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404151
160	NC_013223	CGC	2	6	15316	15321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404152
161	NC_013223	AGG	2	6	15345	15350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404152
162	NC_013223	CGG	2	6	15388	15393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404152
163	NC_013223	CCG	2	6	15418	15423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404152
164	NC_013223	TCT	2	6	15441	15446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404152
165	NC_013223	TGC	2	6	15486	15491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404152
166	NC_013223	GCC	2	6	15696	15701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404152
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168	NC_013223	TGG	2	6	15720	15725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404152
169	NC_013223	CGG	2	6	15916	15921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404152
170	NC_013223	AGG	2	6	16029	16034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404152
171	NC_013223	TGG	2	6	16059	16064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404152
172	NC_013223	GAG	2	6	16187	16192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404152
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180	NC_013223	CCT	2	6	17453	17458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404153
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249	NC_013223	GCG	2	6	23303	23308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404159
250	NC_013223	CCT	2	6	23313	23318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404159
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252	NC_013223	GCG	2	6	23461	23466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404159
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254	NC_013223	GCC	2	6	23735	23740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404159
255	NC_013223	GGT	2	6	23752	23757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404159
256	NC_013223	TTC	3	9	23776	23784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404159
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258	NC_013223	AAG	2	6	23959	23964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404159
259	NC_013223	GAG	2	6	23986	23991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404159
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262	NC_013223	GAA	2	6	24336	24341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404159
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