MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-030

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013212	CTTTC	2	10	1960	1969	0 %	60 %	0 %	40 %	258513267
2	NC_013212	TGGGG	2	10	3671	3680	0 %	20 %	80 %	0 %	258513270
3	NC_013212	ATCAC	2	10	3700	3709	40 %	20 %	0 %	40 %	258513270
4	NC_013212	CTGTT	2	10	4708	4717	0 %	60 %	20 %	20 %	258513271
5	NC_013212	CCAGA	2	10	5319	5328	40 %	0 %	20 %	40 %	258513271
6	NC_013212	GCCAC	2	10	8216	8225	20 %	0 %	20 %	60 %	258513276
7	NC_013212	GCTGG	2	10	8725	8734	0 %	20 %	60 %	20 %	258513276
8	NC_013212	TGATC	2	10	9254	9263	20 %	40 %	20 %	20 %	258513278
9	NC_013212	CCGAT	2	10	11122	11131	20 %	20 %	20 %	40 %	258513280
10	NC_013212	ATCTC	2	10	13085	13094	20 %	40 %	0 %	40 %	258513282
11	NC_013212	CGGGT	2	10	21937	21946	0 %	20 %	60 %	20 %	258513297
12	NC_013212	TGGAC	2	10	22872	22881	20 %	20 %	40 %	20 %	258513297
13	NC_013212	GGACA	2	10	24761	24770	40 %	0 %	40 %	20 %	258513301
14	NC_013212	GCTGG	2	10	30942	30951	0 %	20 %	60 %	20 %	258513308
15	NC_013212	ACCAA	2	10	31340	31349	60 %	0 %	0 %	40 %	258513310
16	NC_013212	GATCC	2	10	32308	32317	20 %	20 %	20 %	40 %	258513310
17	NC_013212	ACAGC	2	10	33964	33973	40 %	0 %	20 %	40 %	258513311
18	NC_013212	GACTG	2	10	38987	38996	20 %	20 %	40 %	20 %	258513314
19	NC_013212	GGACA	2	10	41831	41840	40 %	0 %	40 %	20 %	258513319
20	NC_013212	TGGGG	2	10	43453	43462	0 %	20 %	80 %	0 %	258513320
21	NC_013212	ATCAC	2	10	43482	43491	40 %	20 %	0 %	40 %	258513320
22	NC_013212	CTGTT	2	10	44490	44499	0 %	60 %	20 %	20 %	258513321
23	NC_013212	CCAGA	2	10	45101	45110	40 %	0 %	20 %	40 %	258513321
24	NC_013212	GTAAG	2	10	45946	45955	40 %	20 %	40 %	0 %	258513321
25	NC_013212	CCAGC	2	10	46582	46591	20 %	0 %	20 %	60 %	258513323

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.