MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-030

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013212	ATGG	2	8	217	224	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013212	TAAT	2	8	446	453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013212	TTGT	2	8	685	692	0 %	75 %	25 %	0 %	258513264
4	NC_013212	AGAA	2	8	889	896	75 %	0 %	25 %	0 %	258513264
5	NC_013212	CCAT	2	8	1089	1096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013212	TGAA	2	8	1399	1406	50 %	25 %	25 %	0 %	258513265
7	NC_013212	GGCG	2	8	1515	1522	0 %	0 %	75 %	25 %	258513266
8	NC_013212	CGAT	2	8	1595	1602	25 %	25 %	25 %	25 %	258513266
9	NC_013212	TTGA	2	8	1848	1855	25 %	50 %	25 %	0 %	258513266
10	NC_013212	GGCA	2	8	1877	1884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013212	GTAA	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	258513268
12	NC_013212	TCTG	2	8	3038	3045	0 %	50 %	25 %	25 %	258513268
13	NC_013212	CTCA	2	8	3269	3276	25 %	25 %	0 %	50 %	258513269
14	NC_013212	GATG	2	8	3378	3385	25 %	25 %	50 %	0 %	258513269
15	NC_013212	GTCC	2	8	4177	4184	0 %	25 %	25 %	50 %	258513271
16	NC_013212	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	258513271
17	NC_013212	ACCC	2	8	4945	4952	25 %	0 %	0 %	75 %	258513271
18	NC_013212	AGAA	2	8	5068	5075	75 %	0 %	25 %	0 %	258513271
19	NC_013212	AACT	2	8	6159	6166	50 %	25 %	0 %	25 %	258513271
20	NC_013212	CAAT	2	8	6727	6734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013212	TGGC	2	8	6952	6959	0 %	25 %	50 %	25 %	258513273
22	NC_013212	AGCG	2	8	7805	7812	25 %	0 %	50 %	25 %	258513275
23	NC_013212	TGAC	2	8	8169	8176	25 %	25 %	25 %	25 %	258513276
24	NC_013212	TCCA	2	8	8342	8349	25 %	25 %	0 %	50 %	258513276
25	NC_013212	CTTC	2	8	8757	8764	0 %	50 %	0 %	50 %	258513277
26	NC_013212	CTGA	2	8	8839	8846	25 %	25 %	25 %	25 %	258513277
27	NC_013212	TGCT	2	8	9217	9224	0 %	50 %	25 %	25 %	258513278
28	NC_013212	TGTC	2	8	10276	10283	0 %	50 %	25 %	25 %	258513279
29	NC_013212	TGAT	2	8	10540	10547	25 %	50 %	25 %	0 %	258513280
30	NC_013212	AATC	2	8	10835	10842	50 %	25 %	0 %	25 %	258513280
31	NC_013212	CTCG	2	8	11087	11094	0 %	25 %	25 %	50 %	258513280
32	NC_013212	GATG	2	8	11472	11479	25 %	25 %	50 %	0 %	258513280
33	NC_013212	AGAA	2	8	11792	11799	75 %	0 %	25 %	0 %	258513280
34	NC_013212	CAGC	2	8	11847	11854	25 %	0 %	25 %	50 %	258513280
35	NC_013212	TCGA	2	8	12399	12406	25 %	25 %	25 %	25 %	258513281
36	NC_013212	TGCC	2	8	12770	12777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013212	AGCG	2	8	13231	13238	25 %	0 %	50 %	25 %	258513282
38	NC_013212	ATTG	2	8	14735	14742	25 %	50 %	25 %	0 %	258513285
39	NC_013212	CATT	2	8	15015	15022	25 %	50 %	0 %	25 %	258513285
40	NC_013212	AGAT	2	8	15586	15593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013212	CGTC	2	8	16292	16299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013212	GCTG	2	8	16574	16581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013212	ACTC	2	8	17141	17148	25 %	25 %	0 %	50 %	258513287
44	NC_013212	GCCG	3	12	17947	17958	0 %	0 %	50 %	50 %	258513289
45	NC_013212	CCAG	2	8	18331	18338	25 %	0 %	25 %	50 %	258513290
46	NC_013212	AGGG	2	8	19143	19150	25 %	0 %	75 %	0 %	258513293
47	NC_013212	TTGC	2	8	19234	19241	0 %	50 %	25 %	25 %	258513293
48	NC_013212	GTGC	2	8	19975	19982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013212	GCCT	2	8	20095	20102	0 %	25 %	25 %	50 %	258513296
50	NC_013212	TCGA	2	8	20198	20205	25 %	25 %	25 %	25 %	258513296
51	NC_013212	AATC	2	8	20402	20409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013212	CCGG	2	8	20534	20541	0 %	0 %	50 %	50 %	258513297
53	NC_013212	GGAC	2	8	20880	20887	25 %	0 %	50 %	25 %	258513297
54	NC_013212	GATC	2	8	21054	21061	25 %	25 %	25 %	25 %	258513297
55	NC_013212	CCGG	2	8	21115	21122	0 %	0 %	50 %	50 %	258513297
56	NC_013212	TCGC	2	8	21439	21446	0 %	25 %	25 %	50 %	258513297
57	NC_013212	TCTG	2	8	21834	21841	0 %	50 %	25 %	25 %	258513297
58	NC_013212	CAGG	2	8	22806	22813	25 %	0 %	50 %	25 %	258513297
59	NC_013212	GCCG	2	8	23034	23041	0 %	0 %	50 %	50 %	258513297
60	NC_013212	GCGG	2	8	23226	23233	0 %	0 %	75 %	25 %	258513297
61	NC_013212	GCGG	2	8	23352	23359	0 %	0 %	75 %	25 %	258513297
62	NC_013212	GATC	2	8	23962	23969	25 %	25 %	25 %	25 %	258513299
63	NC_013212	GGGC	2	8	24179	24186	0 %	0 %	75 %	25 %	258513299
64	NC_013212	CTGT	2	8	24671	24678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013212	GACG	2	8	24775	24782	25 %	0 %	50 %	25 %	258513301
66	NC_013212	GCGG	2	8	25583	25590	0 %	0 %	75 %	25 %	258513301
67	NC_013212	GCCA	2	8	25718	25725	25 %	0 %	25 %	50 %	258513301
68	NC_013212	TCTG	2	8	26058	26065	0 %	50 %	25 %	25 %	258513301
69	NC_013212	CCTT	2	8	26190	26197	0 %	50 %	0 %	50 %	258513302
70	NC_013212	GAAT	2	8	26259	26266	50 %	25 %	25 %	0 %	258513302
71	NC_013212	ACTG	2	8	26316	26323	25 %	25 %	25 %	25 %	258513302
72	NC_013212	GAAC	2	8	27226	27233	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013212	TAAG	2	8	27255	27262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013212	AGAA	2	8	27480	27487	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013212	AGCA	2	8	28629	28636	50 %	0 %	25 %	25 %	258513305
76	NC_013212	GCTG	2	8	29049	29056	0 %	25 %	50 %	25 %	258513306
77	NC_013212	CCCA	2	8	29411	29418	25 %	0 %	0 %	75 %	258513307
78	NC_013212	GGCA	2	8	30017	30024	25 %	0 %	50 %	25 %	258513307
79	NC_013212	TGAC	2	8	30386	30393	25 %	25 %	25 %	25 %	258513308
80	NC_013212	TCCA	2	8	30559	30566	25 %	25 %	0 %	50 %	258513308
81	NC_013212	CTTC	2	8	30974	30981	0 %	50 %	0 %	50 %	258513309
82	NC_013212	CTGA	2	8	31056	31063	25 %	25 %	25 %	25 %	258513309
83	NC_013212	ATCA	2	8	32777	32784	50 %	25 %	0 %	25 %	258513311
84	NC_013212	CTGC	2	8	32875	32882	0 %	25 %	25 %	50 %	258513311
85	NC_013212	CCTT	2	8	33525	33532	0 %	50 %	0 %	50 %	258513311
86	NC_013212	GGAC	2	8	33727	33734	25 %	0 %	50 %	25 %	258513311
87	NC_013212	GTTC	2	8	34324	34331	0 %	50 %	25 %	25 %	258513311
88	NC_013212	CCGA	2	8	34703	34710	25 %	0 %	25 %	50 %	258513312
89	NC_013212	TTGT	2	8	35031	35038	0 %	75 %	25 %	0 %	258513312
90	NC_013212	AGGA	2	8	35054	35061	50 %	0 %	50 %	0 %	258513312
91	NC_013212	TTTC	2	8	35344	35351	0 %	75 %	0 %	25 %	258513312
92	NC_013212	CCGC	2	8	36163	36170	0 %	0 %	25 %	75 %	258513312
93	NC_013212	GCCT	2	8	36320	36327	0 %	25 %	25 %	50 %	258513312
94	NC_013212	GATG	2	8	37126	37133	25 %	25 %	50 %	0 %	258513312
95	NC_013212	TCCG	2	8	37575	37582	0 %	25 %	25 %	50 %	258513313
96	NC_013212	GATG	2	8	37855	37862	25 %	25 %	50 %	0 %	258513313
97	NC_013212	CCCG	2	8	37969	37976	0 %	0 %	25 %	75 %	258513313
98	NC_013212	ATCA	2	8	38288	38295	50 %	25 %	0 %	25 %	258513313
99	NC_013212	TCAG	2	8	38583	38590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013212	GTTT	2	8	39389	39396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013212	ATGA	2	8	39916	39923	50 %	25 %	25 %	0 %	258513315
102	NC_013212	CCAA	2	8	40274	40281	50 %	0 %	0 %	50 %	258513316
103	NC_013212	ACCG	2	8	40628	40635	25 %	0 %	25 %	50 %	258513316
104	NC_013212	CGCT	2	8	40801	40808	0 %	25 %	25 %	50 %	258513317
105	NC_013212	GGCA	2	8	41051	41058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013212	CTGT	2	8	41741	41748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013212	GACG	2	8	41845	41852	25 %	0 %	50 %	25 %	258513319
108	NC_013212	CTTC	2	8	42484	42491	0 %	50 %	0 %	50 %	258513319
109	NC_013212	CGGG	2	8	42654	42661	0 %	0 %	75 %	25 %	258513319
110	NC_013212	CTGC	2	8	42745	42752	0 %	25 %	25 %	50 %	258513319
111	NC_013212	GCCA	2	8	42788	42795	25 %	0 %	25 %	50 %	258513319
112	NC_013212	TCTG	2	8	43128	43135	0 %	50 %	25 %	25 %	258513319
113	NC_013212	AGGA	2	8	43290	43297	50 %	0 %	50 %	0 %	258513320
114	NC_013212	GTCC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	25 %	50 %	258513321
115	NC_013212	GCCA	2	8	44675	44682	25 %	0 %	25 %	50 %	258513321
116	NC_013212	ACCC	2	8	44727	44734	25 %	0 %	0 %	75 %	258513321
117	NC_013212	AGAA	2	8	44850	44857	75 %	0 %	25 %	0 %	258513321
118	NC_013212	CAAT	2	8	46074	46081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013212	GAAG	2	8	46552	46559	50 %	0 %	50 %	0 %	258513322
120	NC_013212	TGGA	2	8	46967	46974	25 %	25 %	50 %	0 %	258513323
121	NC_013212	GTCA	2	8	47140	47147	25 %	25 %	25 %	25 %	258513323
122	NC_013212	TTTC	2	8	48808	48815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013212	CTTA	2	8	49034	49041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013212	GTTC	2	8	49063	49070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.